152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1851 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  100 
 
 		 155 aa  313  7e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  58.67 
 
 		 157 aa  184  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  70.83 
 
 		 120 aa  176  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  48.98 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 179 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 167 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1721  transcriptional regulator, MarR family  50.31 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  49.69 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 180 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  43.92 
 
 		 157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1105  MarR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 143 aa  110  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 151 aa  98.2  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  39.16 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0570  transcriptional regulator, MarR family  36.24 
 
 		 182 aa  88.6  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  38.35 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 148 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  37.24 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  39.55 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  44.55 
 
 		 147 aa  85.5  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2725  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1560  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  35.9 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1036  MarR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 85 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0755699  normal  0.33215 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  25.86 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  34.04 
 
 		 283 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  30.69 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  27.27 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3485  transcriptional repressor MprA  27.97 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1137  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3223  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  32.26 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0862  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.529832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7675  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 186 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  35.09 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 		 142 aa  47.4  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  27.52 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  27.59 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  24.14 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0283  hypothetical protein  22.12 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000125013  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3423  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118628 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 203 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2926  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 		 301 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  30.26 
 
 		 194 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  24.64 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0187  transcriptional regulator, MarR family  38.33 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.713112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  30.26 
 
 		 194 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 194 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  29.17 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 174 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 145 aa  44.3  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 163 aa  44.3  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  24.64 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3505  transcriptional regulator  24.78 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.54422 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  34.67 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  23.02 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>