More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_7395 on replicon NC_009008
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 138 aa  274  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  97.1 
 
 		 138 aa  266  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2962  transcriptional regulator  45.19 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  44.35 
 
 		 117 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7954  putative transcriptional regulator, MerR family  40.54 
 
 		 119 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  38.74 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  36.13 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8431  transcriptional regulator, MerR family  37.07 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  37.17 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  44.23 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  44.32 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  41.58 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  35.14 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  36.79 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  39 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  34.38 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  33.9 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  35.54 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  28.69 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2458  transcriptional regulator, MerR family  37.74 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  36.04 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  30.25 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  29.31 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  34.51 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  29.31 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3404  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  29.31 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 152 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  35.78 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  34.45 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  38.83 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  32.74 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  38.38 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  35.19 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1032  transcriptional regulator, MerR family  26.89 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.920994  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  28.57 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  30.25 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 		 249 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  31.15 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3662  transcriptional regulator, MerR family  36.89 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02024  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  32.35 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  32.99 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  27.73 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  27.73 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  27.73 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  27.73 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  32.73 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  38.67 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  31.43 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  27.73 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1266  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  28.81 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0668949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  32.73 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3164  MerR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  31.15 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  30.91 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0734  regulatory protein, MerR  36.94 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.308445  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.62 
 
 		 147 aa  62  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  35.92 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  34.71 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  35.92 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  37.14 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0586  DNA-binding transcriptional regulator CueR  27.73 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.775911 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3026  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  27.97 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>