189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0402 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  86.64 
 
 		 217 aa  347  6e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  87.56 
 
 		 217 aa  347  7e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  60.77 
 
 		 220 aa  255  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  62.5 
 
 		 217 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  55.67 
 
 		 211 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  55.67 
 
 		 210 aa  228  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  52.13 
 
 		 211 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  52.71 
 
 		 211 aa  208  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  50.48 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  50.48 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  50.48 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  50.48 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  50.48 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  50.48 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  50.48 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  51.72 
 
 		 211 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  51.72 
 
 		 211 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  49.29 
 
 		 210 aa  201  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  50.74 
 
 		 211 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  50.74 
 
 		 211 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  50.74 
 
 		 211 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  50.74 
 
 		 211 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  44.67 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  45.63 
 
 		 200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  37.81 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  42.86 
 
 		 223 aa  148  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.76 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  41.79 
 
 		 229 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  39.71 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  39.18 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.11 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.59 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  39.42 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.94 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.9 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.59 
 
 		 209 aa  124  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.81 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.32 
 
 		 214 aa  121  9e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  43.02 
 
 		 196 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.41 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.49 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  39 
 
 		 202 aa  111  9e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  36.08 
 
 		 194 aa  109  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  37.06 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.99 
 
 		 196 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  34.16 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  32.18 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  33.84 
 
 		 213 aa  90.9  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.29 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  34.85 
 
 		 197 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.49 
 
 		 196 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  33.33 
 
 		 196 aa  89  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  31.98 
 
 		 196 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  45.28 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  41.23 
 
 		 233 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.28 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.82 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  33.33 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.11 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.74 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.64 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  31.44 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  46.32 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.5 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  42.98 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  31.31 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  32.95 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.85 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.93 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.98 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  27.98 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1979  peptidase S16 lon domain protein  31.77 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.93 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.98 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2345  ATP-dependent protease La domain protein  31.77 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.98 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  27.41 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.89 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  28.71 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  31.61 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0737  peptidase S16, lon domain-containing protein  44 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  29.29 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  31.25 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01436  hypothetical protein  32.93 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  37.82 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2781  hypothetical protein  26.15 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.131469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2956  peptidase S16 lon domain protein  43.82 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.41 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  38.53 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.28 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10439  hypothetical protein  41.49 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.292057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  30.65 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  30 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0170  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.11 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  31.12 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  36.61 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  41.3 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  41.3 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.81 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>