More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0421 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0421  putative multidrug-efflux transporter transmembrane protein  100 
 
 		 387 aa  755    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107977  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0303  major facilitator superfamily MFS_1  91.47 
 
 		 394 aa  649    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0276  major facilitator superfamily MFS_1  91.47 
 
 		 387 aa  649    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0340  major facilitator transporter  69.37 
 
 		 385 aa  518  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  67.02 
 
 		 395 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  67.02 
 
 		 395 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  67.02 
 
 		 385 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6108  major facilitator transporter  66.75 
 
 		 395 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  66.23 
 
 		 395 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2696  major facilitator transporter  66.23 
 
 		 385 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0610  major facilitator superfamily MFS_1  69.63 
 
 		 395 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495333  normal  0.0469856 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0537  major facilitator transporter  67.28 
 
 		 395 aa  501  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6572  major facilitator transporter  65.45 
 
 		 395 aa  501  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4107  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  69.11 
 
 		 385 aa  501  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0499  major facilitator family transporter  66.75 
 
 		 478 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.788244  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3094  major facilitator family transporter  67.02 
 
 		 385 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948927  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0610  major facilitator family transporter  67.02 
 
 		 385 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1528  major facilitator family transporter  67.02 
 
 		 395 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2956  major facilitator family transporter  67.02 
 
 		 385 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0595  major facilitator family transporter  67.02 
 
 		 385 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0062  major facilitator family transporter  67.02 
 
 		 395 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906812  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0780  major facilitator family transporter  66.49 
 
 		 490 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114821  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0314  major facilitator transporter  57.36 
 
 		 418 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0482  major facilitator transporter  57.25 
 
 		 407 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0368  major facilitator transporter  59.48 
 
 		 416 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  50.26 
 
 		 458 aa  381  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2228  major facilitator transporter  51.16 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.568651  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3773  major facilitator transporter  51.17 
 
 		 416 aa  359  4e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  51.28 
 
 		 472 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2691  major facilitator family transporter  52.93 
 
 		 454 aa  351  1e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0232907  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  49.48 
 
 		 465 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  48.06 
 
 		 453 aa  349  6e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0437  major facilitator transporter  53.23 
 
 		 453 aa  346  4e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.630168 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2294  major facilitator family transporter  54.4 
 
 		 458 aa  345  7e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.843575  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  47.29 
 
 		 455 aa  345  8.999999999999999e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0655  major facilitator family transporter  50.77 
 
 		 464 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  50.52 
 
 		 464 aa  343  4e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  47.94 
 
 		 454 aa  339  4e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  47.8 
 
 		 454 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  47.8 
 
 		 454 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  47.8 
 
 		 454 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  47.8 
 
 		 454 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  47.8 
 
 		 454 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  47.8 
 
 		 454 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  47.8 
 
 		 454 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  47.8 
 
 		 454 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3308  major facilitator superfamily MFS_1  53.89 
 
 		 401 aa  335  7.999999999999999e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0575835  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0818  major facilitator transporter  51.29 
 
 		 429 aa  332  5e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  46.51 
 
 		 454 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  46.51 
 
 		 454 aa  331  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  46.51 
 
 		 454 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  46.51 
 
 		 454 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  46.77 
 
 		 454 aa  330  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  46.25 
 
 		 454 aa  329  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3410  major facilitator superfamily MFS_1  53.09 
 
 		 393 aa  329  6e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.357174  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4567  major facilitator transporter  50.63 
 
 		 424 aa  328  8e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.125283 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  46.25 
 
 		 454 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  45.99 
 
 		 456 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  45.99 
 
 		 454 aa  327  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  45.99 
 
 		 454 aa  327  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  45.88 
 
 		 462 aa  324  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3877  major facilitator transporter  50 
 
 		 464 aa  323  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3390  major facilitator transporter  48.33 
 
 		 455 aa  322  8e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  46.91 
 
 		 457 aa  322  9.000000000000001e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1904  major facilitator transporter  49.22 
 
 		 394 aa  322  9.000000000000001e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  49.23 
 
 		 464 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06530  major facilitator family transporter  50.26 
 
 		 462 aa  320  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0804742  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  49.23 
 
 		 464 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1609  major facilitator superfamily MFS_1  48.28 
 
 		 394 aa  316  4e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4065  major facilitator superfamily transporter  53.09 
 
 		 393 aa  315  8e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  49.23 
 
 		 464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0921044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  49.23 
 
 		 464 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0371  major facilitator family transporter  45.31 
 
 		 458 aa  311  9e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034034  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1822  transporter, MFS superfamily  45.45 
 
 		 458 aa  311  2e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000342182  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0867  major facilitator transporter  49.74 
 
 		 454 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551059  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09195  major facilitator transporter  49.74 
 
 		 462 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0308711  normal  0.679663 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  45.74 
 
 		 454 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0295  major facilitator superfamily transporter  49.49 
 
 		 396 aa  302  5.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0449  major facilitator transporter  47.41 
 
 		 460 aa  297  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780134  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3711  major facilitator transporter  45.15 
 
 		 455 aa  297  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000134514  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3821  major facilitator superfamily transporter  51.39 
 
 		 400 aa  295  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.71225 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0995  DNA polymerase III, alpha subunit  45.13 
 
 		 471 aa  293  3e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000812271  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4029  transporter, putative  45.01 
 
 		 455 aa  291  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3754  major facilitator transporter  45.27 
 
 		 455 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000139158  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0580  major facilitator transporter  45.27 
 
 		 455 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000944901  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0586  major facilitator superfamily MFS_1  45.27 
 
 		 455 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000030167  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0555  major facilitator transporter  45.27 
 
 		 455 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3591  major facilitator transporter  45.92 
 
 		 455 aa  290  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3314  major facilitator transporter  44.78 
 
 		 455 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000092062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0515  transporter, putative  46.39 
 
 		 455 aa  288  8e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.97153  normal  0.615177 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0570  major facilitator transporter  45.62 
 
 		 455 aa  287  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000142598  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0422  hypothetical protein  40.96 
 
 		 455 aa  287  2e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0532  major facilitator transporter  46.04 
 
 		 455 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000851019  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0398  hypothetical protein  40.69 
 
 		 455 aa  286  4e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3420  major facilitator transporter  45.92 
 
 		 455 aa  285  7e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000601324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0639  major facilitator transporter  43.48 
 
 		 455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00996628  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4026  major facilitator transporter  46.39 
 
 		 455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000155639  hitchhiker  0.000000003027 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4711  major facilitator superfamily transporter  53.31 
 
 		 420 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0922  major facilitator family transporter  44.53 
 
 		 454 aa  280  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0639  major facilitator transporter  45.73 
 
 		 455 aa  275  7e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000191567  hitchhiker  0.0000048698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>