More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2055 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 		 354 aa  699    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  96.05 
 
 		 354 aa  681    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  96.33 
 
 		 354 aa  681    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  84.18 
 
 		 354 aa  598  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  82.2 
 
 		 354 aa  590  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  73.16 
 
 		 354 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  73.16 
 
 		 354 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  73.45 
 
 		 352 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  73.73 
 
 		 354 aa  533  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  73.45 
 
 		 352 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  73.16 
 
 		 354 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0828  NADH dehydrogenase (quinone)  72.29 
 
 		 357 aa  531  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.508833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  73.45 
 
 		 352 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  72.57 
 
 		 357 aa  532  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  73.65 
 
 		 355 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  73.37 
 
 		 355 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  73.37 
 
 		 355 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  75.22 
 
 		 333 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  73.09 
 
 		 355 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3207  NADH dehydrogenase subunit H  73.73 
 
 		 354 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1350  NADH dehydrogenase subunit H  73.73 
 
 		 354 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0612742  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2266  NADH dehydrogenase subunit H  73.94 
 
 		 355 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.553652  normal  0.191599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1630  NADH dehydrogenase subunit H  73.94 
 
 		 355 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2242  NADH dehydrogenase subunit H  73.94 
 
 		 355 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  67.23 
 
 		 354 aa  510  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1508  NADH dehydrogenase (quinone)  65.44 
 
 		 352 aa  494  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00230102 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2002  NADH dehydrogenase subunit H  71.47 
 
 		 354 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.4994  normal  0.0583966 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3249  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  64.07 
 
 		 359 aa  484  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  0.99493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  65.38 
 
 		 347 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2806  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  63.61 
 
 		 360 aa  468  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3503  NADH dehydrogenase (quinone)  61.11 
 
 		 358 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0964  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  64.52 
 
 		 358 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.890655  normal  0.0815435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1270  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  64.81 
 
 		 358 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577463  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0879  NADH dehydrogenase (quinone)  64.79 
 
 		 358 aa  457  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5173  NADH dehydrogenase (quinone)  60.83 
 
 		 358 aa  448  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1500  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  58.61 
 
 		 360 aa  450  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  60 
 
 		 349 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  62.15 
 
 		 349 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  61.23 
 
 		 344 aa  404  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  60 
 
 		 341 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  60 
 
 		 341 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2824  NADH dehydrogenase subunit H  60.36 
 
 		 364 aa  395  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00869776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0247  NADH dehydrogenase subunit H  58.6 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  55.04 
 
 		 366 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  57.99 
 
 		 352 aa  389  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01294  NADH dehydrogenase subunit H  59.64 
 
 		 363 aa  389  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0276  NADH dehydrogenase subunit H  58.6 
 
 		 363 aa  386  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1149  NADH dehydrogenase I chain H  59.64 
 
 		 343 aa  381  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  57.19 
 
 		 340 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  59.17 
 
 		 339 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  56.57 
 
 		 340 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0824  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  61 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.877991  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  55.59 
 
 		 339 aa  373  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  55.66 
 
 		 340 aa  368  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  55.66 
 
 		 340 aa  368  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1758  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  56.53 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  52.03 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  53.27 
 
 		 337 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  57.18 
 
 		 354 aa  354  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  55.13 
 
 		 338 aa  350  3e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0715  NADH dehydrogenase (quinone)  56.25 
 
 		 354 aa  347  1e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.567288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  49.55 
 
 		 369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  50.3 
 
 		 341 aa  335  5.999999999999999e-91  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1721  NADH dehydrogenase subunit H  51.13 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2581  NADH dehydrogenase subunit H  48.62 
 
 		 341 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.393278  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  50.97 
 
 		 341 aa  331  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2416  NADH dehydrogenase subunit H  51.48 
 
 		 347 aa  330  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792289  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0785  NADH dehydrogenase subunit H  50.65 
 
 		 348 aa  329  4e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.181346  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1880  NADH dehydrogenase subunit H  48.34 
 
 		 356 aa  328  7e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.517536  normal  0.265736 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  48.81 
 
 		 367 aa  328  7e-89  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2213  NADH dehydrogenase subunit H  50.15 
 
 		 356 aa  328  8e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0909649  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1360  NADH dehydrogenase subunit H  48.33 
 
 		 347 aa  328  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0549439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3219  NADH dehydrogenase subunit H  50.65 
 
 		 337 aa  328  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0804  NADH dehydrogenase subunit H  51.48 
 
 		 347 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0809  NADH dehydrogenase subunit H  51.48 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.519776  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1268  NADH dehydrogenase subunit H  49.51 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.279404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0897  NADH dehydrogenase subunit H  49.84 
 
 		 347 aa  325  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1029  NADH dehydrogenase subunit H  49.24 
 
 		 347 aa  324  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182867  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4626  NADH dehydrogenase subunit H  48.39 
 
 		 339 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0842951 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2878  NADH dehydrogenase subunit H  48.32 
 
 		 341 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.171106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4133  NADH dehydrogenase subunit H  49.35 
 
 		 340 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2391  NADH dehydrogenase subunit H  47.24 
 
 		 342 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.0000491536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1302  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.79 
 
 		 347 aa  316  3e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656687  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4554  NADH dehydrogenase subunit H  46.09 
 
 		 356 aa  315  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1012  NADH dehydrogenase subunit H  47.81 
 
 		 340 aa  315  9e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1207  NADH dehydrogenase subunit H  47.81 
 
 		 340 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2925  NADH dehydrogenase subunit H  49.83 
 
 		 342 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2293  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.25 
 
 		 347 aa  315  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1078  NADH dehydrogenase subunit H  47.81 
 
 		 340 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.425523 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4397  NADH dehydrogenase subunit H  48.21 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0054  NADH dehydrogenase I, H subunit  45.78 
 
 		 336 aa  311  1e-83  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2052  NADH dehydrogenase subunit H  46.11 
 
 		 340 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  51.92 
 
 		 322 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3291  NADH dehydrogenase subunit H  47.09 
 
 		 341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.347185  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  46.71 
 
 		 349 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2411  NADH dehydrogenase subunit H  48.67 
 
 		 341 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  46.57 
 
 		 349 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  47.52 
 
 		 341 aa  301  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  48.79 
 
 		 348 aa  298  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.26 
 
 		 337 aa  296  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>