More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1044 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  100 
 
 		 378 aa  766    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  77.75 
 
 		 364 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  77.75 
 
 		 364 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2271  peptidase S49  65.21 
 
 		 394 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2436  peptidase S49  63.51 
 
 		 387 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2796  peptidase, U7 family protein  67.39 
 
 		 333 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0383302  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1711  peptidase, U7 family protein  68.83 
 
 		 333 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.354653  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0524  peptidase, U7 family protein  68.83 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2189  peptidase S49  66.77 
 
 		 330 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0764473 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2915  peptidase  68.83 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0641289  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1809  peptidase, U7 family protein  68.83 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2859  peptidase, U7 family protein  68.83 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2798  peptidase, U7 family protein  68.83 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4227  peptidase S49  68.95 
 
 		 330 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2486  peptidase, U7 family protein  68.51 
 
 		 333 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00952675  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1073  peptidase S49  68.42 
 
 		 330 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476485  normal  0.159448 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0822  peptidase S49  68.45 
 
 		 336 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1066  family S49 unassigned peptidase  66.46 
 
 		 334 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0635  peptidase S49  68.42 
 
 		 330 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1115  peptidase S49  68.42 
 
 		 330 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0995  peptidase S49  68.42 
 
 		 330 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0991  peptidase S49  68.09 
 
 		 330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2918  peptidase S49  64.89 
 
 		 334 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  58.82 
 
 		 361 aa  391  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  57.7 
 
 		 350 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  54.52 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0399  peptidase S49  59.61 
 
 		 313 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.673483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  53.98 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2639  peptidase S49  59.39 
 
 		 347 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2009  peptidase S49  58.65 
 
 		 320 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3286  peptidase S49  59.39 
 
 		 347 aa  366  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  57.67 
 
 		 312 aa  365  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  57 
 
 		 316 aa  363  3e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0392  peptidase S49  61.46 
 
 		 315 aa  359  4e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5278  peptidase S49  59.87 
 
 		 348 aa  356  3.9999999999999996e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0588  peptidase S49  59.47 
 
 		 340 aa  350  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0721247 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1382  peptidase S49  58.8 
 
 		 347 aa  345  7e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  58.22 
 
 		 313 aa  344  1e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4784  peptidase S49  56.09 
 
 		 323 aa  335  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  62.45 
 
 		 336 aa  318  9e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3806  signal peptide peptidase SppA, 36K type  53.26 
 
 		 329 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  50.97 
 
 		 326 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  52.23 
 
 		 326 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1641  peptidase S49, SppA  53.63 
 
 		 332 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.183448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1908  signal peptide peptidase SppA, 36K type  52.92 
 
 		 329 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000305573 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  53.42 
 
 		 325 aa  310  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3838  signal peptide peptidase SppA, 36K type  52.94 
 
 		 332 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1519  signal peptide peptidase SppA, 36K type  53.26 
 
 		 341 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0791884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1484  signal peptide peptidase SppA, 36K type  52.58 
 
 		 329 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1873  peptidase S49  45.69 
 
 		 349 aa  302  5.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14850  Peptidase S49, SppA  51.14 
 
 		 325 aa  301  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772119  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4163  peptidase S49, SppA  51.55 
 
 		 329 aa  299  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244443  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1622  signal peptide peptidase SppA, 36K type  51.03 
 
 		 326 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1356  peptidase S49  49.66 
 
 		 311 aa  292  6e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0013  signal peptide peptidase SppA domain-containing protein  47.46 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000208532 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  47.77 
 
 		 327 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1622  putative peptidase  45.14 
 
 		 329 aa  282  6.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.270373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.35 
 
 		 350 aa  280  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1565  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.67 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0230449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0925  peptidase S49  47.77 
 
 		 321 aa  273  5.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.474149 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1428  peptidase S49  45.78 
 
 		 311 aa  268  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574443 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1193  peptidase S49  48.04 
 
 		 321 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.200797 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1713  hypothetical protein  44.79 
 
 		 318 aa  256  4e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1713  hypothetical protein  44.79 
 
 		 318 aa  256  6e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1144  peptidase S49  46.15 
 
 		 312 aa  256  6e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.148766  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1240  peptidase S49  49.2 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1595  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.05 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39752  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.81 
 
 		 339 aa  245  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0786  signal peptide peptidase  42.68 
 
 		 351 aa  237  3e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917383 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0792  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.04 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1737  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.74 
 
 		 354 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391092  normal  0.794877 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0098  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.86 
 
 		 313 aa  209  5e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2084  signal peptide peptidase  42.52 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3922  peptidase S49  49.03 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1091  peptidase S49  50 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0385  S49 family peptidase  46.08 
 
 		 283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0725  peptidase S49  54.07 
 
 		 300 aa  179  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  52.57 
 
 		 288 aa  179  9e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0571  peptidase S49  45.96 
 
 		 286 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0396  protease IV, putative  45.54 
 
 		 368 aa  177  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.690183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0405  putative protease IV  45.54 
 
 		 368 aa  177  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0514  peptidase S49  46.53 
 
 		 290 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  41.23 
 
 		 300 aa  176  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0066  peptidase S49  43.33 
 
 		 290 aa  176  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0527  peptidase S49  48.89 
 
 		 286 aa  176  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585752  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0166  peptidase S49  41.11 
 
 		 297 aa  175  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0640  peptidase S49  44.44 
 
 		 265 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2309  peptidase S49  50 
 
 		 267 aa  173  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.701811  normal  0.0237948 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  49.01 
 
 		 293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4351  peptidase S49  49.5 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0461  peptidase S49  46.77 
 
 		 288 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  47.37 
 
 		 283 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1076  S49 family peptidase  40.89 
 
 		 265 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0708  peptidase S49  40.54 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884772  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1376  peptidase S49  41.86 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2737  peptidase S49  45.45 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.224887  normal  0.140523 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2523  peptidase S49  39.53 
 
 		 265 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2857  peptidase S49  45.45 
 
 		 265 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1235  peptidase S49  48.33 
 
 		 300 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0130  peptidase S49  43.3 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.14674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>