31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1942 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1942  hypothetical protein  100 
 
 		 746 aa  1563    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.382764 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0960  hypothetical protein  84.34 
 
 		 746 aa  1267    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.721372  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03018  hypothetical protein  84.49 
 
 		 753 aa  1284    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.426915 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3219  putative transmembrane protein  32.5 
 
 		 731 aa  174  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404503 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5511  hypothetical protein  32.11 
 
 		 783 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.333676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3370  putative transmembrane protein  32.18 
 
 		 770 aa  157  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5208  putative transmembrane protein  31.93 
 
 		 770 aa  156  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.764838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1687  putative ribonuclease G and E  30.21 
 
 		 740 aa  145  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696506  normal  0.229543 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3648  hypothetical protein  29.3 
 
 		 805 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3324  hypothetical protein  29.37 
 
 		 797 aa  138  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03200  hypothetical protein  31.55 
 
 		 716 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00162132  hitchhiker  0.00000000000240943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2743  hypothetical protein  30.52 
 
 		 674 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.762938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1250  hypothetical protein  31.17 
 
 		 716 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03643  hypothetical protein  29.03 
 
 		 714 aa  130  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1929  putative ribonuclease G and E  28.7 
 
 		 774 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384162  normal  0.037347 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02463  hypothetical protein  28.95 
 
 		 715 aa  128  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2253  hypothetical protein  28.48 
 
 		 774 aa  127  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4519  hypothetical protein  29.67 
 
 		 729 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0090  hypothetical protein  29.18 
 
 		 728 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3226  hypothetical protein  29.31 
 
 		 728 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1614  hypothetical protein  28.33 
 
 		 746 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4081  hypothetical protein  29.11 
 
 		 680 aa  112  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0101  Type V secretory pathway, adhesin AidA  27.21 
 
 		 746 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0128  hypothetical protein  27.12 
 
 		 746 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0205  hypothetical protein  27.12 
 
 		 728 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0144673  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1584  hypothetical protein  27.36 
 
 		 728 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287315  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00395  hypothetical protein  61.18 
 
 		 455 aa  108  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0399379  normal  0.95262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5055  hypothetical protein  26.93 
 
 		 674 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05223  hypothetical protein  58.06 
 
 		 347 aa  103  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03639  hypothetical protein  29.09 
 
 		 733 aa  102  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02459  hypothetical protein  28.73 
 
 		 734 aa  99.8  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>