199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3901 on replicon NC_009007
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009007  RSP_3901  virC1 gene, ATPase  100 
 
 		 298 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.691953  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4139  partition parA like-protein  61.6 
 
 		 241 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71144  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8214  putative crown gall tumor protein VirC1  29.15 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144693  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.42 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.67 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.67 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.63 
 
 		 232 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  26.87 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2890  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.25 
 
 		 237 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.36 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8771  chromosome partitioning ATPase  26.7 
 
 		 226 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  27.1 
 
 		 206 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  27.94 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.57 
 
 		 229 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5170  ParA protein, putative  25 
 
 		 260 aa  53.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.433255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  23.9 
 
 		 218 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1205  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.5 
 
 		 264 aa  53.1  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.2 
 
 		 215 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  25.76 
 
 		 252 aa  53.1  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0704  chromosome partitioning protein  27.34 
 
 		 224 aa  53.1  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.17 
 
 		 216 aa  52.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.44 
 
 		 213 aa  52.8  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.71 
 
 		 263 aa  52.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1770  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.02 
 
 		 297 aa  52.4  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4164  hypothetical protein  24 
 
 		 233 aa  52.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0393565  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.62 
 
 		 229 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  27.94 
 
 		 222 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  29.23 
 
 		 222 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.62 
 
 		 229 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  27.33 
 
 		 223 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0003  partition protein  24.8 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000179256  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  39.19 
 
 		 263 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.4 
 
 		 231 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  25.52 
 
 		 222 aa  51.6  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.19 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6380  hypothetical protein  25.2 
 
 		 237 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9806  chromosome partitioning protein  28.33 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.4 
 
 		 231 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.4 
 
 		 231 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.4 
 
 		 231 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.4 
 
 		 231 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.4 
 
 		 231 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0032  putative plasmid partition protein A  27.64 
 
 		 219 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0137071  normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.97 
 
 		 232 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.0000000000116025  unclonable  2.19652e-22 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.4 
 
 		 231 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.9 
 
 		 219 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.94 
 
 		 263 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.94 
 
 		 263 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.94 
 
 		 263 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.81 
 
 		 265 aa  50.4  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.94 
 
 		 262 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.94 
 
 		 263 aa  49.7  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.36 
 
 		 263 aa  50.1  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.36 
 
 		 263 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.36 
 
 		 263 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.36 
 
 		 263 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.36 
 
 		 263 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4551  hypothetical protein  27.05 
 
 		 237 aa  48.9  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.98 
 
 		 263 aa  48.9  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 		 232 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 		 232 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.77 
 
 		 212 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3896  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.9 
 
 		 222 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  26.62 
 
 		 228 aa  48.9  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.71 
 
 		 209 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3783  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.9 
 
 		 222 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0208258  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  22.87 
 
 		 209 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4704  hypothetical protein  47.62 
 
 		 460 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.155939  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.07 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.08 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  39.34 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.98 
 
 		 214 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.16 
 
 		 212 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.87 
 
 		 216 aa  47.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.62 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  38.6 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3579  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  25.26 
 
 		 227 aa  47.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.299225  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.2 
 
 		 234 aa  47  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.19 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0463481  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  28.03 
 
 		 222 aa  47  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.68 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4159  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.86 
 
 		 258 aa  46.6  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0008  plasmid partition protein A, putative  26.02 
 
 		 219 aa  46.2  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745248  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.29 
 
 		 346 aa  46.2  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.34 
 
 		 480 aa  46.2  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0272745 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1641  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.68 
 
 		 263 aa  46.6  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.26 
 
 		 220 aa  46.2  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.9 
 
 		 264 aa  46.2  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  31.71 
 
 		 259 aa  46.2  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.74 
 
 		 232 aa  46.2  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1482  ParA family protein  22.83 
 
 		 221 aa  45.8  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.184868 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3002  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  26.17 
 
 		 293 aa  45.8  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.69 
 
 		 211 aa  45.8  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3515  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.89 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.09 
 
 		 226 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.47 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  30.23 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02865  putative ParA family protein  42.55 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.827974  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.88 
 
 		 268 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.72 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>