70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1356 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1356  GALA protein 4  100 
 
 		 620 aa  1219    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01777  GALA protein  43.74 
 
 		 981 aa  331  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254341  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01686  GALA protein 1  43.31 
 
 		 661 aa  294  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1579  hypothetical protein  47.91 
 
 		 464 aa  281  3e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1357  GALA protein 5  37.26 
 
 		 647 aa  273  8.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146674  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1801  GALA protein 3  39.61 
 
 		 522 aa  259  8e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.0997916 
 
 
-
 
NC_003296  RS02003  GALA protein  38.63 
 
 		 518 aa  198  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128117  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1800  GALA protein  38.85 
 
 		 401 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0919922 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1120  hypothetical protein  32.13 
 
 		 781 aa  158  3e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1436  hypothetical protein  34.49 
 
 		 815 aa  152  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0147013 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0458  leucine-rich repeat-containing ribonuclease inhibitor  35.93 
 
 		 516 aa  143  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363451  normal  0.370511 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1477  hypothetical protein  29.17 
 
 		 614 aa  134  5e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4051  hypothetical protein  35.12 
 
 		 400 aa  122  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0112  cyclin domain-containing protein  33.88 
 
 		 770 aa  117  7.999999999999999e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0526  hypothetical protein  34.96 
 
 		 372 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34199  predicted protein  30.99 
 
 		 471 aa  109  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1007  hypothetical protein  34.23 
 
 		 295 aa  108  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42557  predicted protein  29.78 
 
 		 692 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  29.18 
 
 		 344 aa  105  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1227  hypothetical protein  33.07 
 
 		 430 aa  104  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643545 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34148  predicted protein  32.18 
 
 		 466 aa  94  8e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0271154  normal  0.859268 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40174  predicted protein  32.88 
 
 		 897 aa  93.6  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.79 
 
 		 1107 aa  84  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5718  predicted protein  37.78 
 
 		 241 aa  79  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0287737  decreased coverage  0.00877055 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_1199  predicted protein  28.98 
 
 		 486 aa  77.4  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  26.25 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0725  hypothetical protein  29.93 
 
 		 510 aa  67  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.426015 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47188  predicted protein  29.45 
 
 		 916 aa  67  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1852  hypothetical protein  27.59 
 
 		 553 aa  65.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1383  hypothetical protein  28.2 
 
 		 465 aa  64.3  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  32.27 
 
 		 1266 aa  64.3  0.000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1857  hypothetical protein  27.59 
 
 		 553 aa  63.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0110  hypothetical protein  36.14 
 
 		 254 aa  62  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03210  Ran GTPase activator, putative  30.81 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1940  hypothetical protein  28.16 
 
 		 534 aa  57  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1628  hypothetical protein  31.51 
 
 		 481 aa  56.2  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.136617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2399  leucine rich repeat protein  32.67 
 
 		 368 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16663  predicted protein  29.41 
 
 		 1048 aa  56.2  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.207195 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.47 
 
 		 1655 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2293  predicted protein  28.52 
 
 		 432 aa  54.7  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.531902 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39238  predicted protein  32.35 
 
 		 591 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.975604  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34431  predicted protein  37.93 
 
 		 261 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.362654  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88061  predicted protein  27.23 
 
 		 936 aa  52  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0276819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  32.06 
 
 		 279 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0729  hypothetical protein  30.3 
 
 		 476 aa  51.2  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  29.32 
 
 		 993 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41374  predicted protein  29.35 
 
 		 262 aa  51.2  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00887084  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50414  predicted protein  29.35 
 
 		 262 aa  51.2  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0185184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  29.5 
 
 		 994 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  25 
 
 		 1344 aa  50.4  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0025  cyclin domain-containing protein  33.53 
 
 		 807 aa  50.1  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1058  hypothetical protein  37.76 
 
 		 746 aa  48.5  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.506927 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  28.16 
 
 		 1012 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  31.87 
 
 		 766 aa  48.5  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00110  conserved hypothetical protein  31.68 
 
 		 1608 aa  48.5  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108047  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6624  hypothetical protein  28.89 
 
 		 175 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  0.194539 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  31.32 
 
 		 542 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  31.32 
 
 		 779 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  31.32 
 
 		 765 aa  47  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12927  predicted protein  23.92 
 
 		 526 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7574  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  30.13 
 
 		 385 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  27.67 
 
 		 954 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  34.38 
 
 		 1744 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.33 
 
 		 472 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  30.77 
 
 		 766 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  30.77 
 
 		 760 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46346  predicted protein  30.17 
 
 		 716 aa  44.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0737232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  30.77 
 
 		 755 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  31.32 
 
 		 760 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  21.67 
 
 		 2324 aa  43.5  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>