185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0871 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  100 
 
 		 137 aa  275  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4712  Serine O-acetyltransferase  75 
 
 		 209 aa  180  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  59.56 
 
 		 140 aa  160  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0624  PilT protein-like  50.37 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.810517  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  47.83 
 
 		 145 aa  126  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4284  prevent-host-death protein  47.1 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.600657  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2934  PilT protein-like  53.24 
 
 		 144 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0713  PilT domain-containing protein  44.93 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000185206  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  45.65 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  45.65 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  43.48 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  44.2 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  41.3 
 
 		 142 aa  114  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2919  PilT protein domain protein  43.88 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5841  PilT domain-containing protein  43.07 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3962  PilT domain-containing protein  41.61 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4336  PilT protein-like  46.1 
 
 		 141 aa  103  9e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.586249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2873  PilT protein domain protein  42.34 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  42.75 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  40.85 
 
 		 140 aa  100  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1880  PilT-type plasmid stability protein  38.52 
 
 		 140 aa  100  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23550  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain protein  39.42 
 
 		 142 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46968  normal  0.640927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3418  PilT protein, N-terminal  40.74 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  44.85 
 
 		 136 aa  98.6  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  41.48 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  40.15 
 
 		 137 aa  97.1  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2084  PilT protein-like protein  41.3 
 
 		 135 aa  96.7  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0074  PilT protein domain protein  37.23 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1400  PilT protein domain protein  38.41 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.310156 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3474  PilT domain-containing protein  39.86 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  36.03 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3697  PilT protein domain protein  37.23 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4334  PilT domain-containing protein  40.15 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6277  PilT protein domain protein  42.65 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.466445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  39.44 
 
 		 140 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4574  PilT domain-containing protein  40.15 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0680986  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  39.13 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3192  PilT domain-containing protein  37.5 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  39.26 
 
 		 137 aa  90.1  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3420  PilT protein domain protein  41.43 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.753141 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0018  plasmid stability protein StbB  35.77 
 
 		 139 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0242004  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1602  PilT protein-like  39.42 
 
 		 135 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0469  PilT domain-containing protein  36.5 
 
 		 141 aa  89.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1213  PilT domain-containing protein  39.26 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  35.77 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1070  PilT protein-like protein  37.04 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0805  PilT protein-like  38.97 
 
 		 139 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  36.69 
 
 		 151 aa  87  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4019  PilT protein-like  36.96 
 
 		 144 aa  87  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3575  PilT protein domain protein  35.56 
 
 		 140 aa  86.7  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00704853  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  36.88 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  36.88 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  36.88 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4543  PilT protein domain protein  39.26 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  38.73 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  38.73 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1390  PilT domain-containing protein  40.14 
 
 		 141 aa  84.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1045  PilT domain-containing protein  34.07 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0543043  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2505  PilT protein domain protein  38.85 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0679  putative plasmid stability protein  38.13 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.536522  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1456  PilT protein domain protein  35.29 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.208651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1780  plasmid stability protein, putative  35.29 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  34.78 
 
 		 141 aa  84  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3569  PilT protein domain protein  35.29 
 
 		 140 aa  84  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4619  PilT domain-containing protein  36.5 
 
 		 159 aa  84  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4008  putative PilT-like protein  38.57 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1045  putative nucleic acid-binding protein  33.09 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.883513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3889  PilT domain-containing protein  36.96 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6402  PilT protein domain protein  37.86 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4674  PilT protein domain protein  36.5 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0728  PilT protein domain protein  37.96 
 
 		 141 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2795  PilT domain-containing protein  30.37 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.517688  normal  0.128803 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0076  PilT protein domain protein  34.31 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3902  PilT domain-containing protein  38.85 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4710  PilT domain-containing protein  32.59 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4764  PilT domain-containing protein  36.5 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.310304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1214  PilT domain-containing protein  34.31 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3521  PilT domain-containing protein  34.31 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764562 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4188  PilT domain-containing protein  32.59 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.990127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2075  PilT domain-containing protein  33.82 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0526989 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3180  PilT domain-containing protein  32.61 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5181  PilT domain-containing protein  38.85 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4364  PilT domain-containing protein  38.13 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3455  PilT protein, N-terminal  35.77 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0057  PilT protein domain protein  35.29 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.033229 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4210  PilT domain-containing protein  37.23 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.242184  normal  0.98897 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1876  plasmid stabilization protein StbB-like  35.77 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.417395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3163  PilT protein domain protein  38.41 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.732092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3797  PilT domain-containing protein  31.85 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238578 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2302  plasmid stabilization protein  34.56 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3903  PilT protein-like  37.41 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4465  PilT domain-containing protein  37.41 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5837  PilT domain-containing protein  37.41 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3027  PilT protein domain protein  32.35 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0896  PilT protein-like  31.11 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4575  PilT protein-like  35.71 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2640  PilT domain-containing protein  32.35 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4151  PilT protein-like  34.81 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0792  nucleic acid binding protein  35.85 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.705991  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3346  PilT protein-like  40.43 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>