273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1287 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1287  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  327  6e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00293096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1208  hypothetical protein  95.68 
 
 		 162 aa  317  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.951265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1115  hypothetical protein  94.44 
 
 		 162 aa  312  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473183  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2030  hypothetical protein  79.63 
 
 		 162 aa  269  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2033  hypothetical protein  79.63 
 
 		 162 aa  266  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1731  hypothetical protein  58.6 
 
 		 152 aa  189  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2822  hypothetical protein  57.96 
 
 		 152 aa  187  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00822471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1630  hypothetical protein  57.96 
 
 		 152 aa  187  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00641879 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1474  hypothetical protein  58.6 
 
 		 152 aa  183  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1018  hypothetical protein  58.6 
 
 		 152 aa  183  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680488  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1498  hypothetical protein  58.6 
 
 		 152 aa  183  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310765  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1420  hypothetical protein  57.96 
 
 		 152 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.042517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1380  hypothetical protein  57.96 
 
 		 152 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449131  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4639  hypothetical protein  57.96 
 
 		 152 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0564312  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1063  hypothetical protein  56.96 
 
 		 153 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295932  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2566  hypothetical protein  56.96 
 
 		 153 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000987168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1738  hypothetical protein  56.96 
 
 		 153 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00684436  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1760  hypothetical protein  56.96 
 
 		 153 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0989  hypothetical protein  56.96 
 
 		 153 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.233502  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1509  hypothetical protein  56.96 
 
 		 153 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0177  hypothetical protein  56.96 
 
 		 153 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00695056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1913  hypothetical protein  56.96 
 
 		 153 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454349  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1757  hypothetical protein  57.96 
 
 		 152 aa  179  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47468  normal  0.0284791 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1923  hypothetical protein  49.7 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156529 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1095  hypothetical protein  49.69 
 
 		 163 aa  147  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1229  hypothetical protein  49.08 
 
 		 163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0921139  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1699  hypothetical protein  50.3 
 
 		 183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264433 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1690  hypothetical protein  51.02 
 
 		 144 aa  136  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332685  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2013  hypothetical protein  43.08 
 
 		 202 aa  133  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000868215  normal  0.600676 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1866  hypothetical protein  48.34 
 
 		 142 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.182542  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2454  hypothetical protein  46.84 
 
 		 146 aa  130  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2424  hypothetical protein  43.92 
 
 		 200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.00000000350737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2132  hypothetical protein  37.5 
 
 		 204 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497047  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2746  hypothetical protein  38.78 
 
 		 212 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3385  hypothetical protein  39.41 
 
 		 202 aa  121  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.214146  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2988  hypothetical protein  38.97 
 
 		 192 aa  118  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.390443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1245  hypothetical protein  39.59 
 
 		 197 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172116  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2563  hypothetical protein  39.09 
 
 		 219 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  hitchhiker  0.00397879 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0065  hypothetical protein  45.27 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000828588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0699  hypothetical protein  43.06 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.188397  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  44.37 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  44.37 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  44.37 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  44.37 
 
 		 154 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  44.37 
 
 		 154 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  40.52 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  43.71 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  43.71 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  43.71 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  43.71 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  43.71 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  43.71 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  43.71 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  43.71 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  42.38 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  43.05 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  42.38 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  41.72 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  43.24 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  42.57 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  42.57 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  38.96 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  40.4 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  40.4 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  40.4 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  40.52 
 
 		 150 aa  97.1  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  39.47 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  38.82 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  41.03 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  37.5 
 
 		 151 aa  94.4  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  48.65 
 
 		 145 aa  93.6  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  35.76 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  41.56 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  46.43 
 
 		 176 aa  92.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  38.56 
 
 		 151 aa  91.7  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  46.09 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  39.49 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  40.67 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  36.91 
 
 		 238 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  42.61 
 
 		 152 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  42.98 
 
 		 169 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  38.85 
 
 		 153 aa  88.2  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  42.61 
 
 		 173 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2751  hypothetical protein  38.04 
 
 		 295 aa  87.8  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891527  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  36 
 
 		 168 aa  87.8  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  39.83 
 
 		 151 aa  87.4  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  40 
 
 		 158 aa  87  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  41.03 
 
 		 153 aa  87  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  41.74 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  37.25 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  41.74 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  36.24 
 
 		 201 aa  87  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  35.06 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  38.64 
 
 		 151 aa  85.5  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  39.39 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  41.53 
 
 		 151 aa  84.7  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  38.98 
 
 		 152 aa  84.3  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  37.41 
 
 		 257 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>