More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0779 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  100 
 
 		 280 aa  565  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  84.34 
 
 		 281 aa  481  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  83.99 
 
 		 281 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  65.71 
 
 		 280 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  63.35 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  59.64 
 
 		 282 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  60 
 
 		 282 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  58.72 
 
 		 282 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  56.23 
 
 		 282 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  55.87 
 
 		 282 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  55.87 
 
 		 282 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  55.16 
 
 		 282 aa  292  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  56.23 
 
 		 282 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  56.14 
 
 		 282 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  56.14 
 
 		 282 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  55.52 
 
 		 301 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  56.23 
 
 		 282 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  55.87 
 
 		 282 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  55.16 
 
 		 282 aa  285  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  55.9 
 
 		 918 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  47.31 
 
 		 280 aa  224  9e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  40.14 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  43.48 
 
 		 302 aa  208  7e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  42.38 
 
 		 302 aa  208  9e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  42.05 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2496  thioredoxin  53.45 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  40.2 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  39.93 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  42.86 
 
 		 314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  43.87 
 
 		 312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  42.91 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  40 
 
 		 302 aa  192  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  42.25 
 
 		 293 aa  192  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  38.57 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  38.41 
 
 		 306 aa  188  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  38.95 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  42.61 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  39.21 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  39.72 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  39.72 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  37 
 
 		 341 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  38.06 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  37.37 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  39.02 
 
 		 302 aa  179  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  39.62 
 
 		 315 aa  178  7e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  39.02 
 
 		 302 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  39.45 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  38.68 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  37.69 
 
 		 305 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  38.95 
 
 		 286 aa  176  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  38.75 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  39.69 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  37.33 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  36.93 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  37.59 
 
 		 320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  37.37 
 
 		 290 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  41.35 
 
 		 287 aa  172  5.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3864  thioredoxin domain-containing protein  36.73 
 
 		 295 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  37.72 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  39.58 
 
 		 289 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  37.45 
 
 		 306 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  38.11 
 
 		 290 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  36.07 
 
 		 289 aa  169  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  33.94 
 
 		 287 aa  168  9e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  37.45 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  39.58 
 
 		 289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  38.57 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  37.22 
 
 		 306 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  39.86 
 
 		 306 aa  165  8e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  38.03 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  37.14 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  35.92 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  37.68 
 
 		 290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  39.76 
 
 		 282 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  35.92 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  33.69 
 
 		 285 aa  162  8.000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  39.71 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  36.26 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  36.18 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  38.41 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  37.59 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  38.55 
 
 		 307 aa  158  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  32.17 
 
 		 287 aa  159  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  36.79 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  33.1 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  37.09 
 
 		 290 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  35.21 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  37.06 
 
 		 289 aa  155  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  37.65 
 
 		 286 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  37.68 
 
 		 304 aa  155  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  35.97 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  38.85 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  35.19 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  36.46 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  37.5 
 
 		 336 aa  152  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  36.52 
 
 		 286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  34.15 
 
 		 303 aa  151  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  33.8 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  36.73 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  33.8 
 
 		 304 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>