More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0522 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0522  putative acyltransferase transmembrane protein  100 
 
 
250 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00553836 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0413  phospholipid/glycerol acyltransferase  88 
 
 
250 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0398  phospholipid/glycerol acyltransferase  87.2 
 
 
250 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.330397  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0505  phospholipid/glycerol acyltransferase  71.2 
 
 
249 aa  374  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123729  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0582  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  66.13 
 
 
259 aa  343  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0444  phospholipid/glycerol acyltransferase  68.83 
 
 
253 aa  343  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0216  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  65.32 
 
 
259 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0699  acyltransferase family protein  65.32 
 
 
259 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0878  phospholipid and glycerol acyltransferase  65.32 
 
 
259 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2348  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  65.32 
 
 
259 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0714  acyltransferase family protein  65.32 
 
 
259 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502533  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2428  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  65.32 
 
 
259 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2730  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  65.32 
 
 
259 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.594764  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0595  phospholipid/glycerol acyltransferase  64.52 
 
 
254 aa  338  5e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6031  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  65.73 
 
 
254 aa  330  9e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2731  phospholipid/glycerol acyltransferase  64.52 
 
 
254 aa  328  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2092  phospholipid/glycerol acyltransferase  64.52 
 
 
254 aa  328  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389917  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2704  phospholipid/glycerol acyltransferase  64.52 
 
 
254 aa  328  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2621  phospholipid/glycerol acyltransferase  63.71 
 
 
254 aa  323  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.741388  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0403  phospholipid/glycerol acyltransferase  62.2 
 
 
252 aa  323  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.355524 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2756  phospholipid/glycerol acyltransferase  63.31 
 
 
254 aa  321  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0684  phospholipid/glycerol acyltransferase  61.54 
 
 
252 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357899  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4015  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  61.13 
 
 
252 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066125  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1866  phospholipid/glycerol acyltransferase  54.66 
 
 
244 aa  301  7.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1570  phospholipid/glycerol acyltransferase  52.63 
 
 
244 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.983241  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0213  phospholipid/glycerol acyltransferase  51.63 
 
 
254 aa  252  5.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0954935 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0447  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.8 
 
 
255 aa  241  7.999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0546  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.99 
 
 
249 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0530  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.58 
 
 
249 aa  238  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0626178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4200  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  47.56 
 
 
256 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3378  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.37 
 
 
254 aa  234  7e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.611462  normal  0.54749 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2345  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.77 
 
 
240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3693  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.34 
 
 
244 aa  232  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.869858  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4741  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.39 
 
 
258 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1291  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.16 
 
 
246 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.302513 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0873  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.4 
 
 
258 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000151489  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0957  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.48 
 
 
252 aa  221  7e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2165  phospholipid/glycerol acyltransferase  51.43 
 
 
283 aa  221  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131735  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4174  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.37 
 
 
251 aa  218  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.969871  normal  0.278578 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0642  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.98 
 
 
236 aa  196  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0548  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.77 
 
 
283 aa  193  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0375  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.28 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3254  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.75 
 
 
248 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0005  acyltransferase  39.92 
 
 
257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00060  putative acyltransferase  40.32 
 
 
257 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3537  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.6 
 
 
250 aa  180  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0406833 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1223  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.33 
 
 
248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6169  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1022  putative acyltransferase  35.47 
 
 
236 aa  174  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508637  normal  0.11203 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2573  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.51 
 
 
251 aa  174  9e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353227 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0009  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.17 
 
 
253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7109  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.62 
 
 
240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.135036 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5696  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.04 
 
 
236 aa  168  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.226605 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2052  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.4 
 
 
257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.850396  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00080  LPA acyltransferase protein  39.65 
 
 
242 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.729238  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2052  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  38.08 
 
 
249 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0009  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.8 
 
 
256 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00250914  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0011  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.94 
 
 
255 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0187  hdtS protein  35.22 
 
 
256 aa  158  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0077  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.89 
 
 
256 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000191625  decreased coverage  0.0000000000082307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0007  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.89 
 
 
274 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000602556  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0074  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.48 
 
 
261 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000544756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0058  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.48 
 
 
261 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000912039  unclonable  0.000000385865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0074  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.48 
 
 
261 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000185774  normal  0.109161 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4243  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.83 
 
 
250 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0459048  hitchhiker  0.000000000931416 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0357  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.8 
 
 
249 aa  150  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2324  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.02 
 
 
254 aa  149  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000640297  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4864  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.36 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.238308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0837  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.4 
 
 
269 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0455  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 
251 aa  145  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0987  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 
260 aa  143  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2584  acyltransferase family protein  35.74 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0011  Protoheme IX farnesyltransferase  36.36 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0946  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.4 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.588556  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2212  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.74 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0579  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.68 
 
 
259 aa  139  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1920  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.78 
 
 
300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1994  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  32.78 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0670  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.08 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.776916  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0043  acyltransferase family protein  33.62 
 
 
268 aa  139  4.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1179  putative 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase (plsC)  34.8 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.68736 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0953  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.51 
 
 
244 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3541  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.47 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.203157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5215  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.06 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2546  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.76 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.845548  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0019  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.42 
 
 
273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.917675  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3088  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.59 
 
 
268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.895958  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3220  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.58 
 
 
236 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.418281  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3257  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.11 
 
 
255 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1149  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase family protein  32.23 
 
 
241 aa  124  2e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0562446  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2439  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.38 
 
 
259 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1297  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.14 
 
 
249 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0473137  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1592  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.78 
 
 
257 aa  121  9e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4030  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.54 
 
 
303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3868  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.2 
 
 
265 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.39528  normal  0.122725 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3562  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.5 
 
 
264 aa  115  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3575  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.37 
 
 
265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.614267  normal  0.0350053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3747  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.82 
 
 
244 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0236961  normal  0.0298826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1538  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.76 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.011975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3010  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.79 
 
 
228 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1756  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.17 
 
 
263 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>