120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0376 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0376  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  275  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0251  OsmC family protein  88.06 
 
 		 134 aa  250  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  0.164531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0232  OsmC family protein  86.57 
 
 		 134 aa  248  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  56.15 
 
 		 138 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  55.34 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  45.45 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  48.04 
 
 		 134 aa  103  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2279  OsmC family protein  48.04 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0377998  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  44.35 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1832  OsmC-like protein  41.35 
 
 		 133 aa  100  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  49.43 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5556  OsmC-like protein  39.39 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000078778  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  35.48 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  41.28 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  34.33 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  34.33 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  36.29 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  36.29 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  34.68 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  29.93 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  41.28 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  37.39 
 
 		 412 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  33.85 
 
 		 402 aa  72  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  34.68 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1856  OsmC family protein  37.76 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  33.33 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  35.64 
 
 		 410 aa  68.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  33.33 
 
 		 410 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  35 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  29.84 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  29.6 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  29.08 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  29.84 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  32.03 
 
 		 410 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  29.2 
 
 		 407 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  32.74 
 
 		 411 aa  65.5  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  32.31 
 
 		 409 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  36.73 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  33.94 
 
 		 413 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  29.79 
 
 		 406 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  29.08 
 
 		 406 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  28.37 
 
 		 409 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  34.69 
 
 		 405 aa  61.6  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  27.86 
 
 		 406 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  34.86 
 
 		 405 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  31.31 
 
 		 418 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  29.75 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  36.26 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  33.33 
 
 		 415 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  27.61 
 
 		 408 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  30.33 
 
 		 397 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  29.27 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  27.56 
 
 		 405 aa  57.4  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  35.23 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  27.03 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  30.36 
 
 		 735 aa  55.1  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  27.27 
 
 		 406 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  28.95 
 
 		 408 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1489  OsmC family protein  26.92 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.172419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  25.95 
 
 		 408 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3620  hypothetical protein  28.7 
 
 		 728 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1130  hypothetical protein  29.21 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4564  OsmC-like protein  27.88 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5525  OsmC family protein  30.48 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3799  OsmC family protein  27.88 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.732158  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2113  hypothetical protein  28.7 
 
 		 728 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  29.1 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3725  OsmC family protein  27.88 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.196532 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3253  hypothetical protein  27.97 
 
 		 728 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2710  hypothetical protein  27.78 
 
 		 731 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  27.27 
 
 		 732 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3689  OsmC family protein  29.81 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.952273 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  27.97 
 
 		 742 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  27.97 
 
 		 742 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  27.97 
 
 		 742 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0643  hypothetical protein  27.97 
 
 		 729 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3199  hypothetical protein  27.97 
 
 		 728 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3599  protein of unknown function DUF181  27.97 
 
 		 729 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3664  hypothetical protein  27.97 
 
 		 729 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3787  hypothetical protein  27.97 
 
 		 729 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2297  hypothetical protein  27.78 
 
 		 728 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806493 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2832  hypothetical protein  27.78 
 
 		 728 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28020  hypothetical protein  27.78 
 
 		 734 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.458293  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2297  OsmC-like protein  29.81 
 
 		 133 aa  50.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0887  hypothetical protein  26.88 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.873349  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2174  hypothetical protein  26.19 
 
 		 728 aa  50.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3211  hypothetical protein  27.12 
 
 		 728 aa  50.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.357431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  27.97 
 
 		 728 aa  50.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  27.12 
 
 		 728 aa  50.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  26.27 
 
 		 728 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  26.67 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0738  hypothetical protein  27.12 
 
 		 728 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  27.97 
 
 		 727 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3214  hypothetical protein  27.78 
 
 		 734 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.668386  normal  0.254813 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1341  OsmC family protein  25.88 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1001  OsmC family protein  26.73 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3033  hypothetical protein  27.12 
 
 		 728 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.431186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  31.31 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2658  OsmC family protein  29.58 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.498397 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  28 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>