223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_7246 on replicon NC_007489
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007489  RSP_7246  acyltransferase  100 
 
 
354 aa  699    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  67.8 
 
 
354 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  30.49 
 
 
359 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  32.85 
 
 
362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  31.55 
 
 
364 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  28.31 
 
 
378 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0996  hypothetical protein  33.17 
 
 
307 aa  97.8  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0376747  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  31.21 
 
 
356 aa  90.1  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  32 
 
 
363 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  30.14 
 
 
354 aa  89  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  27.27 
 
 
356 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  31.43 
 
 
366 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  26.8 
 
 
383 aa  85.9  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  28.87 
 
 
384 aa  85.9  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  35.29 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  24.81 
 
 
356 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  28.02 
 
 
357 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  30.29 
 
 
382 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  27.68 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  29 
 
 
367 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  32.76 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  27.93 
 
 
374 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  27.89 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  31.19 
 
 
379 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2291  acyltransferase 3  32.33 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0403995  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  30.41 
 
 
375 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  28.62 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  29.3 
 
 
395 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  29.3 
 
 
395 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  36.36 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  28.27 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  28.36 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  30.92 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0488  acyltransferase 3  29.86 
 
 
372 aa  73.9  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297786  hitchhiker  0.00634173 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  29.32 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  26.26 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  28.28 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2192  acyltransferase 3  27.22 
 
 
359 aa  72  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735291  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  27.49 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1144  acyltransferase 3  28.08 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  29.01 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  28.65 
 
 
351 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  25.83 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  28.9 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  28.37 
 
 
335 aa  69.3  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  28.33 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1051  putative acyltransferase, putative membrane protein  24.67 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  28.43 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  28.87 
 
 
383 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  27.81 
 
 
333 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  26.63 
 
 
344 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  33.12 
 
 
391 aa  66.6  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3255  acyltransferase family protein  33.15 
 
 
364 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  25.56 
 
 
382 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  29.21 
 
 
344 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  28.71 
 
 
362 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  26.55 
 
 
354 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  32.5 
 
 
348 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2367  acyltransferase 3  37.8 
 
 
389 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402502 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  27.24 
 
 
354 aa  62  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  27.14 
 
 
356 aa  62  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2299  acyltransferase 3  29.12 
 
 
365 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3493  acyltransferase 3  37.14 
 
 
362 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0867456  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  26.26 
 
 
340 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1595  acyltransferase 3  29.79 
 
 
508 aa  60.8  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.915882 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  30.92 
 
 
367 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  28.29 
 
 
356 aa  60.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3098  acyltransferase 3  28.99 
 
 
372 aa  60.1  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0580  acyltransferase 3  34.42 
 
 
381 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  27.8 
 
 
354 aa  59.7  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1793  acyltransferase 3  25.71 
 
 
393 aa  59.7  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.130977  hitchhiker  0.00741592 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  25.59 
 
 
309 aa  59.7  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  29.17 
 
 
371 aa  59.3  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2762  acyltransferase 3  31.15 
 
 
354 aa  59.3  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.595683  normal  0.224003 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  27.69 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1632  acyltransferase 3  23.31 
 
 
377 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0893  acyltransferase family protein  25.23 
 
 
378 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0030172  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5590  acyltransferase 3  37.14 
 
 
351 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  28.03 
 
 
360 aa  57.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0298  acyltransferase 3  28.22 
 
 
376 aa  57.4  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  26.32 
 
 
351 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_02  acetyltransferase  23.3 
 
 
321 aa  56.6  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.578404  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0432  acyltransferase 3  29.55 
 
 
362 aa  56.2  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  25.19 
 
 
393 aa  56.2  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  26.8 
 
 
688 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  29.94 
 
 
660 aa  55.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  25.76 
 
 
340 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  25.57 
 
 
353 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0891  acyltransferase 3  27.3 
 
 
392 aa  54.3  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  36.84 
 
 
383 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  27.54 
 
 
353 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0084  acyltransferase 3  33.86 
 
 
378 aa  53.9  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  37.5 
 
 
478 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  28.83 
 
 
415 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0630  acyltransferase 3  35.29 
 
 
394 aa  53.5  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.344764 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2531  acyltransferase, putative  24.59 
 
 
369 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0219195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  25.2 
 
 
369 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0243  acyltransferase 3  29.52 
 
 
365 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113037  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2353  acyltransferase 3  37.5 
 
 
389 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2032  acyltransferase 3  24.93 
 
 
402 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0585091  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>