148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1142 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1142  integral membrane transmembrane protein  100 
 
 		 225 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1080  peptidase M50  61.99 
 
 		 221 aa  284  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0984  peptidase M50  61.99 
 
 		 221 aa  284  9e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0881393 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2008  peptidase M50  59.63 
 
 		 220 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672002  hitchhiker  0.0000725285 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2135  peptidase M50  58.72 
 
 		 220 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1176  peptidase M50  58.8 
 
 		 220 aa  259  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267002 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5404  peptidase M50  57.73 
 
 		 220 aa  258  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1066  peptidase M50  57.41 
 
 		 221 aa  257  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.128232  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5979  peptidase M50  58.26 
 
 		 220 aa  256  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189316  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2098  peptidase M50  58.26 
 
 		 220 aa  256  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2116  peptidase M50  58.26 
 
 		 220 aa  256  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340207 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1430  peptidase M50  58.18 
 
 		 220 aa  254  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1582  peptidase M50  57.41 
 
 		 220 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453611  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2551  peptidase M50  56.94 
 
 		 220 aa  252  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00369558  normal  0.148044 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1903  M50 family peptidase  57.21 
 
 		 221 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2568  M50 family peptidase  56.28 
 
 		 221 aa  251  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1102  peptidase M50  55.56 
 
 		 221 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1681  M50 family peptidase  56.28 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2183  M50 family peptidase  56.28 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3134  M50 family peptidase  56.28 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2622  M50 family peptidase  56.28 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1456  M50 family peptidase  56.28 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.848737  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3277  peptidase M50  55.4 
 
 		 222 aa  244  8e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3239  peptidase M50  54.46 
 
 		 222 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345488  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3710  peptidase M50  56.22 
 
 		 222 aa  237  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4024  peptidase M50  54.59 
 
 		 223 aa  235  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2770  peptidase M50  55.09 
 
 		 228 aa  231  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3437  peptidase M50  55.09 
 
 		 228 aa  231  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.418421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5414  peptidase M50  54.38 
 
 		 260 aa  219  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1624  peptidase M50  51.38 
 
 		 227 aa  218  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1002  peptidase M50  52.58 
 
 		 222 aa  217  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693021  hitchhiker  0.000264691 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0475  peptidase M50  44.34 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1339  peptidase M50  46.23 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000024793 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1685  peptidase M50  50.5 
 
 		 219 aa  181  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.800401  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1526  putative integral membrane transmembrane protein  49 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0750535 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1875  peptidase M50  46.86 
 
 		 213 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  45.36 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  45.36 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2316  peptidase M50  48.47 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1229  peptidase M50  43.85 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442117  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1788  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  44.9 
 
 		 219 aa  155  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1465  peptidase M50  44.9 
 
 		 219 aa  155  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.658602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2016  peptidase M50  43.78 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0347485  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2208  hypothetical protein  46.88 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2460  peptidase M50  45.58 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.754633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1456  peptidase M50  41.71 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1937  peptidase, M50 family protein  37.57 
 
 		 230 aa  135  5e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000010669  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0256  membrane endopeptidase, M50 family  37.57 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2485  peptidase M50  43.15 
 
 		 235 aa  131  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.904327  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1037  peptidase M50  41.31 
 
 		 233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.489327  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1298  Zn-dependent proteases  41.75 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1961  peptidase M50  38.16 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1519  peptidase M50  43.1 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2251  peptidase M50  35.09 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694823  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2248  peptidase M50  40.3 
 
 		 223 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3737  peptidase M50  43.18 
 
 		 224 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1834  M50 family peptidase  39.23 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143147  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0766  peptidase M50  38.1 
 
 		 213 aa  123  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209931  normal  0.716111 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  37.32 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1686  peptidase M50  38.54 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156673  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1271  peptidase M50  41.76 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194788  normal  0.0570245 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1231  peptidase M50  36.61 
 
 		 216 aa  122  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1776  peptidase M50  42.53 
 
 		 228 aa  122  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00724949  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2299  peptidase M50  40.62 
 
 		 226 aa  121  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3219  peptidase M50  39.23 
 
 		 223 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0681  peptidase M50  38.97 
 
 		 221 aa  121  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.259408  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1924  peptidase M50  41.05 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3547  hypothetical protein  43.26 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1326  peptidase M50  38.33 
 
 		 225 aa  118  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.352309 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1225  peptidase M50  37.02 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.460426  normal  0.363921 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3608  M50 family peptidase  35 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2826  peptidase M50  34.65 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2335  peptidase M50  35.5 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1036  peptidase M50  39.11 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.375981  normal  0.481389 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0033  peptidase M50  40.32 
 
 		 224 aa  111  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  36.06 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2756  peptidase M50  36.22 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0751  peptidase M50  36.98 
 
 		 203 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1565  peptidase M50  35.44 
 
 		 202 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1202  peptidase M50  37.81 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0952  peptidase M50  40.29 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1653  peptidase M50  35.32 
 
 		 220 aa  105  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.580306 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1624  peptidase M50  35.2 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0374548  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06780  Zn-dependent protease  37.43 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0109989  normal  0.843659 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1301  peptidase M50  38.5 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0801  peptidase M50  35.45 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1132  peptidase M50  37.66 
 
 		 246 aa  99  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1470  peptidase M50  38.12 
 
 		 200 aa  98.6  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  35.63 
 
 		 209 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1686  peptidase M50  33.86 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09610  Zn-dependent protease  34.95 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000371518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  28.64 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0386  peptidase M50  34.85 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0579866  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3859  peptidase M50  35.88 
 
 		 214 aa  95.5  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3354  peptidase M50  34.2 
 
 		 225 aa  95.5  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013117  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2170  peptidase M50  33.33 
 
 		 222 aa  95.1  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141859  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3898  peptidase M50  32.14 
 
 		 224 aa  95.1  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3670  peptidase M50  33.49 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  28.57 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  28.57 
 
 		 224 aa  92.8  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>