More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0409 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
262 aa  529  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  95.04 
 
 
262 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  95.04 
 
 
262 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  85.93 
 
 
266 aa  451  1e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  86.54 
 
 
263 aa  452  1e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  81.53 
 
 
261 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  81.53 
 
 
261 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  79.28 
 
 
255 aa  408  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  80.32 
 
 
258 aa  405  1e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  79.92 
 
 
258 aa  405  1e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  79.12 
 
 
258 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  79.12 
 
 
258 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  80.32 
 
 
258 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  78.31 
 
 
255 aa  402  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  79.12 
 
 
258 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  79.12 
 
 
258 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  79.12 
 
 
258 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  79.12 
 
 
258 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  81.12 
 
 
260 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  79.92 
 
 
258 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  79.12 
 
 
258 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  79.92 
 
 
258 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  80.48 
 
 
258 aa  400  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  79.92 
 
 
258 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  79.92 
 
 
258 aa  400  1e-110  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  72.69 
 
 
264 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  71.81 
 
 
268 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  72.65 
 
 
262 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  72.62 
 
 
265 aa  368  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  70.23 
 
 
264 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  73.64 
 
 
263 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0149  putative ATP-binding ABC transporter protein  74.19 
 
 
251 aa  362  5e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  70.24 
 
 
256 aa  361  7e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  72.58 
 
 
268 aa  355  5e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  71.31 
 
 
244 aa  352  3e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  66.41 
 
 
268 aa  346  2e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  66.39 
 
 
240 aa  343  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0347  ABC transporter related  71.43 
 
 
255 aa  340  9e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0336  ABC transporter related  71.43 
 
 
250 aa  340  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.18468  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  68.03 
 
 
240 aa  337  1e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  67.36 
 
 
239 aa  324  8e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0709  ABC transporter related  70.49 
 
 
240 aa  324  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  62.5 
 
 
282 aa  317  9e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  61.54 
 
 
289 aa  314  9e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  65.29 
 
 
282 aa  313  1e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  61.22 
 
 
289 aa  313  2e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  65.16 
 
 
241 aa  313  3e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  61.15 
 
 
290 aa  311  6e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  63.64 
 
 
283 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  60.25 
 
 
241 aa  306  2e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  62.96 
 
 
241 aa  305  4e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  58.61 
 
 
241 aa  305  4e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 
246 aa  305  4e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  59.43 
 
 
241 aa  305  5e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  59.43 
 
 
241 aa  305  6e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  58.61 
 
 
241 aa  304  1e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02228  ABC transporter ATP-binding protein  62.4 
 
 
239 aa  303  2e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0757  ABC transporter ATP-binding protein  62.81 
 
 
240 aa  302  4e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  57.79 
 
 
241 aa  301  5e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  57.92 
 
 
332 aa  301  6e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0671  ABC transporter related  62.81 
 
 
240 aa  301  6e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  60.41 
 
 
250 aa  301  8e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.84 
 
 
241 aa  300  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  59.54 
 
 
263 aa  300  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.65 
 
 
336 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  58.4 
 
 
317 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  57.53 
 
 
259 aa  299  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  61.38 
 
 
247 aa  299  3e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  61.32 
 
 
279 aa  297  9e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  58.54 
 
 
243 aa  297  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  55.43 
 
 
265 aa  297  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  58.78 
 
 
252 aa  296  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2792  ABC transporter, ATPase subunit  60.25 
 
 
241 aa  296  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  59.18 
 
 
316 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  60.91 
 
 
277 aa  296  3e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  60.91 
 
 
254 aa  296  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  58.26 
 
 
249 aa  295  4e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  58.26 
 
 
249 aa  295  4e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.79 
 
 
241 aa  295  4e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  57.38 
 
 
241 aa  295  4e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.38 
 
 
241 aa  295  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.38 
 
 
241 aa  295  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  59.02 
 
 
241 aa  295  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.38 
 
 
241 aa  295  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.38 
 
 
241 aa  295  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.38 
 
 
241 aa  295  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.61 
 
 
241 aa  295  6e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  60.49 
 
 
261 aa  295  6e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  59.18 
 
 
314 aa  295  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  59.26 
 
 
244 aa  293  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0973  ABC transporter related  60.92 
 
 
240 aa  293  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.156124  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  56.37 
 
 
333 aa  294  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  58.2 
 
 
241 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0369  ABC transporter related protein  58.78 
 
 
242 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  59.75 
 
 
254 aa  293  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0826  ABC transporter related  54.41 
 
 
271 aa  293  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  59.02 
 
 
244 aa  293  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  58.61 
 
 
241 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  55.21 
 
 
265 aa  293  3e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  59.76 
 
 
243 aa  292  4e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>