More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0804 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0804  transcription regulator protein  100 
 
 		 302 aa  603  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.540321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0750  transcriptional regulator, LysR family  87.42 
 
 		 302 aa  507  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0820  transcriptional regulator, LysR family  86.09 
 
 		 302 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.194336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0854  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  67.8 
 
 		 297 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2823  transcriptional regulator, LysR family  56.84 
 
 		 305 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135524  normal  0.141091 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1905  LysR family transcriptional regulator  57.62 
 
 		 304 aa  292  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.204877 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4554  LysR family transcriptional regulator  57.2 
 
 		 305 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1312  LysR family transcriptional regulator  56.84 
 
 		 305 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0843658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0928  LysR family transcriptional regulator  58.3 
 
 		 304 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1410  LysR family transcriptional regulator  58.3 
 
 		 304 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.807333  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1329  LysR family transcriptional regulator  57.99 
 
 		 304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1290  LysR family transcriptional regulator  56.84 
 
 		 309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109093  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1388  LysR family transcriptional regulator  58.3 
 
 		 304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.275315 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1612  LysR family transcriptional regulator  55.44 
 
 		 301 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0896  LysR family transcriptional regulator  57.99 
 
 		 321 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0937961  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1817  hypothetical protein  57.99 
 
 		 321 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.504025  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0454  LysR family transcriptional regulator  57.99 
 
 		 341 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.499714  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1424  LysR family transcriptional regulator  57.99 
 
 		 337 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18619  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1638  transcriptional regulator  57.99 
 
 		 341 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1661  LysR family transcriptional regulator  57.99 
 
 		 341 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0706  LysR family transcriptional regulator  57.99 
 
 		 341 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.897426  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2660  LysR family transcriptional regulator  57.62 
 
 		 321 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0486  LysR substrate-binding  49.83 
 
 		 298 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09570  LysR family transcriptional regulator  51.03 
 
 		 284 aa  245  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0895  putative transcriptional regulator  50.69 
 
 		 284 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0899891  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3677  transcriptional regulator, LysR family  46.58 
 
 		 292 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0272  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 294 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0121  transcriptional regulator, LysR family  46.85 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5034  transcriptional regulator, LysR family  43.54 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1558  LysR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1668  transcriptional regulator, LysR family  41.67 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5316  transcriptional regulator, LysR family  43.2 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.680979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1939  transcriptional regulator, LysR family  42.01 
 
 		 290 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514267  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0208  transcriptional regulator, LysR family  49.82 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.502619  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0214  transcription regulator protein  42.71 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46170  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 290 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0324298 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3275  LysR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812122 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1652  LysR family transcriptional regulator  45.17 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0547251  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3926  putative transcriptional regulator  42.66 
 
 		 290 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0189  LysR family transcriptional regulator  50.37 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2570  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2472  LysR family substrate binding transcriptional regulator  40.97 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3012  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  40.97 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.450438  hitchhiker  0.000703378 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1628  putative LysR substrate binding domain  38.68 
 
 		 290 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1647  putative LysR substrate binding domain  38.68 
 
 		 290 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0636291  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1812  putative LysR substrate binding domain-containing protein  38.68 
 
 		 290 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1636  putative LysR substrate binding domain  38.68 
 
 		 290 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1695  putative LysR substrate binding domain  38.68 
 
 		 290 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2646  LysR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1646  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3152  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2562  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1726  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 293 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2703  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 289 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664835 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5127  LysR family transcriptional regulator  46.95 
 
 		 295 aa  211  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153016  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01483  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.63 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1608  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2120  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296049  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2004  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01494  hypothetical protein  37.63 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2132  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.54811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2893  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0897253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2139  transcriptional regulator, LysR family  37.33 
 
 		 293 aa  209  7e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487971  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2661  transcriptional regulator, LysR family  39.58 
 
 		 292 aa  208  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.826395  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1680  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0210  transcriptional regulator, LysR family  42.05 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2395  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.54 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0377245  normal  0.580313 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1747  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 		 283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.337394  normal  0.482419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3818  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.173651 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3522  transcriptional regulator, LysR family  38.7 
 
 		 283 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3501  transcriptional regulator, LysR family  37.67 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2410  transcriptional regulator, LysR family  39.58 
 
 		 287 aa  196  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.975942  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3514  transcriptional regulator, LysR family  37.67 
 
 		 283 aa  195  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3297  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 283 aa  195  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3557  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 283 aa  195  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.423553  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4525  LysR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3511  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3211  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3267  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486644  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1385  LysR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.134108  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4032  LysR family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 297 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660064  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1450  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 297 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7088  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3213  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 283 aa  185  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.146504  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2203  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.460556  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2056  HTH-type transcriptional regulator GltR  35.02 
 
 		 285 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5516  LysR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 291 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0587498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5880  LysR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 291 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311857  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6389  LysR family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 291 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0907959  normal  0.0995777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4716  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1081  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8516  transcriptional regulator, LysR family  39.57 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0280  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 283 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0071  putative transcriptional regulator LysR-type  36.36 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120497  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5687  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 295 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7214  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2310  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10830  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 291 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000133975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0247  transcriptional regulator, LysR family  31.16 
 
 		 288 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0191  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>