48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1422 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1422  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  276  8e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14104  decreased coverage  0.00104227 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1363  protein of unknown function DUF107  85.21 
 
 		 141 aa  216  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0778838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1299  protein of unknown function DUF107  87.5 
 
 		 141 aa  189  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1454  hypothetical protein  62.69 
 
 		 144 aa  156  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1863  hypothetical protein  60.71 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5311  hypothetical protein  46.48 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03679  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2034  hypothetical protein  51.61 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138969  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1903  hypothetical protein  50.81 
 
 		 144 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2021  hypothetical protein  50.81 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.348502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2001  hypothetical protein  50.81 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.812205  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6076  hypothetical protein  50.81 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1320  hypothetical protein  47.79 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2034  NfeD family protein  46.48 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3278  NfeD family protein  46.48 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.829792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2414  NfeD family protein  46.48 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2469  NfeD family protein  46.48 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1305  NfeD family protein  46.48 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243451  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1275  hypothetical protein  49.19 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.815122 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2560  nodulation efficiency protein D  46.48 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1534  hypothetical protein  46.48 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3258  hypothetical protein  50.35 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524127 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2047  hypothetical protein  45.07 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2963  hypothetical protein  41.48 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.154131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2414  hypothetical protein  43.48 
 
 		 142 aa  90.5  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2125  hypothetical protein  44.2 
 
 		 141 aa  90.5  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3499  hypothetical protein  37.04 
 
 		 141 aa  89.4  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2437  protein of unknown function DUF107  51.08 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0086298  normal  0.0411134 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1700  hypothetical protein  50.75 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2763  hypothetical protein  43.07 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2253  hypothetical protein  43.07 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2021  hypothetical protein  41.48 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2737  hypothetical protein  44.2 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294707  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1885  hypothetical protein  39.04 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0298787 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1926  hypothetical protein  40.91 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785571 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  28.06 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  28.06 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  28.06 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  28.06 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  27.74 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  29.85 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  27.34 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  26.24 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  25.18 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  25.18 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  28.37 
 
 		 142 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  28.37 
 
 		 142 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  28.37 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  28.78 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>