More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1528 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1528  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 
447 aa  906    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.226614  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2860  phosphoglucosamine mutase  70.09 
 
 
452 aa  644    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321505  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0573  phosphoglucosamine mutase  71.05 
 
 
467 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0791443  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0779  phosphoglucosamine mutase  71.05 
 
 
452 aa  642    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2168  phosphoglucosamine mutase  79.64 
 
 
447 aa  724    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1617  phosphoglucosamine mutase  71.05 
 
 
452 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4441  phosphoglucosamine mutase  73.36 
 
 
451 aa  664    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1188  phosphoglucosamine mutase  72.46 
 
 
451 aa  651    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.282955 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2774  phosphoglucosamine mutase  71.27 
 
 
452 aa  637    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322399  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1270  phosphoglucosamine mutase  73.14 
 
 
451 aa  647    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1264  phosphoglucosamine mutase  69.2 
 
 
452 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.595538 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2186  phosphoglucosamine mutase  77.4 
 
 
447 aa  709    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2027  phosphoglucosamine mutase  93.96 
 
 
447 aa  858    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0818  phosphoglucosamine mutase  73.14 
 
 
451 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2021  phosphoglucosamine mutase  72.04 
 
 
451 aa  656    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1290  phosphoglucosamine mutase  71.05 
 
 
452 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985716  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1719  phosphoglucosamine mutase  93.96 
 
 
447 aa  858    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.905768 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1176  phosphoglucosamine mutase  72.46 
 
 
451 aa  651    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873875  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1514  phosphoglucosamine mutase  71.05 
 
 
452 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0578  phosphoglucosamine mutase  71.05 
 
 
452 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1299  phosphoglucosamine mutase  73.14 
 
 
451 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61277  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0881  phosphoglucosamine mutase  70.31 
 
 
452 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.389268  normal  0.0916323 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1484  phosphoglucosamine mutase  71.05 
 
 
452 aa  641    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1270  phosphoglucosamine mutase  68.36 
 
 
457 aa  616  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190809  normal  0.380438 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2013  phosphoglucosamine mutase  68.83 
 
 
443 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.993566  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2815  phosphoglucosamine mutase  68.46 
 
 
444 aa  609  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2609  phosphoglucosamine mutase  68.85 
 
 
443 aa  610  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2850  phosphoglucosamine mutase  68.46 
 
 
443 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.45347 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0946  phosphoglucosamine mutase  66.89 
 
 
450 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2381  phosphoglucosamine mutase  67.95 
 
 
444 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1477  phosphoglucosamine mutase  67.95 
 
 
444 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2626  phosphoglucosamine mutase  68.46 
 
 
445 aa  599  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122301  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2619  phosphoglucosamine mutase  67.95 
 
 
444 aa  595  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317995  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4923  phosphoglucosamine mutase  66.97 
 
 
447 aa  593  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.106408 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0856  phosphoglucosamine mutase  64.33 
 
 
450 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.304504  normal  0.368726 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1011  phosphoglucosamine mutase  65.69 
 
 
450 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.79008  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1135  phosphoglucosamine mutase  63.6 
 
 
458 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1738  phosphoglucosamine mutase  62.42 
 
 
450 aa  554  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0209  phosphoglucosamine mutase  63.43 
 
 
460 aa  551  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0485  phosphoglucosamine mutase  60.94 
 
 
463 aa  545  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0785  phosphoglucosamine mutase  61.61 
 
 
453 aa  545  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  58.67 
 
 
450 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  58.15 
 
 
450 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  58.15 
 
 
450 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  58.67 
 
 
450 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1487  phosphoglucosamine mutase  58.44 
 
 
450 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152305  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2243  phosphoglucosamine mutase  58.57 
 
 
452 aa  514  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.6083  normal  0.124274 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01688  phosphoglucosamine mutase  56.28 
 
 
447 aa  513  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000297141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  55.93 
 
 
445 aa  506  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2567  phosphoglucosamine mutase  55.08 
 
 
451 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.474953  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1967  phosphoglucosamine mutase  57.27 
 
 
446 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194402  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  56.01 
 
