59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1698 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  100 
 
 		 1051 aa  2131    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  45.85 
 
 		 1341 aa  816    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  44.29 
 
 		 1816 aa  819    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  45.15 
 
 		 2007 aa  810    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  48.04 
 
 		 1194 aa  820    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  41.78 
 
 		 1057 aa  664    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  49.11 
 
 		 1133 aa  1061    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  55.75 
 
 		 1092 aa  1182    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  55.47 
 
 		 1101 aa  1184    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  49.59 
 
 		 1219 aa  852    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  46.42 
 
 		 1067 aa  936    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  55.01 
 
 		 1100 aa  1199    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  43.97 
 
 		 1061 aa  892    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  46.83 
 
 		 1188 aa  783    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  49.94 
 
 		 1221 aa  857    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  40.38 
 
 		 1103 aa  555  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  34.95 
 
 		 1543 aa  548  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  35.38 
 
 		 1159 aa  536  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  35.32 
 
 		 1159 aa  531  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  34.86 
 
 		 1158 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  34.86 
 
 		 1158 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  39.75 
 
 		 3238 aa  512  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  39 
 
 		 3006 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  34.72 
 
 		 1157 aa  504  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  39.47 
 
 		 3521 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  39.19 
 
 		 3286 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  38.43 
 
 		 2140 aa  501  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  34.69 
 
 		 1157 aa  502  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  34.75 
 
 		 1157 aa  500  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  38.62 
 
 		 2899 aa  497  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  38.43 
 
 		 2900 aa  492  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  34.06 
 
 		 1159 aa  489  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  33.96 
 
 		 1137 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  33.86 
 
 		 1159 aa  488  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  33.89 
 
 		 1132 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  33.89 
 
 		 1132 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  33.66 
 
 		 1132 aa  485  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  33.13 
 
 		 1120 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  31.7 
 
 		 1059 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  32.84 
 
 		 1120 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  33.53 
 
 		 1116 aa  475  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  33.17 
 
 		 1116 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  34.94 
 
 		 1012 aa  441  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  42.03 
 
 		 522 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  32.42 
 
 		 881 aa  324  6e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  29.07 
 
 		 837 aa  230  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  42.21 
 
 		 951 aa  229  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  26.6 
 
 		 960 aa  178  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  45.83 
 
 		 1093 aa  157  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  45.83 
 
 		 1093 aa  156  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3094  hypothetical protein  32.37 
 
 		 348 aa  151  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  41.13 
 
 		 1830 aa  105  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  23.67 
 
 		 1644 aa  75.5  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  30.56 
 
 		 2400 aa  75.1  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1639  Phage-related protein tail component-like protein  21.86 
 
 		 918 aa  74.7  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3503  hypothetical protein  23.32 
 
 		 404 aa  55.1  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2375  hypothetical protein  29.29 
 
 		 643 aa  49.7  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00246528  unclonable  0.0000000374805 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1446  fibronectin, type III domain-containing protein  27.89 
 
 		 1089 aa  45.4  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  34.31 
 
 		 2286 aa  45.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>