More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0769 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  100 
 
 		 734 aa  1480    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  61.96 
 
 		 699 aa  800    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  61.26 
 
 		 699 aa  794    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  62.11 
 
 		 699 aa  803    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  61.96 
 
 		 699 aa  801    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1416  glycosy hydrolase family protein  61.3 
 
 		 467 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0462  putative beta-N-acetylglucosaminidase  61.3 
 
 		 467 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0430321  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.17 
 
 		 598 aa  524  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  40.62 
 
 		 688 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  34.38 
 
 		 633 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  32.79 
 
 		 845 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  32.93 
 
 		 673 aa  298  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.87 
 
 		 698 aa  297  6e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  31.97 
 
 		 637 aa  289  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.82 
 
 		 543 aa  245  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  33.44 
 
 		 604 aa  239  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.56 
 
 		 528 aa  227  7e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  38.01 
 
 		 631 aa  225  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.18 
 
 		 558 aa  223  7e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  33.6 
 
 		 444 aa  223  7e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.71 
 
 		 596 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  31.96 
 
 		 520 aa  221  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.18 
 
 		 600 aa  221  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  33.12 
 
 		 618 aa  213  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  36.97 
 
 		 656 aa  210  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.34 
 
 		 543 aa  209  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  36.32 
 
 		 427 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  34.29 
 
 		 552 aa  201  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  37.44 
 
 		 498 aa  201  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  38.42 
 
 		 499 aa  197  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  34.07 
 
 		 517 aa  197  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  37.23 
 
 		 420 aa  196  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  36.6 
 
 		 966 aa  196  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  37.99 
 
 		 511 aa  194  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.1 
 
 		 580 aa  191  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.68 
 
 		 478 aa  191  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.27 
 
 		 594 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  29.58 
 
 		 990 aa  187  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.83 
 
 		 511 aa  184  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  41.47 
 
 		 365 aa  183  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  31.44 
 
 		 541 aa  183  1e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.47 
 
 		 365 aa  183  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.96 
 
 		 365 aa  181  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  41.04 
 
 		 503 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  28.67 
 
 		 971 aa  178  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  39.36 
 
 		 490 aa  179  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  32.45 
 
 		 1003 aa  178  3e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  27.26 
 
 		 589 aa  178  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.44 
 
 		 426 aa  177  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.01 
 
 		 534 aa  177  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.01 
 
 		 534 aa  177  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.07 
 
 		 484 aa  177  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.43 
 
 		 387 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  36.77 
 
 		 520 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.69 
 
 		 568 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  35.95 
 
 		 370 aa  173  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.46 
 
 		 490 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.22 
 
 		 504 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.22 
 
 		 382 aa  172  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  38.82 
 
 		 365 aa  172  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.64 
 
 		 976 aa  171  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  30.33 
 
 		 992 aa  171  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.71 
 
 		 1018 aa  171  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  27.38 
 
 		 997 aa  171  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.98 
 
 		 1002 aa  170  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  36.07 
 
 		 542 aa  170  9e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  30.67 
 
 		 592 aa  169  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.37 
 
 		 591 aa  169  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.51 
 
 		 582 aa  169  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.71 
 
 		 375 aa  168  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  32.53 
 
 		 1012 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  32.97 
 
 		 375 aa  168  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  32.73 
 
 		 363 aa  167  5.9999999999999996e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.44 
 
 		 953 aa  167  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  36.34 
 
 		 492 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  33.03 
 
 		 361 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0128  glycoside hydrolase family 3 protein  40.3 
 
 		 475 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.174382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  34.67 
 
 		 543 aa  165  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.11 
 
 		 583 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  32.81 
 
 		 575 aa  163  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.88 
 
 		 379 aa  162  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  33.57 
 
 		 481 aa  161  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.57 
 
 		 398 aa  160  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  29.77 
 
 		 528 aa  160  8e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.72 
 
 		 552 aa  160  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.55 
 
 		 373 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  32.36 
 
 		 393 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  33.82 
 
 		 538 aa  158  4e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  28.41 
 
 		 624 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  31.59 
 
 		 585 aa  156  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2414  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 		 373 aa  156  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.91 
 
 		 392 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2890  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.7 
 
 		 553 aa  156  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.51 
 
 		 365 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  34.14 
 
 		 378 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.78 
 
 		 482 aa  154  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1007 aa  154  5e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  32.15 
 
 		 382 aa  154  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  31.72 
 
 		 575 aa  153  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  32.63 
 
 		 374 aa  152  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>