More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1611 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1611  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  490  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0746419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1607  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  91.7 
 
 		 241 aa  454  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1935  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  91.29 
 
 		 241 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0152527 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1310  hypothetical protein  83.82 
 
 		 241 aa  418  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1206  hypothetical protein  82.16 
 
 		 241 aa  411  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.546437  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2148  hypothetical protein  79.58 
 
 		 240 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1464  hypothetical protein  79.67 
 
 		 240 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270606  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2041  hypothetical protein  79.58 
 
 		 240 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1713  hypothetical protein  78.33 
 
 		 240 aa  384  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1494  hypothetical protein  78.33 
 
 		 240 aa  384  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2738  Fe-S oxidoreductase  78.33 
 
 		 240 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2222  hypothetical protein  78.33 
 
 		 263 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5437  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  77.92 
 
 		 240 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2604  hypothetical protein  78.33 
 
 		 240 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186656  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3098  hypothetical protein  78.33 
 
 		 240 aa  384  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1547  hypothetical protein  78.75 
 
 		 240 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198081  normal  0.0351499 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2660  hypothetical protein  78.33 
 
 		 240 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2585  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  78.33 
 
 		 240 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00208948 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5946  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  78.75 
 
 		 240 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860628  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2168  hypothetical protein  79.17 
 
 		 240 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2131  hypothetical protein  78.75 
 
 		 240 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198327  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1139  hypothetical protein  78.39 
 
 		 236 aa  377  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1870  hypothetical protein  77.92 
 
 		 240 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214075  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1769  hypothetical protein  59.24 
 
 		 266 aa  293  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0772008 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0367  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  57.56 
 
 		 259 aa  290  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0669  hypothetical protein  61.51 
 
 		 243 aa  285  5.999999999999999e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0954341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0140  hypothetical protein  56.3 
 
 		 263 aa  270  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3164  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  55.04 
 
 		 256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2182  hypothetical protein  56.67 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1431  hypothetical protein  56.67 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.667811  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0458  hypothetical protein  56.67 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1873  hypothetical protein  56.67 
 
 		 289 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2080  hypothetical protein  56.67 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945675  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0867  hypothetical protein  56.67 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.258503  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0555  Fe-S oxidoreductase  56.67 
 
 		 268 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1690  glycolate oxidase-like protein  50.42 
 
 		 274 aa  255  5e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3606  hypothetical protein  52.5 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0560  hypothetical protein  57.14 
 
 		 265 aa  249  4e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2926  hypothetical protein  53.56 
 
 		 256 aa  248  8e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0345775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3589  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  54.2 
 
 		 265 aa  245  6e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2429  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  53.56 
 
 		 248 aa  240  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267816 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2282  hypothetical protein  54.77 
 
 		 260 aa  239  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.293484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1216  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  48.54 
 
 		 244 aa  234  7e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770234  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2958  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  44.12 
 
 		 242 aa  229  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3263  hypothetical protein  43.7 
 
 		 242 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3037  hypothetical protein  43.28 
 
 		 242 aa  228  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3270  hypothetical protein  43.28 
 
 		 242 aa  228  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.96 
 
 		 239 aa  228  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.625319 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0079  hypothetical protein  48.52 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.376514  unclonable  0.0000154463 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0717  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  47.9 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1024  hypothetical protein  44.3 
 
 		 239 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1274  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.84 
 
 		 239 aa  222  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0392  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.99 
 
 		 238 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3990  hypothetical protein  43.04 
 
 		 239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1218  hypothetical protein  43.46 
 
 		 239 aa  218  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1354  hypothetical protein  43.04 
 
 		 239 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1392  hypothetical protein  43.04 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1416  hypothetical protein  43.04 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1216  hypothetical protein  43.04 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0407054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1194  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  43.04 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1196  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  43.04 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0498426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1315  hypothetical protein  43.04 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1456  hypothetical protein  43.04 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2995  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  47.28 
 
 		 246 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.75 
 
 		 245 aa  210  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2722  hypothetical protein  41.63 
 
 		 242 aa  207  9e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.451695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.7 
 
 		 270 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128565  normal  0.0827191 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1437  oxidoreductase  42.68 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147364  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2718  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.57 
 
 		 247 aa  201  8e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4458  hypothetical protein  44.3 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3259  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.35 
 
 		 240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0810  hypothetical protein  44.73 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0233285 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1375  hypothetical protein  43.22 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267748  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1096  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.25 
 
 		 249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.757675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3038  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.03 
 
 		 246 aa  195  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3243  hypothetical protein  45.19 
 
 		 234 aa  195  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.496148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0397  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.95 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0752  hypothetical protein  44.49 
 
 		 274 aa  192  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5378  hypothetical protein  44.3 
 
 		 264 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.860708 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0201  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich protein  45.18 
 
 		 267 aa  192  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0818  hypothetical protein  42.6 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.212327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37080  Fe-S oxidoreductase  42.19 
 
 		 243 aa  190  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.151092  normal  0.0205493 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43080  hypothetical protein  43.35 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2452  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  43.03 
 
 		 247 aa  189  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.345477  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12950  Fe-S oxidoreductase  41.22 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0443672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0967  hypothetical protein  39.17 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1413  hypothetical protein  43.4 
 
 		 249 aa  188  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.170159  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1896  Fe-S oxidoreductase  40.34 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.138109  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05530  Fe-S oxidoreductase  39.34 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1715  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.13 
 
 		 277 aa  184  7e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4689  hypothetical protein  42.26 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5448  hypothetical protein  43.15 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3563  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.98 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0102494  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0364  hypothetical protein  41.28 
 
 		 275 aa  182  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.228325  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1462  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.18 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0836578  normal  0.704766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3704  hypothetical protein  40.91 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1766  hypothetical protein  43.17 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1034  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.74 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.92586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3730  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.15 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542099  normal  0.363647 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1421  cysteine-rich domain-containing protein  39.66 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>