191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1031 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1031  nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
404 aa  843    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120152  normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0961  nicotinate phosphoribosyltransferase  90.23 
 
 
389 aa  749    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2284  nicotinate phosphoribosyltransferase  76.86 
 
 
392 aa  638    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0887476  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0980  nicotinate phosphoribosyltransferase  75.84 
 
 
399 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000687395  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2449  nicotinate phosphoribosyltransferase  75.95 
 
 
399 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000692172  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0621  nicotinate phosphoribosyltransferase  75.58 
 
 
399 aa  634    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000681686  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0976  nicotinate phosphoribosyltransferase  75.84 
 
 
399 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000451173  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0896  nicotinate phosphoribosyltransferase  90.23 
 
 
389 aa  751    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477693  normal  0.0227421 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1059  nicotinate phosphoribosyltransferase  75.58 
 
 
399 aa  634    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000644735  normal  0.317841 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1100  nicotinate phosphoribosyltransferase  75.58 
 
 
399 aa  634    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000027143  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2203  nicotinate phosphoribosyltransferase  75.32 
 
 
399 aa  633  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000037467  normal  0.397068 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1697  nicotinate phosphoribosyltransferase  75.58 
 
 
399 aa  633  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000128882  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0510  nicotinate phosphoribosyltransferase  75.58 
 
 
399 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0109492  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2931  nicotinate phosphoribosyltransferase  75.58 
 
 
424 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000120174  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4213  nicotinate phosphoribosyltransferase  75.06 
 
 
399 aa  629  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000018976  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2501  nicotinate phosphoribosyltransferase  75.58 
 
 
399 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000365732  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2781  nicotinate phosphoribosyltransferase  75.58 
 
 
399 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116025  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2812  nicotinate phosphoribosyltransferase  75.58 
 
 
399 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000325875  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2873  nicotinate phosphoribosyltransferase  75.58 
 
 
399 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0365801  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1824  nicotinate phosphoribosyltransferase  75.58 
 
 
399 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00156311  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1052  nicotinate phosphoribosyltransferase  71.53 
 
 
412 aa  627  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000386017  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2932  nicotinate phosphoribosyltransferase  73.26 
 
 
398 aa  624  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000292258  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0808  nicotinate phosphoribosyltransferase  71.79 
 
 
399 aa  617  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000395003  normal  0.217385 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1368  nicotinate phosphoribosyltransferase  71.21 
 
 
398 aa  591  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00031505  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2492  nicotinate phosphoribosyltransferase  71.21 
 
 
398 aa  591  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398443  normal  0.0193027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1772  nicotinate phosphoribosyltransferase  68.56 
 
 
406 aa  584  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182399  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4740  nicotinate phosphoribosyltransferase  69.58 
 
 
406 aa  582  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35755  normal  0.607195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3080  nicotinate phosphoribosyltransferase  68.69 
 
 
395 aa  578  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2067  nicotinate phosphoribosyltransferase  68.81 
 
 
406 aa  577  1.0000000000000001e-163  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.398487  hitchhiker  0.00430299 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3306  nicotinate phosphoribosyltransferase  69 
 
 
402 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0926787  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1620  nicotinate phosphoribosyltransferase  68.43 
 
 
399 aa  570  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0559  nicotinate phosphoribosyltransferase  69.69 
 
 
393 aa  560  1e-158  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618565  normal  0.0393004 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0385  nicotinate phosphoribosyltransferase  67.78 
 
 
394 aa  546  1e-154  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0442  nicotinate phosphoribosyltransferase  67.78 
 
 
394 aa  546  1e-154  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0581  nicotinate phosphoribosyltransferase  53.58 
 
 
407 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.770292 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1293  nicotinate phosphoribosyltransferase  53.13 
 
 
413 aa  430  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1089  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
416 aa  426  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6283  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.03 
 
 
395 aa  415  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000174127  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0976  nicotinate phosphoribosyltransferase  53.55 
 
 
398 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147591  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3719  nicotinate phosphoribosyltransferase  53.05 
 
 
397 aa  414  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00517667  normal  0.0126108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5606  nicotinate phosphoribosyltransferase  51.77 
 
