More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0221 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  600  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  83.22 
 
 		 306 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  82.3 
 
 		 306 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  73.47 
 
 		 312 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  73.04 
 
 		 313 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  63.21 
 
 		 308 aa  340  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  61.43 
 
 		 294 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  52.69 
 
 		 291 aa  278  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0501  patatin  46.67 
 
 		 293 aa  264  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  51.33 
 
 		 314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  47.01 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  41.84 
 
 		 290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  36.63 
 
 		 277 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  39.46 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0074  Patatin  36.43 
 
 		 283 aa  132  6e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7395  patatin  36.43 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2490  Patatin  35.56 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3682  patatin  34.26 
 
 		 276 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  36.32 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  35.34 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4059  patatin  33.86 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.447897  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  36.36 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  28.62 
 
 		 728 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4861  patatin  31.58 
 
 		 332 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  30.34 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  29.32 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0014  patatin  36.93 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  32.16 
 
 		 251 aa  99.4  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  26.87 
 
 		 741 aa  99  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  25.09 
 
 		 760 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0334  patatin  41.07 
 
 		 279 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  29.57 
 
 		 349 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  27.87 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  36.9 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  34.76 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  28.63 
 
 		 263 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  27.02 
 
 		 733 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  32.42 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  36.96 
 
 		 323 aa  96.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  32.42 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  35.19 
 
 		 748 aa  96.7  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  27.4 
 
 		 728 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  34.64 
 
 		 301 aa  96.3  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  30.66 
 
 		 790 aa  95.9  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  31.43 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2824  Patatin  33.14 
 
 		 357 aa  95.1  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.701199  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  27.4 
 
 		 728 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  31.58 
 
 		 256 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  27.4 
 
 		 751 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  32.59 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  31.16 
 
 		 250 aa  94.7  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  27.4 
 
 		 727 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  28.7 
 
 		 263 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  28.7 
 
 		 263 aa  93.6  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  31.32 
 
 		 319 aa  93.2  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6465  patatin  31.5 
 
 		 286 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  31.12 
 
 		 745 aa  93.2  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  33.99 
 
 		 318 aa  92.8  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  27.8 
 
 		 263 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  27.8 
 
 		 263 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  31.58 
 
 		 262 aa  92.4  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  28.26 
 
 		 302 aa  92.4  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  27.8 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  33.65 
 
 		 253 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  28.25 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  27.35 
 
 		 263 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  31.52 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  27.83 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  27.39 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  27.72 
 
 		 287 aa  90.5  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  27.39 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  28.57 
 
 		 343 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  27.39 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  27.35 
 
 		 263 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  27.35 
 
 		 263 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  27.35 
 
 		 263 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1321  patatin  26.94 
 
 		 253 aa  90.1  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2156  Patatin  43.44 
 
 		 285 aa  90.1  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.597827  normal  0.204502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  32.86 
 
 		 324 aa  90.1  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  27.39 
 
 		 308 aa  89.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  36.9 
 
 		 316 aa  89.4  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  36.9 
 
 		 316 aa  89.4  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  26.45 
 
 		 751 aa  89.4  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0018  patatin  25.85 
 
 		 266 aa  89.4  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  35.68 
 
 		 322 aa  89.4  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  31.93 
 
 		 707 aa  89.4  7e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  28.34 
 
 		 735 aa  89  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  34.18 
 
 		 300 aa  89  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  32.61 
 
 		 305 aa  89  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  31.7 
 
 		 737 aa  89  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  28.24 
 
 		 735 aa  88.6  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  34.02 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  28.14 
 
 		 358 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  29.22 
 
 		 333 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  32.96 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  36.31 
 
 		 347 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  29.22 
 
 		 320 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  36.07 
 
 		 327 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  23.3 
 
 		 740 aa  87.8  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  27.23 
 
 		 347 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>