More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0217 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0217  oxidoreductase transmembrane protein  100 
 
 		 342 aa  695    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  66.98 
 
 		 335 aa  431  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3126  aldo/keto reductase family oxidoreductase  67.82 
 
 		 334 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  66.16 
 
 		 327 aa  425  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2047  aldo/keto reductase  64.42 
 
 		 329 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  64.72 
 
 		 329 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0110  aldo/keto reductase  65.62 
 
 		 334 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  66.25 
 
 		 334 aa  418  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1098  putative oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  64.38 
 
 		 334 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0797  putative aldo/keto reductase  67.96 
 
 		 327 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6147  aldo/keto reductase  67.3 
 
 		 325 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1767  aldo/keto reductase  64.13 
 
 		 329 aa  413  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  65.3 
 
 		 331 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  62.35 
 
 		 329 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  64.76 
 
 		 329 aa  408  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0933  aldo/keto reductase  66.77 
 
 		 327 aa  409  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673892  normal  0.749159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  64.76 
 
 		 329 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  62.86 
 
 		 329 aa  408  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  62.86 
 
 		 329 aa  408  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3903  aldo/keto reductase  64.81 
 
 		 327 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392961  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  62.86 
 
 		 329 aa  408  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2472  aldo/keto reductase  63.53 
 
 		 329 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  65.7 
 
 		 327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32530  Aldo/keto reductase protein  62.31 
 
 		 330 aa  404  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2512  aldo/keto reductase  61.7 
 
 		 328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  63.72 
 
 		 331 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  63.09 
 
 		 331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2444  aldo/keto reductase  62.01 
 
 		 331 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4894  aldo/keto reductase  66.25 
 
 		 331 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6241  aldo/keto reductase  61.54 
 
 		 327 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1952  aldo/keto reductase  64.76 
 
 		 329 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27430  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  62.08 
 
 		 328 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3244  aldo/keto reductase  61.7 
 
 		 329 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.667963  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6149  aldo/keto reductase  62.04 
 
 		 330 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4118  aldo/keto reductase  60.24 
 
 		 328 aa  393  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4260  aldo/keto reductase  60.49 
 
 		 327 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  60.87 
 
 		 327 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1949  aldo/keto reductase  63.22 
 
 		 330 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.876461  normal  0.0859376 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3786  aldo/keto reductase  61.54 
 
 		 327 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4221  aldo/keto reductase  59.21 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.886889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0168  aldo/keto reductase  60.83 
 
 		 326 aa  388  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0167  aldo/keto reductase  62.62 
 
 		 335 aa  386  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3214  aldo/keto reductase  60.37 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2612  aldo/keto reductase  60.25 
 
 		 328 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3206  aldo/keto reductase  65.58 
 
 		 325 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0475  aldo/keto reductase  62.15 
 
 		 331 aa  383  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2239  aldo/keto reductase  62.03 
 
 		 321 aa  384  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6148  aldo/keto reductase  59.27 
 
 		 329 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3242  aldo/keto reductase  58.36 
 
 		 327 aa  381  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38050  Aldo/keto reductase  62.81 
 
 		 401 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1798  aldo/keto reductase  57.14 
 
 		 333 aa  373  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000356157  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  57.49 
 
 		 333 aa  368  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0173  aldo/keto reductase  56.71 
 
 		 328 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1743  aldo/keto reductase  58.65 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138583  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  57.75 
 
 		 330 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0476  aldo/keto reductase  59.49 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2757  aldo/keto reductase  57.19 
 
 		 382 aa  363  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0729923 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  56.84 
 
 		 331 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0842  aldo/keto reductase  56.87 
 
 		 390 aa  359  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.495708  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  55.21 
 
 		 326 aa  357  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1802  aldo/keto reductase  54.63 
 
 		 372 aa  350  2e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.246141  normal  0.022853 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3215  aldo/keto reductase  54.13 
 
 		 384 aa  349  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  56.59 
 
 		 333 aa  348  7e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3243  aldo/keto reductase  55.66 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3904  twin-arginine translocation pathway signal  55.79 
 
 		 385 aa  346  3e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.307988  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  58.33 
 
 		 340 aa  345  5e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4369  aldo/keto reductase  63.44 
 
 		 363 aa  333  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2146  aldo/keto reductase  53.27 
 
 		 405 aa  332  8e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3518  aldo/keto reductase  55.87 
 
 		 324 aa  329  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl252  putative aldo/keto reductase  49.54 
 
 		 328 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00286495  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  51.35 
 
 		 331 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  51.21 
 
 		 330 aa  325  5e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  53.19 
 
 		 326 aa  325  7e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  53.48 
 
 		 317 aa  322  7e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  54.4 
 
 		 328 aa  322  8e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  53.8 
 
 		 330 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  55.52 
 
 		 332 aa  321  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  54.84 
 
 		 328 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3566  aldo/keto reductase  53.97 
 
 		 319 aa  320  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0270912  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  52.42 
 
 		 327 aa  320  3e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  52.6 
 
 		 328 aa  318  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  51.37 
 
 		 328 aa  317  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  55.56 
 
 		 328 aa  317  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  48.34 
 
 		 328 aa  316  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32550  Aldo/keto reductase protein  53.75 
 
 		 415 aa  315  5e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  53.07 
 
 		 330 aa  315  7e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  55.7 
 
 		 328 aa  315  8e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  50.15 
 
 		 328 aa  315  9e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  54.4 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  48.96 
 
 		 335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  55.05 
 
 		 328 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  52.58 
 
 		 330 aa  312  4.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  52.12 
 
 		 329 aa  312  4.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  51.45 
 
 		 330 aa  311  7.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  52.32 
 
 		 324 aa  311  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  49.08 
 
 		 331 aa  311  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  52.1 
 
 		 331 aa  311  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  53.8 
 
 		 330 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  49.54 
 
 		 329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  52.17 
 
 		 334 aa  310  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>