 
399 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.643272 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1411  nicotinate phosphoribosyltransferase  50.51 
 
 
399 aa  396  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.997998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0595  nicotinate phosphoribosyltransferase  48.47 
 
 
407 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2245  nicotinate phosphoribosyltransferase  48.73 
 
 
399 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64960  nicotinate phosphoribosyltransferase  49.49 
 
 
399 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.500667  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5645  nicotinate phosphoribosyltransferase  49.49 
 
 
399 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0548  nicotinate phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
407 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220672  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4921  nicotinate phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
407 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4945  nicotinate phosphoribosyltransferase  47.96 
 
 
398 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56900  nicotinate phosphoribosyltransferase  47.45 
 
 
398 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0167  nicotinate phosphoribosyltransferase  47.97 
 
 
406 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1730  nicotinate phosphoribosyltransferase  46.43 
 
 
406 aa  365  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.404013  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4924  nicotinate phosphoribosyltransferase  46.94 
 
 
401 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.588245  hitchhiker  0.000000000198844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4868  nicotinate phosphoribosyltransferase  46.68 
 
 
402 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4746  nicotinate phosphoribosyltransferase  46.68 
 
 
401 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000123757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4660  nicotinate phosphoribosyltransferase  46.17 
 
 
401 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00615533 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1944  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.11 
 
 
399 aa  350  3e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0388  nicotinate phosphoribosyltransferase  44.39 
 
 
400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1092  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.51 
 
 
400 aa  325  9e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000112466  normal  0.614516 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00935  nicotinate phosphoribosyltransferase  44.02 
 
 
400 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00018823  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2665  nicotinate phosphoribosyltransferase  44.02 
 
 
416 aa  324  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000296295  normal  0.0229075 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00942  hypothetical protein  44.02 
 
 
400 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000138975  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1031  nicotinate phosphoribosyltransferase  44.02 
 
 
400 aa  325  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00456308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1039  nicotinate phosphoribosyltransferase  44.02 
 
 
400 aa  325  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00414982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2712  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.77 
 
 
400 aa  324  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536664  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2387  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.77 
 
 
400 aa  323  3e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0828745  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2189  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.51 
 
 
400 aa  323  4e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.084522  normal  0.514532 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1639  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.28 
 
 
401 aa  322  8e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0109745  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1014  nicotinate phosphoribosyltransferase  43 
 
 
400 aa  315  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1073  nicotinate phosphoribosyltransferase  43 
 
 
400 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104663 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1041  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.75 
 
 
400 aa  312  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300411 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1118  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.75 
 
 
400 aa  312  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0150287  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1668  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.84 
 
 
401 aa  312  6.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000219699  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1106  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.75 
 
 
400 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.634691 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1732  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.05 
 
 
401 aa  308  8e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128231  normal  0.731039 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2557  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.58 
 
 
401 aa  308  9e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000810876  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2647  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.58 
 
 
406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0524303  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1981  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.33 
 
 
416 aa  307  2.0000000000000002e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000489265  normal  0.809116 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1450  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.97 
 
 
400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1786  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.82 
 
 
401 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00758127  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2058  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.8 
 
 
401 aa  296  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0041  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.38 
 
 
435 aa  296  6e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06575  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.3 
 
 
436 aa  296  6e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000697  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.3 
 
 
436 aa  286  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0220829  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2472  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.87 
 
 
391 aa  260  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0941  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.21 
 
 
390 aa  257  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3022  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.8 
 
 
401 aa  254  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00216966  normal  0.447003 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0321  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.24 
 
 
405 aa  252  7e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0338  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.78 
 
 
390 aa  249  5e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2095  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.86 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0425605 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1307  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.47 
 
 
424 aa  229  8e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0125  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.35 
 
 
434 aa  227  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0112  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.34 
 
 
434 aa  226  4e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0109  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.11 
 
 
447 aa  226  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0248268  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3403  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.99 
 
 
434 aa  226  7e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0250  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.89 
 
 
434 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4452  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.2 
 
 
434 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.47988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0308  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.63 
 
 
434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.273883 
 
 
-
 
NC_002950  PG0057  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.22 
 
 
394 aa  219  8.999999999999998e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1739  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.35 
 
 
434 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>