66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1506 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1506  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  121  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0231  hypothetical protein  59.09 
 
 		 67 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1189  hypothetical protein  60.38 
 
 		 64 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3731  hypothetical protein  57.63 
 
 		 62 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0204  hypothetical protein  50.85 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.160358 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0336  hypothetical protein  55.74 
 
 		 62 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3714  hypothetical protein  54.24 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0621408 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1244  hypothetical protein  53.33 
 
 		 63 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822358  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1190  hypothetical protein  54.24 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1812  hypothetical protein  49.21 
 
 		 62 aa  62.4  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0794  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  62  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3203  hypothetical protein  54.1 
 
 		 68 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000344489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0222  hypothetical protein  45.9 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0231987  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0021  hypothetical protein  50.85 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1064  hypothetical protein  54.39 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.710613  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2751  hypothetical protein  52.54 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3417  hypothetical protein  52.54 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0064901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2053  hypothetical protein  41.27 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.920599  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3267  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0407  hypothetical protein  50.85 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1159  hypothetical protein  50.85 
 
 		 64 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.136303 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1261  hypothetical protein  53.33 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.56018 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0459  hypothetical protein  50.82 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000162501  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3650  hypothetical protein  42.86 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0755582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1359  hypothetical protein  43.1 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0684  hypothetical protein  43.55 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.367344 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2965  hypothetical protein  49.15 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.568379 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0914  hypothetical protein  52.46 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0164503  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1281  conserved hypothetical secreted protein  50 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1269  hypothetical protein  42.62 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.898185  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0981  hypothetical protein  40.32 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.995934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4302  hypothetical protein  49.15 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal  0.0304485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2571  hypothetical protein  45.76 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.403063 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2197  hypothetical protein  49.21 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1611  hypothetical protein  42.62 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.931765  normal  0.039874 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2964  hypothetical protein  42.62 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224822  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1478  hypothetical protein  42.37 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311784  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1457  hypothetical protein  45.45 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.101741  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2917  hypothetical protein  45.76 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.37466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3689  hypothetical protein  45.76 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2585  hypothetical protein  44.07 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246477 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2705  hypothetical protein  40.68 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328169  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0851  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0738922  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6176  hypothetical protein  41.79 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0219  hypothetical protein  42.62 
 
 		 82 aa  47.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2478  hypothetical protein  49.15 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.328506  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1784  hypothetical protein  42.86 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.727128 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2258  hypothetical protein  32.31 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000331337  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2684  hypothetical protein  44.26 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1846  hypothetical protein  43.66 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27595  normal  0.211162 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3078  hypothetical protein  44.26 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0430  hypothetical protein  35.06 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2490  hypothetical protein  39.66 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.461455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0121  hypothetical protein  55.36 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0120  hypothetical protein  55.36 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1015  hypothetical protein  43.33 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0117  hypothetical protein  39.39 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0347  hypothetical protein  34.92 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1300  hypothetical protein  45 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.428744  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4705  putative transmembrane protein  41.79 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529381  normal  0.288258 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0054  hypothetical protein  44.07 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0301503  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4037  hypothetical protein  41.67 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.649084  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4192  hypothetical protein  43.55 
 
 		 72 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  hitchhiker  0.00134494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1868  hypothetical protein  40.3 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2099  hypothetical protein  32.84 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0305  hypothetical protein  38.46 
 
 		 67 aa  40  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>