144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0887 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  100 
 
 		 3501 aa  6857    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  94.34 
 
 		 3552 aa  5553    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  59.44 
 
 		 3079 aa  2488    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  35.47 
 
 		 3131 aa  1077    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  34.37 
 
 		 3141 aa  972    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  36.43 
 
 		 3301 aa  835    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  60.26 
 
 		 2984 aa  2388    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  52.2 
 
 		 3004 aa  830    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  56.36 
 
 		 3028 aa  2370    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  35.77 
 
 		 3144 aa  1110    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  36.02 
 
 		 3141 aa  1103    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  34.25 
 
 		 3141 aa  967    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  49.49 
 
 		 2782 aa  744    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.52 
 
 		 3020 aa  1332    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  37.11 
 
 		 3322 aa  622  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.2 
 
 		 5981 aa  582  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0071  hemagglutinin-related protein  57.38 
 
 		 541 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.71 
 
 		 3602 aa  472  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  34.96 
 
 		 3165 aa  456  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  32.94 
 
 		 3081 aa  416  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  28.71 
 
 		 4966 aa  394  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  34.15 
 
 		 3563 aa  373  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  37.44 
 
 		 2421 aa  372  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  33.65 
 
 		 3443 aa  370  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  32.52 
 
 		 5212 aa  369  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  31.88 
 
 		 3350 aa  367  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.12 
 
 		 3785 aa  367  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3151  adhesin  29.67 
 
 		 2758 aa  365  1e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  33.26 
 
 		 6274 aa  362  5e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  37.83 
 
 		 2588 aa  358  6.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.95 
 
 		 2545 aa  358  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  37.45 
 
 		 2530 aa  357  2e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.44 
 
 		 3128 aa  353  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  34.99 
 
 		 3526 aa  353  4e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.34 
 
 		 2600 aa  352  5e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.96 
 
 		 658 aa  343  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  38.43 
 
 		 2345 aa  334  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.55 
 
 		 3475 aa  332  1.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.82 
 
 		 3967 aa  291  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.21 
 
 		 3040 aa  282  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0043  adhesin/hemagglutinin  41.25 
 
 		 594 aa  276  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  36.36 
 
 		 1998 aa  269  5.999999999999999e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.24 
 
 		 3790 aa  268  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.23 
 
 		 3796 aa  267  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.21 
 
 		 2670 aa  265  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.07 
 
 		 3862 aa  263  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2177  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.06 
 
 		 1730 aa  259  6e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  37.43 
 
 		 3884 aa  253  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  28.82 
 
 		 3159 aa  240  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02991  filamentous haemagglutinin, N-terminal:Adhesin HecA 20-residue repeat x2  35.6 
 
 		 710 aa  239  5.0000000000000005e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.61 
 
 		 3378 aa  234  2e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.61 
 
 		 3480 aa  234  2e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0418  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  34.72 
 
 		 812 aa  229  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740243  normal  0.11734 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1424  adhesin  31.52 
 
 		 2061 aa  215  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.872326 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2723  filamentous haemagglutinin  28.72 
 
 		 3147 aa  213  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  47.24 
 
 		 1723 aa  212  9e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.290227  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2176  adhesin HecA family  31.7 
 
 		 3300 aa  207  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0514  hypothetical protein  31.26 
 
 		 1268 aa  203  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.140024  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0575  hypothetical protein  33.55 
 
 		 1077 aa  200  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  31.85 
 
 		 2536 aa  194  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  33.04 
 
 		 2827 aa  192  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0044  filamentous hemagglutinin  31.71 
 
 		 2904 aa  191  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05770  hemagglutinin-related protein  29.43 
 
 		 2737 aa  187  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1281  haemagglutination activity domain protein  27.25 
 
 		 1270 aa  187  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.326078 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4729  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.47 
 
 		 428 aa  178  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.257698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5133  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.83 
 
 		 721 aa  177  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.532528 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6766  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.15 
 
 		 2818 aa  177  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3717  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.26 
 
 		 923 aa  175  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.562424 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02977  filamentous haemagglutinin  31.87 
 
 		 857 aa  173  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3210  filamentous hemagglutinin family protein  28.79 
 
 		 991 aa  172  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1536  hemagglutination activity domain-containing protein  35.82 
 
 		 2449 aa  165  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.043951  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5361  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.79 
 
 		 2847 aa  165  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0155  filamentous haemagglutinin / adhesin  32.94 
 
 		 1841 aa  162  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02101  putative hemagglutinin-related protein  29.96 
 
 		 2691 aa  160  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386866 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2335  putative transcriptional activator  32.6 
 
 		 2350 aa  159  6e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3791  filamentous haemagglutinin-like protein  39.31 
 
 		 1489 aa  159  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615569 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1682  filamentous haemagglutinin family protein  33.01 
 
 		 1719 aa  157  2.9999999999999998e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7346  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.68 
 
 		 2666 aa  155  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.550949 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0366  protein of unknown function DUF637 hemagglutinin putative  28.11 
 
 		 1571 aa  152  9e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5058  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.36 
 
 		 2786 aa  152  9e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5446  adhesin  30.97 
 
 		 3929 aa  152  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3272  hypothetical protein  28.82 
 
 		 763 aa  152  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.921998  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2848  putative hemagglutinin/hemolysin- related exoprotein  34.99 
 
 		 1038 aa  150  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3270  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1052 aa  149  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1326  hypothetical protein  35.32 
 
 		 915 aa  149  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.987908  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02473  putative hemagglutinin-related protein  36.12 
 
 		 848 aa  140  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335971  normal  0.337547 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0299  hemolysin  36.47 
 
 		 1618 aa  133  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420803  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0521  hypothetical protein  35.94 
 
 		 412 aa  133  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.718593  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4482  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.99 
 
 		 1615 aa  130  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0152  filamentous haemagglutinin  36.39 
 
 		 716 aa  130  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4272  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.66 
 
 		 1508 aa  129  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1521  hypothetical protein  37.12 
 
 		 397 aa  129  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4642  hemolysin  36.05 
 
 		 1651 aa  129  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154721  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5056  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.55 
 
 		 847 aa  129  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.776969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0284  adhesin HecA family  23.73 
 
 		 2651 aa  129  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1449  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.3 
 
 		 1508 aa  127  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.597308 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3183  hemagglutinin-like signal peptide protein  30.79 
 
 		 846 aa  127  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2480  hemagglutinin-like protein  29.09 
 
 		 914 aa  126  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168613  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1756  hemagglutinin, homlog  29.81 
 
 		 905 aa  125  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.982994  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4170  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.28 
 
 		 1508 aa  125  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0207391  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>