More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0183 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0183  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  329  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0517579 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4568  putative signal transduction protein with CBS domains  73.51 
 
 		 155 aa  217  6e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0446023  normal  0.17585 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4435  putative signal-transduction protein with CBS domains  73.51 
 
 		 155 aa  217  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  41.13 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  41.45 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  40.65 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  40.65 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  35 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  34.96 
 
 		 625 aa  79.7  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  33.85 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  30.3 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  28.67 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  35.42 
 
 		 620 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  30.71 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  35.42 
 
 		 620 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  35.42 
 
 		 620 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  32.12 
 
 		 615 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  34.72 
 
 		 620 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  29.84 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  35.61 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35 
 
 		 615 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  35 
 
 		 615 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.74 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  35 
 
 		 615 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  40.48 
 
 		 605 aa  67.4  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  29.93 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0067  putative inosine monophosphate dehydrogenase  29.08 
 
 		 149 aa  67  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  31.93 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  34.62 
 
 		 153 aa  67  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  34.29 
 
 		 615 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  31.01 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  33.08 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  32.77 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  30.58 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  30.72 
 
 		 637 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  34.29 
 
 		 615 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  31.13 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.25 
 
 		 478 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  31.47 
 
 		 286 aa  65.1  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  30 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  33.07 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  32.26 
 
 		 613 aa  64.7  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  28.06 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  36.13 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  34.71 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  33.61 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  35.29 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  29.09 
 
 		 615 aa  63.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  30.58 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  35.83 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  29.69 
 
 		 626 aa  61.6  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  31.25 
 
 		 626 aa  61.6  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  30.43 
 
 		 615 aa  61.2  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  27.48 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  34.75 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  30 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  32.52 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  30.71 
 
 		 626 aa  60.8  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  30.23 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  28.74 
 
 		 614 aa  60.8  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  35.29 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  34.04 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1388  hypothetical protein  34.04 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  30 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00722  Signaling protein with a cAMP-binding, CBS domains and predicted nucleotidyltransferase domain  33.06 
 
 		 613 aa  60.1  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  28.06 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0248  putative signal transduction protein with CBS domains  31.21 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  28.06 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  28.06 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  28.06 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  28.06 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  33.61 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  25.74 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  34.17 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  25.98 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  35.25 
 
 		 480 aa  58.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  35 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  27.78 
 
 		 627 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  35 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  29.7 
 
 		 615 aa  58.2  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  33.06 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  32.23 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  32.48 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2317  CBS domain-containing protein  28.78 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.754062  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  35.42 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  33.33 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  28.87 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  29.71 
 
 		 615 aa  57.4  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  25.74 
 
 		 215 aa  57.4  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0528  signal-transduction protein  30.08 
 
 		 611 aa  57.4  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.766846  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  32.54 
 
 		 641 aa  57.4  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  27.94 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1483  CBS domain protein  35.44 
 
 		 125 aa  57  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0666376  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  34.78 
 
 		 242 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  32.5 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3788  putative signal transduction protein with CBS domains  34.17 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.534948  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  32.62 
 
 		 225 aa  57  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  30.56 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  29.29 
 
 		 618 aa  57  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>