More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0529 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0529  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  100 
 
 		 255 aa  511  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0265894  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0421  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  81.78 
 
 		 270 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0406  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  79.61 
 
 		 270 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.122176 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  58.5 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  58.1 
 
 		 261 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  57.71 
 
 		 261 aa  279  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  58.78 
 
 		 258 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  58.78 
 
 		 258 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  58.78 
 
 		 258 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0721  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  54.96 
 
 		 270 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.317107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0223  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  54.58 
 
 		 270 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0887  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  54.58 
 
 		 270 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2435  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  54.58 
 
 		 270 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2355  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  54.58 
 
 		 270 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  54.58 
 
 		 270 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  55.28 
 
 		 245 aa  271  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0706  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  53.76 
 
 		 273 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0589  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  57.96 
 
 		 437 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  58.16 
 
 		 237 aa  268  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0512  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  56.54 
 
 		 255 aa  230  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0410  hypothetical protein  66.88 
 
 		 153 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.135617 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  45.7 
 
 		 274 aa  186  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3331  protein of unknown function UPF0054  67.12 
 
 		 153 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.109047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0628  hypothetical protein  67.12 
 
 		 153 aa  182  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.308433 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  54.36 
 
 		 152 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4066  hypothetical protein  55.41 
 
 		 154 aa  159  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0508  hypothetical protein  55.41 
 
 		 151 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0737  hypothetical protein  56.46 
 
 		 148 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208296  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4096  hypothetical protein  56.08 
 
 		 154 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3240  hypothetical protein  55.7 
 
 		 149 aa  155  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4242  hypothetical protein  58.82 
 
 		 152 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.912451  normal  0.436066 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3702  hypothetical protein  55.33 
 
 		 152 aa  152  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.918527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4667  protein of unknown function UPF0054  59.4 
 
 		 152 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  47.97 
 
 		 157 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0491  protein of unknown function UPF0054  55.33 
 
 		 152 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  50.99 
 
 		 149 aa  148  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  48.41 
 
 		 158 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  48.43 
 
 		 189 aa  145  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  50.32 
 
 		 162 aa  145  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  55.22 
 
 		 168 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  46.5 
 
 		 158 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  49.32 
 
 		 149 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  51.95 
 
 		 160 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1860  hypothetical protein  50.36 
 
 		 155 aa  142  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1564  protein of unknown function UPF0054  52.03 
 
 		 157 aa  142  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2704  hypothetical protein  52.34 
 
 		 147 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  45.51 
 
 		 156 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  45.81 
 
 		 153 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  46.88 
 
 		 154 aa  139  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0632  putative metalloprotease  54.17 
 
 		 157 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  50.32 
 
 		 166 aa  138  7.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  46.48 
 
 		 154 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  46.84 
 
 		 161 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3949  hypothetical protein  56.67 
 
 		 160 aa  136  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  48.57 
 
 		 161 aa  135  5e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  48.57 
 
 		 161 aa  135  5e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  45.77 
 
 		 154 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  51.49 
 
 		 154 aa  134  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  45.34 
 
 		 171 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  44.87 
 
 		 156 aa  133  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  45.14 
 
 		 159 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  54.26 
 
 		 137 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  47.18 
 
 		 157 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  44.68 
 
 		 157 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  44.68 
 
 		 157 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  44.68 
 
 		 157 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  44.68 
 
 		 157 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  44.68 
 
 		 157 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4952  putative metalloprotease  50.63 
 
 		 164 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  44.44 
 
 		 159 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4788  putative metalloprotease  52.41 
 
 		 157 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  43.51 
 
 		 161 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4664  putative metalloprotease  52.08 
 
 		 157 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352382  normal  0.808044 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  44.68 
 
 		 157 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  47.37 
 
 		 157 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  45.07 
 
 		 161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4806  hypothetical protein  47.47 
 
 		 166 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4347  putative metalloprotease  47.47 
 
 		 166 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4842  putative metalloprotease  60.17 
 
 		 157 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3781  putative metalloprotease  50.69 
 
 		 151 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.170938 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  45.71 
 
 		 160 aa  124  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  46.81 
 
 		 154 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1182  protein of unknown function UPF0054  46.48 
 
 		 161 aa  123  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  42.21 
 
 		 154 aa  123  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  44.36 
 
 		 154 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0994  putative metalloprotease  44.16 
 
 		 153 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0176097  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0239  hypothetical protein  39.72 
 
 		 153 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1457  hypothetical protein  45.7 
 
 		 150 aa  119  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0929764  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0681  putative metalloprotease  44.85 
 
 		 155 aa  119  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22934  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00627  hypothetical protein  44.12 
 
 		 155 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2967  protein of unknown function UPF0054  44.12 
 
 		 155 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0688  putative metalloprotease  44.12 
 
 		 155 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000843713  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0706  putative metalloprotease  44.12 
 
 		 155 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.202381  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  38.69 
 
 		 158 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00618  hypothetical protein  44.12 
 
 		 155 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3305  putative metalloprotease  44.59 
 
 		 153 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2986  putative metalloprotease  44.12 
 
 		 155 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1002  putative metalloprotease  43.95 
 
 		 153 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00904432  normal  0.0928989 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1832  putative metalloprotease  47.52 
 
 		 157 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0533  hypothetical protein  44.53 
 
 		 158 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.942887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>