More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0229 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  100 
 
 
402 aa  793    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  90.98 
 
 
402 aa  730    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  91.48 
 
 
402 aa  733    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  60 
 
 
398 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  59.24 
 
 
414 aa  461  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  58.99 
 
 
400 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  57.11 
 
 
395 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  56.35 
 
 
395 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  56.6 
 
 
395 aa  454  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  57.61 
 
 
397 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  56.71 
 
 
398 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  59.24 
 
 
396 aa  431  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 
398 aa  362  6e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  50 
 
 
398 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3498  aminotransferase, class I and II  47.49 
 
 
399 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3440  GntR family transcriptional regulator  46.48 
 
 
399 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2654  aminotransferase, class I and II  46.73 
 
 
424 aa  332  9e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4020  GntR family transcriptional regulator  46.73 
 
 
399 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.199262 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  47.04 
 
 
417 aa  330  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  47.78 
 
 
407 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5262  aminotransferase, class I and II  46.98 
 
 
399 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.276106  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  43.8 
 
 
396 aa  326  6e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  42.53 
 
 
396 aa  322  6e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5148  GntR family transcriptional regulator  47.01 
 
 
399 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
395 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  46.08 
 
 
406 aa  317  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  45.27 
 
 
383 aa  316  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  41.45 
 
 
393 aa  315  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  44.13 
 
 
394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  46.49 
 
 
406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  44.66 
 
 
420 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  43.62 
 
 
394 aa  311  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5662  GntR family transcriptional regulator  48.17 
 
 
425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182521  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  45.95 
 
 
377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  45.67 
 
 
426 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  45.67 
 
 
426 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  43.08 
 
 
398 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  42.26 
 
 
397 aa  305  9.000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  42.82 
 
 
400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  43.08 
 
 
400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  42.82 
 
 
398 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  37.88 
 
 
396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  43.92 
 
 
406 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  45.13 
 
 
395 aa  302  5.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  42.09 
 
 
394 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  42.05 
 
 
398 aa  299  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  43.18 
 
 
396 aa  298  8e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  43.18 
 
 
396 aa  298  9e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  43.19 
 
 
404 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  45.79 
 
 
394 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  44.27 
 
 
398 aa  296  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  40.59 
 
 
433 aa  296  6e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
393 aa  295  7e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  43.11 
 
 
393 aa  295  7e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  46.52 
 
 
406 aa  293  3e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  42.35 
 
 
393 aa  293  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  38.58 
 
 
400 aa  292  6e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  42.35 
 
 
393 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
393 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  44.53 
 
 
400 aa  290  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  42.78 
 
 
393 aa  289  6e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  42.35 
 
 
393 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
393 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  42.35 
 
 
393 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  42.35 
 
 
393 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  37.6 
 
 
397 aa  287  2e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3951  aminotransferase, class I and II  42.71 
 
 
421 aa  288  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0704499  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
405 aa  286  2.9999999999999996e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  40.7 
 
 
440 aa  285  7e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1984  aminotransferase, class I/II  47.42 
 
 
408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0496  aminotransferase family protein  47.42 
 
 
408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
397 aa  283  5.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
395 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2081  aminotransferase, class I/II  47.16 
 
 
408 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
395 aa  280  2e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  37.87 
 
 
403 aa  281  2e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
450 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0896  aminotransferase family protein  46.98 
 
 
406 aa  280  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
409 aa  278  1e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  38.81 
 
 
463 aa  278  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  45.01 
 
 
402 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
395 aa  277  2e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  42.35 
 
 
393 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  42.35 
 
 
393 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  42.35 
 
 
393 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  42.35 
 
 
393 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  42.35 
 
 
393 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  42.35 
 
 
393 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  37.85 
 
 
386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  36.15 
 
 
395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  36.91 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  39.15 
 
 
399 aa  273  3e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  35.77 
 
 
394 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  41.58 
 
 
394 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  35.77 
 
 
400 aa  272  8.000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  39.14 
 
 
404 aa  271  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  40.93 
 
 
416 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  38.9 
 
 
399 aa  270  4e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>