66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0182 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0182  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  704    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0642458 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4569  membrane protein-like protein  73.8 
 
 		 481 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0206067  normal  0.209557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4436  membrane protein-like protein  73.8 
 
 		 481 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0922  putative transmembrane protein  40.11 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.546528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3343  transmembrane protein  38.23 
 
 		 416 aa  192  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2472  membrane protein-like protein  38.46 
 
 		 412 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.595236  normal  0.992981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1126  hypothetical protein  40.06 
 
 		 429 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1172  putative transmembrane protein  38.46 
 
 		 414 aa  176  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0696977 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1799  putative transmembrane protein  38.11 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.37939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1818  putative transmembrane protein  37.74 
 
 		 417 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1865  putative transmembrane protein  37.74 
 
 		 417 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0998873  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3663  hypothetical protein  34.63 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0504521  hitchhiker  0.0000127877 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3492  putative transmembrane protein  34.32 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0708011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2132  hypothetical protein  30.64 
 
 		 423 aa  119  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.524155  decreased coverage  0.0000326066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0047  hypothetical protein  34.35 
 
 		 417 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0813  hypothetical protein  30.63 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00550  hypothetical protein  34.79 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0250309  normal  0.0752819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1587  hypothetical protein  30.2 
 
 		 418 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1479  membrane protein-like protein  30.43 
 
 		 414 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1182  membrane protein-like  31.03 
 
 		 433 aa  99  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1783  hypothetical protein  31.07 
 
 		 420 aa  98.2  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00695684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1092  hypothetical protein  29.28 
 
 		 419 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.160606  normal  0.0424364 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1155  MgtC/SapB transporter  24.36 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4823  membrane protein  33.62 
 
 		 423 aa  95.9  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1972  MgtC/SapB transporter  29.81 
 
 		 418 aa  93.6  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.315083 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002966  hypothetical protein  27.33 
 
 		 425 aa  92.8  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0595  membrane protein  29.82 
 
 		 425 aa  90.9  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0164312  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0559  hypothetical protein  32.31 
 
 		 420 aa  90.9  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2187  membrane protein-like protein  30.77 
 
 		 426 aa  90.5  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.946223  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2103  membrane protein  28.35 
 
 		 437 aa  89.7  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2707  membrane protein-like protein  30.53 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0954887  normal  0.849841 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1183  membrane protein-like protein  31.18 
 
 		 433 aa  89  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.647049 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2575  hypothetical protein  29.82 
 
 		 418 aa  87.8  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.612396  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2305  hypothetical protein  32.98 
 
 		 427 aa  87.8  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0242022  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0542  membrane protein  28.95 
 
 		 441 aa  86.7  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215324 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0484  hypothetical protein  36.36 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40682  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3710  hypothetical protein  35.46 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.387372 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0922  MgtC family protein  31.33 
 
 		 427 aa  80.5  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500077  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35240  hypothetical protein  32.24 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000669836  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2073  hypothetical protein  26.97 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0254302  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5131  hypothetical protein  30 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285021  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0333  magnesium transporter accessory protein  30.57 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.806096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1487  hypothetical protein  29.07 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0192315  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3227  hypothetical protein  25.65 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0623753  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1067  hypothetical protein  25.98 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2082  hypothetical protein  27.22 
 
 		 448 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.184363  normal  0.255559 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6201  hypothetical protein  37.25 
 
 		 236 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4934  magnesium transporter accessory protein  25.95 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.936542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1692  hypothetical protein  27.53 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0808  hypothetical protein  30.38 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.810338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0897  MgtC/SapB transporter  28.35 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2904  hypothetical protein  27.55 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157069  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2260  hypothetical protein  30.48 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2513  membrane protein  28 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196056  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2978  MgtC/SapB transporter  27.46 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1979  membrane protein  29.41 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1901  membrane protein  29.21 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3027  hypothetical protein  29.32 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.678379  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2212  membrane protein  27.16 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.469144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4750  hypothetical protein  30.56 
 
 		 416 aa  57  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2208  magnesium transporter accessory protein  28.11 
 
 		 422 aa  56.2  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1984  membrane protein  26.92 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192525  normal  0.0203513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2446  hypothetical protein  27.91 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385923  normal  0.422644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1241  membrane protein-like protein  30.81 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0453  hypothetical protein  29.2 
 
 		 424 aa  47.4  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.281099 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0779  hypothetical protein  23.78 
 
 		 378 aa  46.6  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>