More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4242 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  100 
 
 		 1544 aa  2951    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  34.7 
 
 		 1145 aa  316  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  35.22 
 
 		 1884 aa  306  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  34.39 
 
 		 1400 aa  304  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  34.38 
 
 		 4334 aa  294  7e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  37.93 
 
 		 2911 aa  283  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  33.89 
 
 		 1363 aa  278  5e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  32.18 
 
 		 4800 aa  274  9e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  37.23 
 
 		 1279 aa  264  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  34.58 
 
 		 946 aa  262  5.0000000000000005e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  33.76 
 
 		 1079 aa  261  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  33.8 
 
 		 3954 aa  254  6e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  42.07 
 
 		 745 aa  254  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  33.41 
 
 		 833 aa  239  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  37.15 
 
 		 2836 aa  235  5e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  32.28 
 
 		 1390 aa  233  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  39.72 
 
 		 1112 aa  228  6e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  33.06 
 
 		 1499 aa  223  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  32.92 
 
 		 1156 aa  219  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  33.1 
 
 		 1855 aa  218  5e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  35.01 
 
 		 965 aa  215  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  31.16 
 
 		 2954 aa  213  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  38.13 
 
 		 1112 aa  212  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  29.39 
 
 		 1582 aa  210  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  50.18 
 
 		 648 aa  205  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  30.46 
 
 		 2097 aa  198  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  45.53 
 
 		 2105 aa  191  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.81 
 
 		 2678 aa  190  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 1534 aa  188  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  33.33 
 
 		 1197 aa  185  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  39.85 
 
 		 556 aa  184  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.54 
 
 		 1415 aa  184  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  31.3 
 
 		 2689 aa  181  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  29.59 
 
 		 1628 aa  179  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  29.92 
 
 		 2107 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  30.24 
 
 		 1213 aa  176  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  32.72 
 
 		 860 aa  176  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  35.93 
 
 		 595 aa  173  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  34.86 
 
 		 795 aa  170  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  30.15 
 
 		 1072 aa  169  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.42 
 
 		 1795 aa  169  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  34.63 
 
 		 2775 aa  167  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  29.96 
 
 		 1286 aa  166  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  29.21 
 
 		 2467 aa  166  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  33.28 
 
 		 824 aa  165  7e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  34.43 
 
 		 1532 aa  163  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  27.09 
 
 		 3209 aa  162  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.99 
 
 		 3427 aa  162  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  37.21 
 
 		 613 aa  159  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  31.35 
 
 		 1814 aa  158  8e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  30.31 
 
 		 1480 aa  157  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  39.94 
 
 		 526 aa  156  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  45.83 
 
 		 980 aa  155  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  46.6 
 
 		 4687 aa  154  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  40.11 
 
 		 833 aa  154  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  31.75 
 
 		 2667 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  35.59 
 
 		 9867 aa  150  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  30.84 
 
 		 2807 aa  149  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  35.77 
 
 		 1164 aa  149  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  45 
 
 		 1287 aa  149  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  47.42 
 
 		 460 aa  148  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  35.65 
 
 		 3608 aa  147  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  51.3 
 
 		 1424 aa  147  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  34.62 
 
 		 769 aa  147  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0556  proprotein convertase P  32.89 
 
 		 764 aa  146  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392755  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  27.41 
 
 		 4798 aa  146  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  45.7 
 
 		 491 aa  145  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  42.72 
 
 		 341 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 1895 aa  144  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  28.6 
 
 		 14829 aa  143  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  36.87 
 
 		 3619 aa  142  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.9 
 
 		 1236 aa  140  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  36.11 
 
 		 3619 aa  140  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  33.93 
 
 		 1712 aa  139  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  31.87 
 
 		 855 aa  137  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  27.24 
 
 		 3026 aa  137  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  41.35 
 
 		 2145 aa  136  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  38.35 
 
 		 437 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  39.69 
 
 		 393 aa  133  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.78 
 
 		 2668 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  25.82 
 
 		 2245 aa  132  7.000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  28.31 
 
 		 4723 aa  130  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  37.76 
 
 		 820 aa  131  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  42.8 
 
 		 589 aa  130  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.04 
 
 		 588 aa  131  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  29.38 
 
 		 2950 aa  130  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  38.44 
 
 		 387 aa  129  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  41.42 
 
 		 341 aa  130  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  47.89 
 
 		 460 aa  129  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  27.98 
 
 		 15831 aa  129  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  34.27 
 
 		 950 aa  128  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  41.18 
 
 		 850 aa  126  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  40.97 
 
 		 615 aa  126  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  48.04 
 
 		 982 aa  125  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  39.75 
 
 		 387 aa  125  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  35.37 
 
 		 437 aa  125  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  32.83 
 
 		 518 aa  124  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  45 
 
 		 759 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  28.13 
 
 		 3598 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.55 
 
 		 1180 aa  124  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>