More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3973 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
154 aa  309  9e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  62.16 
 
 
156 aa  187  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  56.64 
 
 
153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  55.94 
 
 
153 aa  167  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  55.94 
 
 
153 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  54.17 
 
 
154 aa  165  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  55.94 
 
 
153 aa  162  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  51.7 
 
 
157 aa  161  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  51.05 
 
 
157 aa  151  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  53.06 
 
 
153 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  53.06 
 
 
153 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  49.65 
 
 
152 aa  147  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  50.34 
 
 
159 aa  147  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  49.65 
 
 
152 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  48.98 
 
 
177 aa  147  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  48.98 
 
 
154 aa  147  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  49.65 
 
 
152 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  49.65 
 
 
152 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  52.38 
 
 
154 aa  147  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  46.21 
 
 
181 aa  146  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  48.95 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  46.85 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6436  AsnC family transcriptional regulator  52 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527241  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 
158 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  49.65 
 
 
152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  49.65 
 
 
152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  49.65 
 
 
163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  49.65 
 
 
152 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  49.65 
 
 
152 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  47.62 
 
 
157 aa  144  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  49.65 
 
 
152 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  46.26 
 
 
156 aa  143  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  50.34 
 
 
159 aa  142  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  50.7 
 
 
156 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  48.59 
 
 
158 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1173  AsnC family transcriptional regulator  52 
 
 
159 aa  142  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  51.8 
 
 
147 aa  142  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  48.3 
 
 
154 aa  141  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  46.53 
 
 
157 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  46.53 
 
 
157 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4823  AsnC family transcriptional regulator  50.7 
 
 
149 aa  140  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal  0.0730617 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 
155 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 
155 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  48.97 
 
 
174 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  43.84 
 
 
162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  46.85 
 
 
155 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 
155 aa  138  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  44.9 
 
 
155 aa  138  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  44.76 
 
 
158 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  46.26 
 
 
175 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  45.52 
 
 
175 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  45.45 
 
 
169 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 
159 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  48.25 
 
 
154 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  46.94 
 
 
155 aa  137  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  44.08 
 
 
165 aa  137  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  43.36 
 
 
154 aa  137  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  46.94 
 
 
155 aa  136  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 
152 aa  136  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  45.1 
 
 
162 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  47.55 
 
 
161 aa  136  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 
164 aa  136  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  46.9 
 
 
153 aa  136  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 
157 aa  136  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  45.1 
 
 
162 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  47.55 
 
 
161 aa  136  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  44.76 
 
 
159 aa  135  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  47.95 
 
 
156 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  43.45 
 
 
154 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
154 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  46.85 
 
 
158 aa  135  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  45.27 
 
 
157 aa  135  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  44.76 
 
 
158 aa  135  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 
165 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
154 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
154 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
158 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  45.1 
 
 
162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
158 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
158 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
158 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  44.22 
 
 
155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  44.9 
 
 
159 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  47.59 
 
 
175 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  45.58 
 
 
169 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  47.59 
 
 
175 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  47.59 
 
 
175 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  47.59 
 
 
175 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  46.9 
 
 
229 aa  134  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  45.58 
 
 
158 aa  134  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  44.83 
 
 
175 aa  134  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
169 aa  134  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  48.63 
 
 
157 aa  134  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.33 
 
 
163 aa  134  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  46.26 
 
 
175 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  46.94 
 
 
202 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  45.52 
 
 
156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  43.92 
 
 
155 aa  134  7.000000000000001e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  47.59 
 
 
229 aa  133  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  44.06 
 
 
159 aa  133  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>