16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_6245 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_6245  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  288  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000335649  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1640  hypothetical protein  38.81 
 
 		 157 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0639  HK97 family phage protein  37.78 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1665  hypothetical protein  32.81 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2354  hypothetical protein  35.64 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1617  hypothetical protein  31.16 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.482564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3322  HK97 family phage protein  27.22 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0654407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1888  HK97 family phage protein  30.77 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2065  hypothetical protein  26.19 
 
 		 185 aa  50.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307033  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6190  hypothetical protein  33.78 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608804  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0631  phage protein, HK97 gp10 family  26.45 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0247  HK97 family phage protein  27.91 
 
 		 146 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2958  hypothetical protein  27.78 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1477  phage protein, HK97, gp10  26.32 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1621  Phage protein, HK97, gp10  26.32 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.421148  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1768  hypothetical protein  28.44 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>