41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1397 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1335  ZipA FtsZ-binding region  83.78 
 
 
404 aa  649    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0297688  normal  0.420164 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1397  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  825    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.535756  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1271  ZipA FtsZ-binding region  84.52 
 
 
404 aa  657    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0892481 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1427  hypothetical protein  67.87 
 
 
439 aa  425  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190299  hitchhiker  0.00191457 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1887  hypothetical protein  52.44 
 
 
442 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00257246  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1345  ZipA FtsZ-binding region  46.48 
 
 
411 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149223  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2020  hypothetical protein  49.58 
 
 
421 aa  322  7e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1927  ZipA FtsZ-binding region  49.27 
 
 
429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.160599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1675  hypothetical protein  46.21 
 
 
430 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.109275  normal  0.0264473 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2045  ZipA FtsZ-binding region  52.9 
 
 
427 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.279908  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6052  hypothetical protein  52.9 
 
 
429 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2025  hypothetical protein  52.9 
 
 
429 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547113  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5335  hypothetical protein  50.7 
 
 
427 aa  317  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2590  hypothetical protein  56.04 
 
 
423 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2501  hypothetical protein  56.04 
 
 
423 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2444  hypothetical protein  56.04 
 
 
423 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2063  hypothetical protein  56.04 
 
 
418 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3248  hypothetical protein  56.04 
 
 
418 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1335  hypothetical protein  56.04 
 
 
418 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12511  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1562  hypothetical protein  56.04 
 
 
418 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.669322  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1251  ZipA FtsZ-binding region  50.89 
 
 
435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.333925  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2462  ZipA FtsZ-binding region  45.83 
 
 
429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00887227  hitchhiker  0.000175351 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2058  hypothetical protein  55.68 
 
 
431 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1670  ZipA FtsZ-binding region  37.1 
 
 
380 aa  202  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2085  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  37.1 
 
 
380 aa  202  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.300257  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2842  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  35.54 
 
 
374 aa  192  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244171  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2200  hypothetical protein  39.41 
 
 
350 aa  182  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.718761  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2951  ZipA FtsZ-binding region  40.48 
 
 
367 aa  179  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.038205  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3591  ZipA  38.56 
 
 
448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0210029  normal  0.0561961 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1811  hypothetical protein  39.53 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2593  hypothetical protein  38.6 
 
 
365 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592604  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0502  ZipA FtsZ-binding region  32.05 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4464  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  39.34 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549728  normal  0.824523 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1815  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  38.1 
 
 
365 aa  166  9e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1456  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  28.71 
 
 
352 aa  152  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2513  ZipA FtsZ-binding region  37.5 
 
 
370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00604929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1733  ZipA-like protein  29.74 
 
 
421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0528792  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2191  ZipA FtsZ-binding region  27.25 
 
 
360 aa  124  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0646  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  29.03 
 
 
441 aa  107  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0623  hypothetical protein  29.2 
 
 
389 aa  97.1  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1402  ZipA-like protein  23.09 
 
 
438 aa  86.7  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.387913  normal  0.648083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>