124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1373 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1373  disulfide bond formation protein B  100 
 
 
159 aa  315  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.299022  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1246  disulfide bond formation protein B  88.05 
 
 
159 aa  290  8e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1312  disulfide bond formation protein B  88.05 
 
 
159 aa  270  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461088  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1931  disulfide bond formation protein B  77.36 
 
 
161 aa  254  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1403  disulfide bond formation protein B  72.33 
 
 
161 aa  233  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0530499  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4377  disulfide bond formation protein B  43.04 
 
 
168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0483  Disulphide bond formation protein DsbB  40.38 
 
 
162 aa  127  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.351521  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3040  disulfide bond formation protein B  41.61 
 
 
169 aa  122  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055953 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1478  disulphide bond formation protein DsbB  41.96 
 
 
159 aa  121  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1140  disulfide bond formation protein B  40.51 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0809  disulfide bond formation protein B  43.04 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.622396 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0833  disulfide bond formation protein B  43.04 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0951  disulfide bond formation protein B  43.97 
 
 
169 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0848  disulfide bond formation protein B  42.41 
 
 
168 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1324  disulfide oxidoreductase  39.24 
 
 
169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  39.57 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0458  disulfide bond formation protein B  40 
 
 
169 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2604  disulfide bond formation protein B  40 
 
 
169 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71746  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0976  disulfide bond formation protein B  40 
 
 
169 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2913  disulfide bond formation protein B  40 
 
 
169 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2973  disulfide bond formation protein B  40 
 
 
169 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0171  disulfide bond formation protein B  40 
 
 
169 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2374  disulfide bond formation protein B  37.97 
 
 
170 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104676  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0897  disulfide bond formation protein B  36.73 
 
 
170 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431576  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4133  disulfide bond formation protein B  37.41 
 
 
170 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262214  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0542  disulfide bond formation protein B  37.41 
 
 
170 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0885  disulfide bond formation protein B  36.73 
 
 
170 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.740836  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1021  disulfide bond formation protein B  37.41 
 
 
170 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0980  disulfide bond formation protein B  37.41 
 
 
170 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0873643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0714  disulfide bond formation protein B  40.97 
 
 
168 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3018  DsbB family disulfide bond formation protein  40.46 
 
 
1210 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3111  disulfide bond formation protein B  37.93 
 
 
168 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1614  disulfide bond formation protein B  37.78 
 
 
169 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  39.62 
 
 
168 aa  98.6  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  35.58 
 
 
168 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  36.42 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  34.18 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2001  disulfide bond formation protein B  34.36 
 
 
181 aa  80.5  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0912116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2365  disulfide bond formation protein B  34.36 
 
 
181 aa  80.5  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00370125  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2111  disulfide bond formation protein B  34.36 
 
 
213 aa  80.5  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  33.75 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  36.81 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2549  disulphide bond formation protein DsbB  33.33 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0115369 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1862  disulphide bond formation protein DsbB  36.65 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2367  disulfide bond formation protein B  31.9 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000380886  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2001  disulfide bond formation protein B  31.29 
 
 
176 aa  73.9  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000986099  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2334  disulphide bond formation protein DsbB  35.66 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148772  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3300  Disulphide bond formation protein DsbB  34.18 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2750  disulfide bond formation protein B  32.72 
 
 
176 aa  72  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229834  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1805  disulfide bond formation protein B  33.73 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0937244  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2242  disulfide bond formation protein B  31.47 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000160562  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  29.27 
 
 
174 aa  70.5  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4586  disulphide bond formation protein DsbB  32.3 
 
 
168 aa  70.5  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  34.18 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2796  disulphide bond formation protein DsbB  35.4 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.462221  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1882  disulfide bond formation protein B  33.13 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0159786  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1949  disulfide bond formation protein B  33.33 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.291757  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0034  disulfide bond formation protein  39.29 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1946  disulfide bond formation protein B  33.61 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07000  disulfide bond formation protein  32.52 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1945  disulfide bond formation protein B  33.33 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0468661  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2005  disulfide bond formation protein B  33.33 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  0.704676 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0042  disulphide bond formation protein DsbB  39.29 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1326  disulfide bond formation protein B  33.33 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000420018  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1511  disulfide bond formation protein B  33.33 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.301751  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1343  disulfide bond formation protein B  28.83 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000257632  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1672  disulfide bond formation protein B  30.25 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1330  disulfide bond formation protein B  30.25 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000164029  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01160  disulfide bond formation protein B  30.25 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2463  Disulphide bond formation protein DsbB  30.25 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.15548e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1288  disulfide bond formation protein B  30.25 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  9.7249e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2440  disulfide bond formation protein B  30.25 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000139954  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1964  disulfide bond formation protein B  30.25 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000143241  normal  0.740746 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01170  hypothetical protein  30.25 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  34.29 
 
 
177 aa  67  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0468  disulphide bond formation protein DsbB  32.3 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0356503  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0641  disulfide bond formation protein  34.03 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1492  disulfide bond formation protein B  31.1 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.028843  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1985  disulfide bond formation protein B  28.22 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0344968  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002977  thiol:disulfide oxidoreductase DsbB required for DsbA reoxidation  31.34 
 
 
178 aa  64.3  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2610  disulphide bond formation protein DsbB  27.88 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443636 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0624  disulfide bond formation protein B  29.81 
 
 
206 aa  63.5  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000750855  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02931  disulfide bond formation protein B  28.47 
 
 
178 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2514  disulfide bond formation protein B  30.77 
 
 
177 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000563351  normal  0.732861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69400  disulfide bond formation protein  31.87 
 
 
163 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0284  disulphide bond formation protein DsbB  32.7 
 
 
163 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1660  disulfide bond formation protein B  29.58 
 
 
185 aa  60.5  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153074  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1926  disulfide bond formation protein B  28.57 
 
 
169 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00145643  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1776  disulfide bond formation protein B  29.08 
 
 
179 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000776232  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01146  disulfide bond formation protein B (Disulfide oxidoreductase)  33.57 
 
 
175 aa  59.7  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  32.72 
 
 
169 aa  59.7  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1813  disulfide bond formation protein B  28.37 
 
 
179 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0184857  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0782  disulfide bond formation protein B  32.92 
 
 
168 aa  58.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.136765  normal  0.0551075 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2653  disulphide bond formation protein DsbB  34.67 
 
 
172 aa  58.9  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0734912  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2176  disulfide bond formation protein B  29.49 
 
 
171 aa  58.9  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107057  hitchhiker  0.0087619 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0045  disulphide bond formation protein DsbB  31.61 
 
 
171 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1769  disulfide bond formation protein B  27.66 
 
 
179 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00798262  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2440  disulfide bond formation protein B  28.22 
 
 
172 aa  58.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000318191  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2509  disulfide bond formation protein B  27.66 
 
 
175 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00306638  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1681  disulfide bond formation protein B  33.07 
 
 
188 aa  57.4  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.058826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>