More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0780 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3663  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  61.63 
 
 		 565 aa  719    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 568 aa  1179    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324898  decreased coverage  0.00366167 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4457  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.65 
 
 		 563 aa  657    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.346578  hitchhiker  0.00901661 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3157  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  61.87 
 
 		 569 aa  719    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0823  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  76.37 
 
 		 571 aa  922    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0594953  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0878  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  60.18 
 
 		 567 aa  704    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0253772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0904  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.25 
 
 		 559 aa  671    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5034  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.26 
 
 		 565 aa  648    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449206  normal  0.69733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3469  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  62.95 
 
 		 559 aa  702    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0797  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  88.2 
 
 		 568 aa  1069    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.058688  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2635  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  75.49 
 
 		 566 aa  894    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000204928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4545  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  59.93 
 
 		 564 aa  689    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0727  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  88.56 
 
 		 568 aa  1067    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.538259 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2339  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.91 
 
 		 553 aa  615  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1943  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.3 
 
 		 560 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6849  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.36 
 
 		 586 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3549  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.89 
 
 		 575 aa  597  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.918334  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2341  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.05 
 
 		 560 aa  592  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4502  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.16 
 
 		 564 aa  588  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404  normal  0.065196 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5773  AMP-dependent synthetase and ligase  52.55 
 
 		 563 aa  566  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4155  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.09 
 
 		 584 aa  559  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17370  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.27 
 
 		 551 aa  552  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0381221  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0330  AMP-dependent synthetase and ligase  46.59 
 
 		 559 aa  549  1e-155  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.648816  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2519  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.46 
 
 		 562 aa  506  9.999999999999999e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5508  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  46.13 
 
 		 675 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.46 
 
 		 561 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.11 
 
 		 563 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.93 
 
 		 563 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.11 
 
 		 563 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.08 
 
 		 561 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.11 
 
 		 563 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.19 
 
 		 582 aa  372  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.11 
 
 		 582 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.91 
 
 		 561 aa  369  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.63 
 
 		 561 aa  369  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.19 
 
 		 561 aa  365  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  36.7 
 
 		 561 aa  362  8e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  36.22 
 
 		 557 aa  362  9e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  36.7 
 
 		 559 aa  358  9.999999999999999e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  36.73 
 
 		 561 aa  354  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  36.08 
 
 		 566 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1072  AMP-dependent synthetase and ligase  37.29 
 
 		 532 aa  352  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334483 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  37.72 
 
 		 552 aa  345  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  38.37 
 
 		 549 aa  345  2e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  36.11 
 
 		 577 aa  344  2e-93  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  35.49 
 
 		 579 aa  342  2e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  35.65 
 
 		 577 aa  339  7e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  34.05 
 
 		 551 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  35.95 
 
 		 555 aa  334  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  36.69 
 
 		 539 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  37.19 
 
 		 565 aa  331  3e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 583 aa  329  8e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  36.73 
 
 		 521 aa  325  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  36.75 
 
 		 512 aa  325  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3685  AMP-dependent synthetase and ligase  36.76 
 
 		 562 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4793  AMP-dependent synthetase and ligase  37.2 
 
 		 537 aa  322  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0662  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 		 548 aa  317  3e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.27921  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  36.49 
 
 		 555 aa  317  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  34.37 
 
 		 585 aa  316  8e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 584 aa  314  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 		 569 aa  313  5.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.61 
 
 		 514 aa  312  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  34.02 
 
 		 577 aa  312  1e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3362  AMP-dependent synthetase and ligase  36.07 
 
 		 562 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1683  AMP-dependent synthetase and ligase  35.36 
 
 		 535 aa  311  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3898  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 		 553 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 536 aa  304  3.0000000000000004e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 		 495 aa  301  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 662 aa  301  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2975  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 		 551 aa  299  8e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 		 559 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 		 527 aa  298  2e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.02 
 
 		 510 aa  297  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.21 
 
 		 510 aa  297  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.83 
 
 		 510 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.83 
 
 		 510 aa  296  8e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0064  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase protein  34.98 
 
 		 601 aa  296  9e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.83 
 
 		 510 aa  296  9e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.83 
 
 		 510 aa  296  9e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.83 
 
 		 510 aa  296  9e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.83 
 
 		 510 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.65 
 
 		 510 aa  295  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.83 
 
 		 510 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  32.96 
 
 		 498 aa  295  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  33.87 
 
 		 561 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.87 
 
 		 561 aa  293  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  33.87 
 
 		 561 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.87 
 
 		 561 aa  293  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.87 
 
 		 561 aa  293  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.87 
 
 		 561 aa  293  4e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 		 583 aa  293  6e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.87 
 
 		 583 aa  293  6e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1727  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 		 551 aa  293  9e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00049699  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3734  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.2 
 
 		 560 aa  292  9e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.862355  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.8 
 
 		 512 aa  292  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 		 590 aa  292  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3148  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.22 
 
 		 560 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  33.16 
 
 		 561 aa  291  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  34.34 
 
 		 569 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  33.94 
 
 		 564 aa  291  3e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>