89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0739 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0739  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  720    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0732  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  87.8 
 
 		 371 aa  622  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.90241  normal  0.157208 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0688  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  87.53 
 
 		 371 aa  620  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277778  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2671  hypothetical protein  76.15 
 
 		 371 aa  568  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00350575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0799  YeeE/YedE  78.32 
 
 		 373 aa  560  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236196  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1028  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  59.4 
 
 		 373 aa  441  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  59.13 
 
 		 373 aa  434  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.865482  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1987  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  64.56 
 
 		 374 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4041  YeeE/YedE  59.33 
 
 		 367 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1941  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  54.47 
 
 		 371 aa  361  9e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.368246 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0777  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  58.58 
 
 		 368 aa  351  8.999999999999999e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226768  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3776  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50.27 
 
 		 373 aa  304  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1485  putative transmembrane protein  51.77 
 
 		 374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2201  transmembrane protein  39.95 
 
 		 420 aa  248  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000866574 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1667  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40.42 
 
 		 423 aa  232  6e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0571  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.63 
 
 		 423 aa  222  8e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.484751  normal  0.560137 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2224  hypothetical protein  39.37 
 
 		 421 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4152  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.09 
 
 		 347 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0839918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2872  hypothetical protein  39.24 
 
 		 357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2440  putative transmembrane protein  38.46 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1966  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  39.38 
 
 		 421 aa  192  9e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2696  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.57 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0151  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39 
 
 		 345 aa  182  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.84 
 
 		 351 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317851  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3665  YeeE/YedE family membrane protein  36.76 
 
 		 352 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1268  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.24 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4968  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.93 
 
 		 400 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4381  hypothetical protein  39.37 
 
 		 351 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4379  hypothetical protein  34.73 
 
 		 400 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.204255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1528  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.89 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4263  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.03 
 
 		 400 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409839  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3923  hypothetical protein  36.06 
 
 		 348 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.554926 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2813  hypothetical protein  32.69 
 
 		 362 aa  132  7.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4145  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.43 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689999  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3126  YeeE/YedE  30 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4366  hypothetical protein  31.27 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4250  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.18 
 
 		 363 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.778498  normal  0.233136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4955  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.1 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3774  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.12 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3909  hypothetical protein  28.89 
 
 		 353 aa  90.9  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.192183 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1097  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.38 
 
 		 355 aa  89.4  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3681  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  26.33 
 
 		 366 aa  89.4  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  26.44 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.62 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  27.55 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  27.55 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  27.55 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  27.24 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  27.24 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  26.54 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.04 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  27.43 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4161  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.77 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.93 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  25 
 
 		 359 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  28.86 
 
 		 359 aa  72  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  25 
 
 		 359 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  29.01 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  25.88 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  28.57 
 
 		 375 aa  67  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.49 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.76 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.09 
 
 		 332 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0372  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  22.25 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1287  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.21 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0226086  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04350  YeeE/YedE family protein (DUF395)  24.48 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217444 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1601  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.59 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382495  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  27.32 
 
 		 371 aa  53.1  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.78 
 
 		 215 aa  51.6  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.42 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1691  hypothetical protein  25.33 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.187562 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.91 
 
 		 354 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4545  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.8 
 
 		 407 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2596  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.46 
 
 		 171 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0045  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.09 
 
 		 216 aa  47.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0175  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.4 
 
 		 176 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121367 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2856  hypothetical protein  30.56 
 
 		 175 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5150  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.47 
 
 		 416 aa  46.6  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00907952  normal  0.925389 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0829  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.86 
 
 		 409 aa  46.6  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.26 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1978  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.26 
 
 		 174 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.248725  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3786  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  52.38 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1478  putative inner membrane protein  32.98 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1489  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.14 
 
 		 412 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2964  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  50 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1179  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  47.62 
 
 		 407 aa  43.1  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264633 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71670  hypothetical protein  42.31 
 
 		 404 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.786799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6218  hypothetical protein  42.31 
 
 		 404 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0719  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.71 
 
 		 183 aa  43.1  0.008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>