More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0362 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  100 
 
 
390 aa  805    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  90.26 
 
 
418 aa  734    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  90.26 
 
 
418 aa  736    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  76.96 
 
 
421 aa  628  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  75.69 
 
 
538 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  74.24 
 
 
557 aa  589  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  74.59 
 
 
544 aa  586  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  77.5 
 
 
422 aa  581  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  73.95 
 
 
385 aa  580  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  73.67 
 
 
385 aa  580  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  73.54 
 
 
532 aa  568  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  73.54 
 
 
525 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  73.54 
 
 
525 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  73.54 
 
 
525 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  73.54 
 
 
517 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  73.54 
 
 
525 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  72.98 
 
 
532 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  73.26 
 
 
531 aa  565  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  73.54 
 
 
517 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  73.54 
 
 
517 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  72.98 
 
 
532 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  73.18 
 
 
525 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  72.98 
 
 
532 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  72.98 
 
 
535 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  72.98 
 
 
535 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  67.41 
 
 
398 aa  502  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  64.46 
 
 
389 aa  489  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  62.91 
 
 
380 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  64.19 
 
 
389 aa  486  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  63.41 
 
 
402 aa  485  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  63.09 
 
 
389 aa  481  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  63.79 
 
 
388 aa  479  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  65.93 
 
 
400 aa  478  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  64.19 
 
 
390 aa  475  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  65.21 
 
 
401 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  61.77 
 
 
392 aa  465  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  63.32 
 
 
377 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  63.04 
 
 
377 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  58.17 
 
 
382 aa  426  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  48.56 
 
 
523 aa  388  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  51.3 
 
 
405 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  50.26 
 
 
520 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  50.7 
 
 
401 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  50.7 
 
 
401 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  52.3 
 
 
375 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  50.96 
 
 
528 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  51.99 
 
 
513 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  51.69 
 
 
521 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  49.74 
 
 
518 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  52.62 
 
 
374 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  51.72 
 
 
375 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  51.15 
 
 
373 aa  374  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  52.01 
 
 
375 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  48.95 
 
 
524 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  51.72 
 
 
375 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  50 
 
 
512 aa  373  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  52.03 
 
 
375 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  48.59 
 
 
513 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  50.69 
 
 
518 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  50.41 
 
 
518 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  51.15 
 
 
524 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  50.7 
 
 
513 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  50.28 
 
 
513 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  50.41 
 
 
518 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  50.87 
 
 
374 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  50.29 
 
 
366 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  48.23 
 
 
519 aa  364  2e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  50.14 
 
 
513 aa  364  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  51.13 
 
 
356 aa  363  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  50.14 
 
 
511 aa  364  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  48.6 
 
 
384 aa  358  6e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  48.35 
 
 
401 aa  357  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0142  cytochrome c oxidase, subunit II  49.71 
 
 
374 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  47.21 
 
 
387 aa  352  5e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  50.14 
 
 
385 aa  349  5e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  45.58 
 
 
378 aa  336  5e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  45.81 
 
 
388 aa  318  9e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  44.51 
 
 
377 aa  300  3e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  50.21 
 
 
311 aa  259  4e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  40.62 
 
 
380 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  49.36 
 
 
281 aa  248  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04019  cytochrome c oxidase, subunit II  48.97 
 
 
308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  47.74 
 
 
320 aa  236  4e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  44.13 
 
 
284 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4588  cytochrome-c oxidase  43.95 
 
 
284 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2336  cytochrome c oxidase, subunit II  39.62 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.273176  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0260  cytochrome c oxidase, subunit II  40.57 
 
 
288 aa  196  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150091  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  43.14 
 
 
279 aa  196  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal  0.503108 
 
 
-
 
NC_004310  BR0467  cytochrome c oxidase, subunit II  42.86 
 
 
284 aa  195  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0642  cytochrome c oxidase, subunit II  40.96 
 
 
294 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.439468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0899  cytochrome c oxidase, subunit II  42.63 
 
 
285 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20634  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0581  cytochrome c oxidase subunit II  44.2 
 
 
294 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00300077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2349  cytochrome c oxidase, subunit II  41.39 
 
 
285 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1237  cytochrome c oxidase, subunit II  38.43 
 
 
303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109976 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0730  cytochrome c oxidase, subunit II  40.41 
 
 
295 aa  189  9e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.255439  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1140  cytochrome c oxidase subunit II  41 
 
 
270 aa  188  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0518  cytochrome c oxidase subunit II  41.77 
 
 
294 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  38.37 
 
 
287 aa  187  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  40.42 
 
 
304 aa  186  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  40.5 
 
 
343 aa  186  9e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>