 
447 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  55.7 
 
 
451 aa  502  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1847  phosphoglucosamine mutase  56.73 
 
 
447 aa  499  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.310353  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3449  phosphoglucosamine mutase  55.78 
 
 
445 aa  498  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2822  phosphoglucosamine mutase  56 
 
 
450 aa  498  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0983  phosphoglucosamine mutase  56.44 
 
 
451 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0995172  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3469  phosphoglucosamine mutase  58.37 
 
 
445 aa  497  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3353  phosphoglucosamine mutase  57.3 
 
 
447 aa  495  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3065  phosphoglucosamine mutase  55.33 
 
 
445 aa  496  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  55.73 
 
 
445 aa  497  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3350  phosphoglucosamine mutase  56.73 
 
 
445 aa  494  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0843387  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1022  phosphoglucosamine mutase  56.36 
 
 
448 aa  496  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00540573  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3079  phosphoglucosamine mutase  57.46 
 
 
453 aa  493  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.7667  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5469  phosphoglucosamine mutase  55.76 
 
 
445 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0730  phosphoglucosamine mutase  56.85 
 
 
444 aa  490  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03041  phosphoglucosamine mutase  56.38 
 
 
445 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0250482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0531  phosphoglucosamine mutase  56.38 
 
 
445 aa  488  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0782231  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3483  phosphoglucosamine mutase  56.15 
 
 
445 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0848624  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3661  phosphoglucosamine mutase  56.38 
 
 
445 aa  488  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000185546  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02992  hypothetical protein  56.38 
 
 
445 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0265797  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2840  phosphoglucosamine mutase  54.88 
 
 
455 aa  486  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2709  phosphoglucosamine mutase  54.88 
 
 
455 aa  485  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3589  phosphoglucosamine mutase  56.15 
 
 
445 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0814  phosphoglucosamine mutase  54.98 
 
 
444 aa  488  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000566204  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3483  phosphoglucosamine mutase  56.15 
 
 
445 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3651  phosphoglucosamine mutase  56.15 
 
 
445 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3553  phosphoglucosamine mutase  56.15 
 
 
445 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3368  phosphoglucosamine mutase  56.38 
 
 
445 aa  488  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000272746  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3594  phosphoglucosamine mutase  56.38 
 
 
445 aa  488  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000289716  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1002  phosphoglucosamine mutase  55.06 
 
 
445 aa  484  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0206827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3472  phosphoglucosamine mutase  56.38 
 
 
445 aa  488  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000247168  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4498  phosphoglucosamine mutase  56.15 
 
 
445 aa  486  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140787  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62840  phosphoglucosamine mutase  55.86 
 
 
445 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0524  phosphoglucosamine mutase  56.38 
 
 
445 aa  488  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0662864  hitchhiker  0.00167255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4716  phosphoglucosamine mutase  56.4 
 
 
446 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4495  phosphoglucosamine mutase  54.18 
 
 
447 aa  481  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.235157  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0485  phosphoglucosamine mutase  55.51 
 
 
445 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00237844  normal  0.220868 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1768  phosphoglucosamine mutase  55.83 
 
 
455 aa  483  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2718  phosphoglucosamine mutase  54.85 
 
 
446 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.286925  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0568  phosphoglucosamine mutase  56.38 
 
 
445 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.468081  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4582  phosphoglucosamine mutase  56.18 
 
 
446 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.922342  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2260  phosphoglucosamine mutase  56.78 
 
 
454 aa  478  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0324957  hitchhiker  0.0000000138006 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2832  phosphoglucosamine mutase  54.04 
 
 
443 aa  481  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0011182  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2634  phosphoglucosamine mutase  56.78 
 
 
454 aa  478  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4185  phosphoglucosamine mutase  54.18 
 
 
447 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3734  phosphoglucosamine mutase  55.7 
 
 
446 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0349041  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3600  phosphoglucosamine mutase  55.7 
 
 
446 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434443  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3566  phosphoglucosamine mutase  53.74 
 
 
445 aa  480  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  hitchhiker  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1025  phosphoglucosamine mutase  55.06 
 
 
445 aa  478  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0055133  hitchhiker  0.0000634577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>