More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0387 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  86.57 
 
 		 494 aa  840    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  100 
 
 		 501 aa  1029    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  85.45 
 
 		 477 aa  856    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  67.89 
 
 		 506 aa  634  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  66.11 
 
 		 504 aa  630  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  53.36 
 
 		 454 aa  491  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  55.1 
 
 		 465 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  55.04 
 
 		 455 aa  494  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  55.63 
 
 		 470 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  54.16 
 
 		 452 aa  481  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  55.1 
 
 		 470 aa  484  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  53.85 
 
 		 453 aa  478  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  49.89 
 
 		 484 aa  450  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  48.74 
 
 		 499 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  49.17 
 
 		 492 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  50.97 
 
 		 484 aa  433  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  50.97 
 
 		 484 aa  433  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  52.64 
 
 		 479 aa  432  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  52.16 
 
 		 509 aa  427  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1279  peptidase M16-like  52.13 
 
 		 481 aa  421  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  48.26 
 
 		 466 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  50.24 
 
 		 459 aa  415  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  45.91 
 
 		 459 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  51.09 
 
 		 473 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  42.99 
 
 		 441 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  42.76 
 
 		 441 aa  392  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  43.44 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  43.67 
 
 		 442 aa  381  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  42.47 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  43.76 
 
 		 462 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  43.6 
 
 		 448 aa  353  5.9999999999999994e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  42.76 
 
 		 465 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  42.76 
 
 		 465 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  40.52 
 
 		 451 aa  341  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  41 
 
 		 450 aa  339  9e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  41.47 
 
 		 451 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  40.76 
 
 		 450 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  41 
 
 		 451 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  41 
 
 		 451 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  42.18 
 
 		 455 aa  334  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  40.52 
 
 		 451 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  40.61 
 
 		 443 aa  318  2e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  38.46 
 
 		 493 aa  318  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  37.53 
 
 		 489 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  40.33 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  37.95 
 
 		 493 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  38.39 
 
 		 514 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  34.91 
 
 		 513 aa  290  4e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  38.35 
 
 		 453 aa  289  9e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  32.61 
 
 		 530 aa  278  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  38.9 
 
 		 469 aa  277  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  37.89 
 
 		 477 aa  273  6e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  38.12 
 
 		 461 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  39.4 
 
 		 472 aa  271  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  38.72 
 
 		 463 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  39 
 
 		 448 aa  269  8e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  39 
 
 		 448 aa  269  8e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  37.88 
 
 		 476 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  39.34 
 
 		 468 aa  266  5.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  37.83 
 
 		 456 aa  266  5.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  37.32 
 
 		 464 aa  265  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  37.5 
 
 		 464 aa  264  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  38.76 
 
 		 459 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  38.1 
 
 		 448 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  36.69 
 
 		 489 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  35.53 
 
 		 461 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  37.87 
 
 		 460 aa  256  6e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  37.87 
 
 		 460 aa  256  6e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  37.53 
 
 		 469 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  36.56 
 
 		 467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  36.12 
 
 		 453 aa  252  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  37.41 
 
 		 457 aa  252  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  36.47 
 
 		 460 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  35.6 
 
 		 453 aa  247  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  35.97 
 
 		 459 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  34.83 
 
 		 457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  34.6 
 
 		 457 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  35.73 
 
 		 459 aa  243  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  35.01 
 
 		 428 aa  243  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  35.29 
 
 		 454 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  36.1 
 
 		 463 aa  239  6.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  34.36 
 
 		 441 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  35.38 
 
 		 443 aa  236  6e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  34.11 
 
 		 442 aa  236  8e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  34.91 
 
 		 443 aa  233  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  33.96 
 
 		 443 aa  233  9e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  34.35 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  32.23 
 
 		 447 aa  229  7e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  34.18 
 
 		 876 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  33.96 
 
 		 461 aa  228  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2703  peptidase M16 domain protein  33.56 
 
 		 440 aa  226  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  34.59 
 
 		 443 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  34.49 
 
 		 443 aa  223  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  34.73 
 
 		 439 aa  223  8e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  34.35 
 
 		 443 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  34.43 
 
 		 443 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  34.35 
 
 		 443 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  34.43 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  34.43 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  34.35 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>