14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1705 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1705  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  806    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00646278  normal  0.0869394 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0554  hypothetical protein  43.71 
 
 		 340 aa  319  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0136677  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2540  ATP-binding region, ATPase-like  43.19 
 
 		 342 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00366162  hitchhiker  0.0000000000468355 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1511  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.56 
 
 		 328 aa  121  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189889 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0033  hypothetical protein  22.36 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0033  hypothetical protein  21.52 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0031  hypothetical protein  28.21 
 
 		 269 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.770133 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3007  hypothetical protein  22.05 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  0.102422 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3121  hypothetical protein  30.81 
 
 		 436 aa  55.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.673952 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1500  ATP-binding region, ATPase-like protein  26.28 
 
 		 291 aa  55.5  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1761  hypothetical protein  25.63 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2373  hypothetical protein  25.63 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03060  histidine kinase  22.57 
 
 		 330 aa  49.3  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00100507  hitchhiker  2.5063000000000002e-30 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1139  hypothetical protein  26.05 
 
 		 244 aa  47  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>