34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1850 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1850  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  332  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0857051 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4359  antibiotic biosynthesis monooxygenase  75.68 
 
 		 122 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189574  unclonable  0.00000450981 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5360  antibiotic biosynthesis monooxygenase  74.77 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000102648  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4927  antibiotic biosynthesis monooxygenase  74.77 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111834  normal  0.0525996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3440  antibiotic biosynthesis monooxygenase  74.77 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000008426  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0764  antibiotic biosynthesis monooxygenase  76.64 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00475722  hitchhiker  0.0000687435 
 
 
 
NC_010552  BamMC406_4876  antibiotic biosynthesis monooxygenase  74.77 
 
 		 122 aa  174  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000210055  hitchhiker  0.00000000162299 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3056  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.78 
 
 		 145 aa  140  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.708736  normal  0.018252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1169  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.42 
 
 		 125 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.694695  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2213  antibiotic biosynthesis monooxygenase  60.87 
 
 		 123 aa  117  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.739049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5372  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.43 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3088  cytochrome B561  55 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76146  normal  0.0516175 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3150  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.13 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2800  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.66 
 
 		 269 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000207349  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3570  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3305  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 		 120 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.934506  hitchhiker  0.000279112 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2121  cytochrome B561  51.61 
 
 		 181 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0436144  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2139  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.72 
 
 		 111 aa  44.3  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0769988  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  55 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5024  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.41 
 
 		 108 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  43.28 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  55 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2488  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.61 
 
 		 102 aa  43.9  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2896  cytochrome B561  55 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.950416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2389  cytochrome B561  55 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  58.82 
 
 		 180 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1610  cytochrome B561  58.54 
 
 		 176 aa  42  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1444  cytochrome B561  52.78 
 
 		 183 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296577  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32820  predicted protein  29.37 
 
 		 274 aa  41.6  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  51.28 
 
 		 178 aa  41.2  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0385  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 		 110 aa  41.2  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531234  normal  0.0179673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3375  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.21 
 
 		 118 aa  40.8  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0699876  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4190  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.26 
 
 		 111 aa  40.8  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269641  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 758 aa  40.8  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>