More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4277 on replicon NC_009008
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 140 aa  281  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  99.29 
 
 		 140 aa  279  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 137 aa  130  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  45.71 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  44.29 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  47.06 
 
 		 141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  49.24 
 
 		 174 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  46.21 
 
 		 139 aa  117  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 142 aa  117  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 161 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 137 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  47.06 
 
 		 141 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 145 aa  113  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4426  MerR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 134 aa  113  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4119  MerR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 146 aa  110  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 138 aa  110  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 141 aa  110  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2931  MerR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.68732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  43.38 
 
 		 140 aa  107  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  45.97 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  52.88 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  39.23 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  41.27 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  40.62 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  37.88 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  38.1 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  36.92 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  38.81 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0486  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 135 aa  98.6  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  36.15 
 
 		 144 aa  97.4  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  36.15 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1301  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 135 aa  96.7  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  36.92 
 
 		 162 aa  96.7  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2312  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 135 aa  96.7  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000000678056  hitchhiker  0.000026005 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  36.92 
 
 		 144 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  36.92 
 
 		 144 aa  96.7  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  36.92 
 
 		 144 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  36.92 
 
 		 144 aa  96.7  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  36.15 
 
 		 136 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  36.92 
 
 		 144 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  38.93 
 
 		 132 aa  96.7  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  42.06 
 
 		 156 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  36.15 
 
 		 144 aa  94.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  38.58 
 
 		 145 aa  94.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  42.06 
 
 		 156 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  39.37 
 
 		 186 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 136 aa  94  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 138 aa  93.6  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1783  putative transcriptional regulator MerR  36.15 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  39.1 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  41.04 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  41.04 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 139 aa  92  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 135 aa  90.9  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 133 aa  90.5  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  38.64 
 
 		 167 aa  90.5  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  35.38 
 
 		 135 aa  90.5  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  39.84 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 172 aa  90.1  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 135 aa  90.1  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  34.13 
 
 		 128 aa  90.1  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  38.58 
 
 		 143 aa  90.1  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  37.69 
 
 		 144 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 132 aa  90.1  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  35.38 
 
 		 135 aa  90.1  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 141 aa  89.4  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  37.59 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>