More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0920 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0920  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  100 
 
 		 350 aa  693    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0790  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  95.43 
 
 		 349 aa  659    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264335  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  94.57 
 
 		 349 aa  655    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  78.53 
 
 		 344 aa  523  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  78.24 
 
 		 344 aa  520  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  75.36 
 
 		 385 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  75.36 
 
 		 344 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  75.36 
 
 		 385 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  75.36 
 
 		 385 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1018  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  75.36 
 
 		 344 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  74.21 
 
 		 344 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0935  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  74.79 
 
 		 344 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  73.35 
 
 		 344 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  74.21 
 
 		 344 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0939  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  74.5 
 
 		 344 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0215  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  72.49 
 
 		 344 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  72.49 
 
 		 344 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2980  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  72.49 
 
 		 344 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2558  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  72.49 
 
 		 344 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  72.49 
 
 		 344 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  72.49 
 
 		 344 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2931  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  72.49 
 
 		 344 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  72.21 
 
 		 344 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.84 
 
 		 348 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.84 
 
 		 348 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2367  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.55 
 
 		 359 aa  428  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0612638  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  63.4 
 
 		 348 aa  425  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255507  hitchhiker  0.00172815 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2536  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  65 
 
 		 352 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0300192  normal  0.239692 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1772  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  65.81 
 
 		 348 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  56.73 
 
 		 351 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  51.92 
 
 		 339 aa  364  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  51.03 
 
 		 339 aa  360  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  51.03 
 
 		 339 aa  360  3e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  51.03 
 
 		 339 aa  360  3e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  51.03 
 
 		 339 aa  360  3e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  51.03 
 
 		 339 aa  360  3e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  51.03 
 
 		 339 aa  360  3e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  51.03 
 
 		 339 aa  359  4e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  51.03 
 
 		 339 aa  359  4e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  51.29 
 
 		 340 aa  358  5e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  51.03 
 
 		 339 aa  358  6e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  51.33 
 
 		 339 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  51.58 
 
 		 344 aa  352  8e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  52.03 
 
 		 352 aa  351  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  52.01 
 
 		 345 aa  350  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0563  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.19 
 
 		 356 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0195  ABC transporter, ATP-binding protein  50.87 
 
 		 346 aa  338  8e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0176  ABC transporter ATP-binding protein  50.87 
 
 		 346 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00383755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0174  ABC transporter ATP-binding protein  50.87 
 
 		 346 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.157332  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1145  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.57 
 
 		 377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0198  ABC transporter, ATP-binding protein  49.71 
 
 		 346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5127  ABC transporter, ATP-binding protein  48.84 
 
 		 346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3485  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.76 
 
 		 335 aa  336  2.9999999999999997e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0166  ABC transporter, ATP-binding protein  50.29 
 
 		 346 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.766032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0218  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 346 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3225  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.13 
 
 		 382 aa  335  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3538  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.86 
 
 		 344 aa  335  5e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0233022 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0196  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 346 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000216687  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0160  ABC transporter related  48.84 
 
 		 346 aa  333  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.29 
 
 		 343 aa  334  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1610  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.79 
 
 		 368 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  52 
 
 		 354 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0429  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.29 
 
 		 344 aa  333  3e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  47.98 
 
 		 342 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  49.43 
 
 		 344 aa  330  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.72 
 
 		 343 aa  330  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2785  ABC transporter related  50.87 
 
 		 359 aa  329  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.14 
 
 		 343 aa  329  6e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2100  ABC transporter related  50.86 
 
 		 347 aa  328  7e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  49 
 
 		 342 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  50.43 
 
 		 343 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3791  ABC transporter related  49.71 
 
 		 377 aa  326  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5160  ABC transporter related  51.59 
 
 		 388 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.29 
 
 		 344 aa  325  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.08 
 
 		 335 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.71 
 
 		 343 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.71 
 
 		 343 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.71 
 
 		 343 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.71 
 
 		 343 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.71 
 
 		 343 aa  322  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5262  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  51.49 
 
 		 335 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0737  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.42 
 
 		 343 aa  322  8e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00428338  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 		 345 aa  322  9.000000000000001e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.14 
 
 		 343 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1974  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.78 
 
 		 335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00627012  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1906  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.78 
 
 		 345 aa  319  3.9999999999999996e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0366735  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3986  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.56 
 
 		 343 aa  319  3.9999999999999996e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03093  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.7 
 
 		 335 aa  319  5e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.71 
 
 		 343 aa  318  6e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 		 343 aa  318  6e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 		 343 aa  318  6e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  48.71 
 
 		 343 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.71 
 
 		 343 aa  318  1e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.71 
 
 		 343 aa  318  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  48.71 
 
 		 343 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.71 
 
 		 343 aa  318  1e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.71 
 
 		 343 aa  318  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.71 
 
 		 343 aa  318  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  47.41 
 
 		 341 aa  317  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4491  ABC transporter related  50.58 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.031599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>