More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0897 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  100 
 
 		 229 aa  460  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  83.56 
 
 		 228 aa  384  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  82.1 
 
 		 229 aa  384  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  64.62 
 
 		 237 aa  276  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  65.09 
 
 		 237 aa  275  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  65.57 
 
 		 218 aa  274  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  62.09 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  64.19 
 
 		 221 aa  268  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1629  phosphoglycolate phosphatase  64.15 
 
 		 241 aa  257  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2955  phosphoglycolate phosphatase  62.5 
 
 		 241 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3004  phosphoglycolate phosphatase  62.5 
 
 		 241 aa  255  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2893  phosphoglycolate phosphatase  62.5 
 
 		 241 aa  255  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0438  phosphoglycolate phosphatase  62.04 
 
 		 241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0190  phosphoglycolate phosphatase  62.04 
 
 		 241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0957  phosphoglycolate phosphatase  62.04 
 
 		 241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.753227  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2583  phosphoglycolate phosphatase  62.04 
 
 		 241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0996  phosphoglycolate phosphatase  62.26 
 
 		 237 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0558  phosphoglycolate phosphatase  62.26 
 
 		 237 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1037  phosphoglycolate phosphatase  62.26 
 
 		 237 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0917  phosphoglycolate phosphatase  61.32 
 
 		 238 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0326596 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0913  phosphoglycolate phosphatase  60.85 
 
 		 238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4716  phosphoglycolate phosphatase  55.66 
 
 		 221 aa  238  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  54.63 
 
 		 221 aa  237  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4150  2-phosphoglycolate phosphatase  60.38 
 
 		 238 aa  234  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  54.17 
 
 		 221 aa  227  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0490  phosphoglycolate phosphatase  50.23 
 
 		 224 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155705  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3277  phosphoglycolate phosphatase  54.13 
 
 		 227 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0806752  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2267  phosphoglycolate phosphatase  61.32 
 
 		 238 aa  215  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.428353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  53.3 
 
 		 222 aa  214  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2185  phosphoglycolate phosphatase  51.87 
 
 		 215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279465  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3116  phosphoglycolate phosphatase  51.89 
 
 		 221 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0121451 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  51.4 
 
 		 221 aa  209  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  50.71 
 
 		 222 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1500  phosphoglycolate phosphatase  50 
 
 		 224 aa  205  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0783789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1823  phosphoglycolate phosphatase  50 
 
 		 224 aa  205  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  49.76 
 
 		 225 aa  204  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  49.29 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2235  phosphoglycolate phosphatase 2  56.44 
 
 		 223 aa  202  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  47.69 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1348  phosphoglycolate phosphatase  45.58 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1226  phosphoglycolate phosphatase  48.56 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000334097  normal  0.244171 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  47.95 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  49.29 
 
 		 222 aa  186  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  42.99 
 
 		 223 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  43.46 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  44.8 
 
 		 234 aa  181  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  46.64 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  43.93 
 
 		 223 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  44.39 
 
 		 223 aa  175  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  41.12 
 
 		 223 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  41.28 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  41.28 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  42.38 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4082  phosphoglycolate phosphatase  41.59 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867536  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  41.9 
 
 		 223 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  41.59 
 
 		 226 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  41.59 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  41.43 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  47.03 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2739  phosphoglycolate phosphatase  46.85 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  44.22 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2472  phosphoglycolate phosphatase  42.79 
 
 		 218 aa  162  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  45.1 
 
 		 228 aa  161  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  44 
 
 		 219 aa  158  7e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  47.57 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  45.87 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2151  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  37.38 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2304  HAD family hydrolase  41.12 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652895  hitchhiker  0.000448515 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2072  HAD family hydrolase  42.86 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000098787  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0131  HAD family hydrolase  38.86 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  39.05 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  42.36 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1729  phosphoglycolate phosphatase  39.81 
 
 		 213 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.970974  hitchhiker  0.00217318 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0576  phosphoglycolate phosphatase  43.75 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.475969  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0122  haloacid dehalogenase-like hydrolase  38.6 
 
 		 236 aa  141  9e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.817509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2056  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.1 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0324232  unclonable  0.00000000000163854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2060  HAD family hydrolase  40.1 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00381556  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2406  HAD family hydrolase  40.1 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0211635  unclonable  0.0000117739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1970  HAD family hydrolase  40.58 
 
 		 224 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000840588  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2289  HAD family hydrolase  39.61 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000247556  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2118  HAD family hydrolase  34.93 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2065  HAD family hydrolase  39.02 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0943577  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2414  phosphoglycolate phosphatase, putative  39.6 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2132  HAD family hydrolase  37.62 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1917  HAD family hydrolase  41.21 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0123365  hitchhiker  0.0000000762533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2061  HAD family hydrolase  40.7 
 
 		 224 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0183643  unclonable  0.0000224709 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  38.03 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  38.03 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  35.81 
 
 		 225 aa  128  6e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  39.44 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  37.96 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2305  HAD family hydrolase  35.75 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000065885 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3364  HAD family hydrolase  44.55 
 
 		 221 aa  125  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  36.15 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  36.41 
 
 		 226 aa  122  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  35.82 
 
 		 214 aa  121  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  37.04 
 
 		 227 aa  121  7e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  37.33 
 
 		 272 aa  121  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  38.71 
 
 		 461 aa  121  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  36.28 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>