62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1181 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1181  inner membrane transmembrane protein  100 
 
 		 598 aa  1192    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000439298  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2138  hypothetical protein  65.37 
 
 		 600 aa  766    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23521  normal  0.937592 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1116  inner membrane transmembrane protein  84.2 
 
 		 596 aa  1031    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0494519  normal  0.220996 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0946  putative inner membrane protein  54.16 
 
 		 585 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0701589  normal  0.63376 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2121  inner membrane transmembrane protein  64.9 
 
 		 593 aa  743    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0363283  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1024  putative inner membrane transmembrane protein  84.71 
 
 		 596 aa  1016    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.18489  normal  0.362431 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2368  putative inner membrane protein  53.66 
 
 		 613 aa  629  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70062  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1819  putative inner membrane protein  53.66 
 
 		 601 aa  631  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.041941 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0036  hypothetical protein  53.68 
 
 		 582 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224896  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2216  hypothetical protein  53.68 
 
 		 582 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1861  hypothetical protein  53.68 
 
 		 582 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.347655  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2254  hypothetical protein  53.68 
 
 		 582 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0437004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1132  hypothetical protein  53.68 
 
 		 582 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2382  hypothetical protein  53.68 
 
 		 605 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1370  hypothetical protein  53.68 
 
 		 582 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108964  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1439  glycosyl transferase family protein  53.17 
 
 		 604 aa  621  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458682  hitchhiker  0.00674468 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6245  glycosyltransferase  52.48 
 
 		 610 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1834  glycosyltransferase  52.48 
 
 		 610 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.355529  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1858  glycosyltransferase  52.48 
 
 		 585 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.483257  normal  0.0746816 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5135  glycosyltransferase  52.65 
 
 		 610 aa  617  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.917614  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1772  glycosyltransferase  52.32 
 
 		 585 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2212  hypothetical protein  53.24 
 
 		 605 aa  611  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373988  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1745  glycosyltransferase  52.32 
 
 		 585 aa  609  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168561 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1310  putative inner membrane transmembrane protein  45.01 
 
 		 572 aa  498  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0636  putative inner membrane transmembrane protein  42.91 
 
 		 572 aa  465  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1280  hypothetical protein  34.61 
 
 		 587 aa  257  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2364  putative inner membrane transmembrane protein  35.49 
 
 		 565 aa  250  5e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1494  putative inner membrane transmembrane protein  35.21 
 
 		 565 aa  250  6e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2198  hypothetical protein  34.24 
 
 		 589 aa  229  9e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0401619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4910  putative inner membrane transmembrane protein  32.87 
 
 		 579 aa  229  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692389 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2901  putative inner membrane transmembrane protein  34.07 
 
 		 601 aa  226  9e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2319  putative inner membrane transmembrane protein  34.46 
 
 		 575 aa  226  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2808  hypothetical protein  34.22 
 
 		 537 aa  220  5e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0012  putative inner membrane transmembrane protein  33.11 
 
 		 616 aa  201  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.672275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2634  putative inner membrane transmembrane protein  34.63 
 
 		 581 aa  191  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123636  normal  0.0441493 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3000  hypothetical protein  31.21 
 
 		 540 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0521457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2292  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 		 558 aa  170  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  normal  0.307073 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0071  hypothetical protein  27.73 
 
 		 660 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1996  hypothetical protein  30.22 
 
 		 552 aa  152  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0461641  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2260  hypothetical protein  36.58 
 
 		 616 aa  148  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.991842 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3678  putative transmembrane protein  26.69 
 
 		 674 aa  146  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2381  transmembrane protein  26.38 
 
 		 569 aa  137  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000535308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3355  hypothetical protein  26.31 
 
 		 674 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0041  hypothetical protein  27.49 
 
 		 519 aa  114  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3242  hypothetical protein  26.25 
 
 		 668 aa  112  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1034  hypothetical protein  25.99 
 
 		 636 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509069  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1260  hypothetical protein  25.32 
 
 		 605 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1267  hypothetical protein  25.32 
 
 		 605 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.514254  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1861  hypothetical protein  25.32 
 
 		 605 aa  107  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.790877  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0384  hypothetical protein  25.32 
 
 		 605 aa  107  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.727782  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1101  hypothetical protein  25.4 
 
 		 635 aa  107  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210473  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1407  hypothetical protein  25.4 
 
 		 635 aa  107  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.380672  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0765  hypothetical protein  25.87 
 
 		 563 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885976  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2033  hypothetical protein  24.72 
 
 		 648 aa  103  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.591759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4455  hypothetical protein  24.92 
 
 		 599 aa  100  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2276  glycosyltransferase  25.63 
 
 		 630 aa  90.1  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.63545  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2299  glycosyltransferase  25.63 
 
 		 630 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.813024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1664  glycosyltransferase  25.63 
 
 		 630 aa  90.1  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374986  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1002  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 		 631 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.983807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2314  glycosyltransferase  28.81 
 
 		 645 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2192  glycosyltransferase  30.45 
 
 		 645 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.839356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5603  glycosyltransferase  30.82 
 
 		 630 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>