More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0813 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  100 
 
 
379 aa  766  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  72.21 
 
 
410 aa  525  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  72.47 
 
 
417 aa  522  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  66.57 
 
 
401 aa  453  1e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  63.9 
 
 
405 aa  445  1e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  63.9 
 
 
405 aa  445  1e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  64.45 
 
 
402 aa  438  1e-122  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  62.32 
 
 
401 aa  435  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  62.18 
 
 
403 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  64.47 
 
 
403 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  65.51 
 
 
402 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  67.52 
 
 
402 aa  428  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  61.38 
 
 
400 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  61.96 
 
 
406 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  62.03 
 
 
408 aa  416  1e-115  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  58.64 
 
 
406 aa  416  1e-115  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  52.84 
 
 
414 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  59.18 
 
 
407 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  54.26 
 
 
414 aa  339  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  50.58 
 
 
446 aa  338  7e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  51.57 
 
 
416 aa  327  2e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  56.52 
 
 
412 aa  319  6e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  47.8 
 
 
434 aa  276  6e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  39.27 
 
 
412 aa  269  6e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.11038e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  46.47 
 
 
426 aa  262  6e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  35.06 
 
 
369 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  35.39 
 
 
369 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  35.39 
 
 
369 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  32.68 
 
 
409 aa  160  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  33.56 
 
 
410 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  34.15 
 
 
451 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.32 
 
 
417 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  32.01 
 
 
416 aa  156  5e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  34.62 
 
 
420 aa  155  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.11 
 
 
453 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  38.46 
 
 
370 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  33.66 
 
 
461 aa  149  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  33.66 
 
 
461 aa  149  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.61 
 
 
412 aa  149  7e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.61 
 
 
412 aa  149  7e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  31.52 
 
 
457 aa  148  2e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  36.69 
 
 
414 aa  146  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  34.87 
 
 
361 aa  141  2e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  35.87 
 
 
372 aa  135  1e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.21 
 
 
406 aa  132  1e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33 
 
 
415 aa  131  2e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  1.98483e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  34.42 
 
 
408 aa  131  2e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  1.18836e-05 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  33.11 
 
 
417 aa  130  5e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.06 
 
 
411 aa  129  1e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  31.56 
 
 
431 aa  128  2e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  34.42 
 
 
408 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.11 
 
 
400 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  33.1 
 
 
369 aa  127  4e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  31.29 
 
 
407 aa  126  8e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.78 
 
 
409 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  29.25 
 
 
409 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.05 
 
 
408 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  29.82 
 
 
425 aa  122  1e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  32.61 
 
 
431 aa  121  2e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  32.12 
 
 
427 aa  121  2e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  31.39 
 
 
440 aa  122  2e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  34.28 
 
 
376 aa  121  2e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  29.09 
 
 
425 aa  121  2e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  31.05 
 
 
408 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  30.04 
 
 
430 aa  120  5e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.05 
 
 
408 aa  119  1e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  5.59992e-07 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  33.33 
 
 
359 aa  119  1e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  32.03 
 
 
408 aa  118  2e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  30.29 
 
 
407 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.7 
 
 
405 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  33.99 
 
 
367 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.78626e-15  hitchhiker  6.08481e-12 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  29.5 
 
 
425 aa  116  7e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.78 
 
 
501 aa  115  9e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  30.28 
 
 
363 aa  115  1e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  32.36 
 
 
428 aa  115  2e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  32.36 
 
 
428 aa  115  2e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  5.38057e-06 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  33.09 
 
 
501 aa  111  2e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  31.45 
 
 
409 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08058  sulfite oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02190)  29.04 
 
 
380 aa  109  8e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  32.39 
 
 
429 aa  109  9e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  30.14 
 
 
437 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  29.2 
 
 
420 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  30.18 
 
 
423 aa  107  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  29.35 
 
 
427 aa  106  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  30.39 
 
 
453 aa  106  7e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  4.33271e-09  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08449  nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10420)  30.91 
 
 
1016 aa  106  7e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.92163  normal  0.772146 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  29.23 
 
 
445 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  3.89133e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  32.5 
 
 
402 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  32.5 
 
 
406 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  29.6 
 
 
437 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  29.97 
 
 
406 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  26.59 
 
 
505 aa  102  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.52 
 
 
414 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.57 
 
 
465 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  32.01 
 
 
414 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  29.08 
 
 
419 aa  99.8  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.84 
 
 
418 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  29 
 
 
414 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.84 
 
 
418 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  30.36 
 
 
431 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>