More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1448 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  545  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1325  hypothetical protein  86.55 
 
 		 275 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1389  hypothetical protein  85.82 
 
 		 275 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000372272  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  67.29 
 
 		 286 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  66.18 
 
 		 278 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  63.64 
 
 		 286 aa  322  4e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  63.87 
 
 		 276 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  63.87 
 
 		 276 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  63.87 
 
 		 276 aa  316  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3448  PEP phosphonomutase  69.14 
 
 		 286 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36236  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4919  PEP phosphonomutase  69.14 
 
 		 286 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0062527  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5368  PEP phosphonomutase  69.14 
 
 		 286 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0658873  normal  0.17569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  62.77 
 
 		 276 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  61.03 
 
 		 278 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  58.65 
 
 		 278 aa  299  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  58.91 
 
 		 278 aa  296  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4869  PEP phosphonomutase  68.15 
 
 		 286 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21038  hitchhiker  0.00000793453 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0773  PEP phosphonomutase  67.29 
 
 		 286 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314114  normal  0.0162406 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4353  PEP phosphonomutase  67.78 
 
 		 286 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  58.17 
 
 		 276 aa  271  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8089  PEP phosphonomutase  55.26 
 
 		 274 aa  268  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16740  hypothetical protein  60.71 
 
 		 274 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1456  hypothetical protein  60.87 
 
 		 274 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  54.18 
 
 		 280 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4063  hypothetical protein  52.79 
 
 		 267 aa  250  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.196405  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  53.82 
 
 		 278 aa  249  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  52.22 
 
 		 274 aa  244  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4820  PEP phosphonomutase  55.08 
 
 		 275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  52.73 
 
 		 271 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  51.85 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  53.65 
 
 		 279 aa  237  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0122  hypothetical protein  52.55 
 
 		 276 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1626  hypothetical protein  48.11 
 
 		 287 aa  231  9e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  49.63 
 
 		 272 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  51.47 
 
 		 275 aa  226  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7278  hypothetical protein  52.71 
 
 		 280 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00843163  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3894  hypothetical protein  53.14 
 
 		 274 aa  227  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.077508  normal  0.524503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2774  hypothetical protein  57.98 
 
 		 276 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.167495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5017  putative methylisocitrate lyase or carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  47.41 
 
 		 271 aa  225  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467428 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  52.57 
 
 		 281 aa  225  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1688  PEP phosphonomutase  53.65 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.251205  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3722  hypothetical protein  51.65 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2263  PEP phosphonomutase  53.28 
 
 		 279 aa  221  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.978238  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1745  hypothetical protein  51.65 
 
 		 276 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3098  PEP phosphonomutase  50.57 
 
 		 288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1600  hypothetical protein  50.21 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3644  hypothetical protein  46.44 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354902 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1920  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein  40.76 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  34.42 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  39.35 
 
 		 268 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  30.04 
 
 		 274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  30.04 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  39.68 
 
 		 278 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  38.1 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00410  PEP phosphonomutase-like enzyme  37.59 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0254511 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  36.94 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  40.36 
 
 		 289 aa  112  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4021  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  33.72 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  28.75 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  27.02 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  34.44 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  36.59 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000706406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  32.18 
 
 		 258 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  37.66 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5509  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  37.19 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  34.03 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06151  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07230)  29.35 
 
 		 274 aa  99  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0384157  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  31.02 
 
 		 269 aa  99  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1856  hypothetical protein  33.2 
 
 		 259 aa  99  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000480494 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2157  hypothetical protein  32.84 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3853  hypothetical protein  32.1 
 
 		 266 aa  96.7  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0163  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  32.63 
 
 		 253 aa  96.3  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.643607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6199  PEP phosphonomutase-like protein  36.36 
 
 		 425 aa  95.9  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3328  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0552  PEP phosphonomutase and related enzyme-like protein  36.44 
 
 		 254 aa  93.6  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0410  hypothetical protein  36.1 
 
 		 258 aa  92.4  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2645  PEP phosphonomutase  38.49 
 
 		 295 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.327181 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3426  hypothetical protein  33.04 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0084  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  31.78 
 
 		 256 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0900  PEP phosphonomutase  33.46 
 
 		 259 aa  90.1  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  28.57 
 
 		 258 aa  89.4  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2024  hypothetical protein  33.07 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0525538 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053  hypothetical protein  32.02 
 
 		 282 aa  89  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0879  hypothetical protein  30.96 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2035  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12030  methylisocitrate lyase  33.97 
 
 		 312 aa  88.2  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.55917  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0220  hypothetical protein  33.95 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3408  hypothetical protein  31.38 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3483  hypothetical protein  30.96 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0044  hypothetical protein  32.46 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4484  PEP phosphonomutase  35.95 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000284716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0659  2,3-dimethylmalate lyase  31.6 
 
 		 322 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858206 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3606  hypothetical protein  31.42 
 
 		 282 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.647928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1639  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  34.71 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  0.866328 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0266  hypothetical protein  33.08 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.235193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0246  hypothetical protein  33.08 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0256  hypothetical protein  33.08 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  32.32 
 
 		 302 aa  85.5  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0391  hypothetical protein  32.07 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12030  hypothetical protein  32.77 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3283  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  33.47 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>