More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0590 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  100 
 
 		 178 aa  355  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  81.44 
 
 		 171 aa  275  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  80.24 
 
 		 171 aa  270  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 193 aa  176  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  42.14 
 
 		 172 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 170 aa  107  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  36.6 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 179 aa  97.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  37.41 
 
 		 157 aa  93.6  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  35.82 
 
 		 162 aa  92  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 156 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  34.33 
 
 		 156 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 163 aa  89.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 156 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  38.76 
 
 		 158 aa  87.8  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  38.41 
 
 		 169 aa  85.5  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 197 aa  85.5  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  34.27 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  32.12 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 303 aa  71.2  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  35 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 152 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 143 aa  62  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  33.01 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  31.72 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  40.96 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  32.74 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  32.74 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  32.74 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  32.74 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  32.74 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  32.74 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  32.74 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  32.74 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>